More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_47614 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_47614  predicted protein  100 
 
 
443 aa  920    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.80881  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04110  AAA family ATPase, putative  49.39 
 
 
516 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03131  mitochondrial chaperone BCS1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13000)  50.33 
 
 
497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.011149  normal  0.228986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2241  AAA ATPase  31.43 
 
 
415 aa  166  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.85938 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07549  BCS1-like ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14760)  30.88 
 
 
650 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.543729  hitchhiker  0.000156969 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06397  conserved hypothetical protein  31.6 
 
 
518 aa  150  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0341883 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32455  predicted protein  34.04 
 
 
353 aa  129  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0900951  normal  0.127323 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1335  ATPase central domain-containing protein  30.74 
 
 
392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1346  ATPase central domain-containing protein  30.74 
 
 
294 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0648  ATPase central domain-containing protein  32.28 
 
 
392 aa  117  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1372  ATPase central domain-containing protein  30.04 
 
 
392 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.776421  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3012  AAA ATPase central domain protein  30.39 
 
 
392 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0560147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1267  ATPase central domain-containing protein  29.93 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2812  ATPase central domain-containing protein  28.27 
 
 
392 aa  103  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2075  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35 
 
 
621 aa  93.6  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000894512  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1832  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.44 
 
 
623 aa  93.2  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.99 
 
 
714 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0432  Microtubule-severing ATPase  32.46 
 
 
734 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0369558  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.15 
 
 
666 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.94 
 
 
662 aa  88.2  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14251  cell division protein FtsH3  33.51 
 
 
620 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.520813  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34520  AAA+ family ATPase  30.69 
 
 
747 aa  87.4  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0185945  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  34.32 
 
 
706 aa  87.4  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  32.43 
 
 
629 aa  87.4  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  30.89 
 
 
627 aa  87  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.95 
 
 
650 aa  87.4  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.997433  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0472  AAA family ATPase  33.33 
 
 
366 aa  87  6e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0845041  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14631  cell division protein FtsH3  32.97 
 
 
620 aa  87  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336719  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.37 
 
 
781 aa  87  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1358  cell division protein FtsH3  32.97 
 
 
620 aa  86.7  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  35.26 
 
 
694 aa  86.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.73 
 
 
651 aa  86.7  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  28.33 
 
 
646 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.52 
 
 
699 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.05 
 
 
801 aa  86.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  32.43 
 
 
625 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.15 
 
 
617 aa  85.9  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  33.53 
 
 
783 aa  85.1  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.74 
 
 
653 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.85 
 
 
750 aa  85.5  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  31.69 
 
 
760 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  34.68 
 
 
699 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  32.43 
 
 
620 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  32.43 
 
 
619 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.8 
 
 
738 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.69 
 
 
646 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.89 
 
 
623 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.4 
 
 
610 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.69 
 
 
646 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  34.3 
 
 
697 aa  84.7  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.84 
 
 
794 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09061  cell division protein FtsH4  34.62 
 
 
577 aa  84.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0625866  hitchhiker  0.0000226946 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.55 
 
 
621 aa  84.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.81 
 
 
601 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.81 
 
 
601 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.54 
 
 
625 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.77 
 
 
615 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.1 
 
 
697 aa  84  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  34.81 
 
 
641 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  30.16 
 
 
783 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  30.16 
 
 
783 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1180  cell division protein FtsH  31.03 
 
 
617 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  31.87 
 
 
682 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.14 
 
 
618 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.33 
 
 
743 aa  83.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  30.88 
 
 
623 aa  83.6  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.18 
 
 
671 aa  83.6  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  30.43 
 
 
713 aa  83.6  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16831  cell division protein FtsH3  31.91 
 
 
635 aa  83.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.54 
 
 
610 aa  83.2  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1438  ATPase central domain-containing protein  30 
 
 
416 aa  83.2  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4762  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.85 
 
 
691 aa  83.2  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  29.47 
 
 
638 aa  83.2  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  32.07 
 
 
624 aa  83.2  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.87 
 
 
793 aa  83.2  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  35.26 
 
 
784 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.95 
 
 
687 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.18 
 
 
669 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.14 
 
 
685 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0925  FtsH-2 peptidase  32.07 
 
 
624 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0155  vesicle-fusing ATPase  29.27 
 
 
729 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.1 
 
 
694 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.58 
 
 
640 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7198  Microtubule-severing ATPase  33.96 
 
 
663 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0849577  normal  0.0429658 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  30.87 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0583  vesicle-fusing ATPase  32.91 
 
 
741 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.18 
 
 
671 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.77 
 
 
677 aa  81.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00158  cell division protease FtsH  31.25 
 
 
646 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  31.09 
 
 
702 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  30.77 
 
 
637 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.41 
 
 
706 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.22 
 
 
616 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  29.1 
 
 
784 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.87 
 
 
599 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.18 
 
 
607 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.07 
 
 
673 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  31.32 
 
 
654 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  31.61 
 
 
681 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0749  vesicle-fusing ATPase  30.2 
 
 
742 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>