147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_89153 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_89153  predicted protein  100 
 
 
505 aa  1048    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.421535  hitchhiker  0.00000970185 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07530  57.7 kda trp-asp repeats containing protein, putative  33.91 
 
 
523 aa  288  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.585793  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04648  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit Utp15, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01780)  32.6 
 
 
541 aa  258  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_2239  predicted protein  28.95 
 
 
514 aa  167  5e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0895904 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43713  predicted protein  24.9 
 
 
609 aa  118  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.116961  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.14 
 
 
1652 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.66 
 
 
1363 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  22.89 
 
 
1364 aa  71.6  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.91 
 
 
696 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 
1196 aa  63.5  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  23.83 
 
 
1474 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.21 
 
 
1163 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.78 
 
 
833 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  27.31 
 
 
1831 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
1557 aa  61.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.64 
 
 
1221 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.5 
 
 
1807 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25.63 
 
 
1188 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  23.11 
 
 
1193 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.56 
 
 
947 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  30.14 
 
 
1355 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29212  predicted protein  23.86 
 
 
317 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0401861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.38 
 
 
930 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  27.41 
 
 
1878 aa  57.8  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.64 
 
 
676 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  24.34 
 
 
1214 aa  57  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.12 
 
 
865 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  26.64 
 
 
317 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05972  Coatomer subunit beta', putative (Eurofung)  24.23 
 
 
853 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.296123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  24.92 
 
 
1357 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  22.73 
 
 
790 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.62 
 
 
576 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  23.05 
 
 
1901 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  30.97 
 
 
954 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  25.98 
 
 
335 aa  55.1  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  25.16 
 
 
1411 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.35 
 
 
1481 aa  54.3  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.79 
 
 
664 aa  54.3  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.91 
 
 
1760 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.52 
 
 
698 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.05 
 
 
1262 aa  53.9  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  25.47 
 
 
464 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.26 
 
 
1553 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  22.3 
 
 
1510 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  24.37 
 
 
1311 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  25.32 
 
 
1344 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  23.57 
 
 
1491 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87280  predicted protein  24.42 
 
 
1204 aa  52.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0864133  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26050  predicted protein  20.85 
 
 
299 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.421608  normal  0.813084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.75 
 
 
757 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21929  predicted protein  26.35 
 
 
1270 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  27.32 
 
 
1213 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48258  predicted protein  26.83 
 
 
402 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.011279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.58 
 
 
919 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  28.05 
 
 
335 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  21.8 
 
 
687 aa  51.6  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.08 
 
 
677 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  24 
 
 
344 aa  52  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.89 
 
 
630 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.19 
 
 
1398 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  28.93 
 
 
1026 aa  50.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  23.31 
 
 
914 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  25.97 
 
 
316 aa  51.2  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.7 
 
 
806 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  24.77 
 
 
1443 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  26.62 
 
 
1217 aa  50.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.33 
 
 
1856 aa  50.4  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  26.22 
 
 
577 aa  50.1  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03300  microtubule binding protein, putative  30.3 
 
 
694 aa  50.1  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  21.77 
 
 
1097 aa  50.1  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  24.39 
 
 
1399 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.48 
 
 
1617 aa  50.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  21.3 
 
 
1454 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.28 
 
 
1267 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34219  predicted protein  24.38 
 
 
364 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.665929 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04518  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03080)  28.65 
 
 
1289 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.23 
 
 
1711 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.3 
 
 
622 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.78 
 
 
792 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  20.82 
 
 
1236 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77338  predicted protein  23.11 
 
 
922 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98376  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.13 
 
 
1004 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.92 
 
 
682 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.4 
 
 
434 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  26.7 
 
 
1657 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.22 
 
 
675 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63551  predicted protein  31.93 
 
 
522 aa  48.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50593  predicted protein  22.88 
 
 
617 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.594901  normal  0.592668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  28.24 
 
 
1334 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  22.91 
 
 
652 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  22.63 
 
 
742 aa  48.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  23.98 
 
 
1280 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  20.44 
 
 
1868 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  26.32 
 
 
1348 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  25.11 
 
 
1209 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03026  Coatomer alpha subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59946]  26.61 
 
 
1205 aa  47.4  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.107466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.35 
 
 
1686 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  24.68 
 
 
1367 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  22.62 
 
 
443 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  21.18 
 
 
578 aa  47.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>