More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0987 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  100 
 
 
414 aa  847    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  45.43 
 
 
427 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  42.61 
 
 
417 aa  340  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  36.26 
 
 
455 aa  309  5e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  38.63 
 
 
457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 
381 aa  209  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4606  response regulator receiver protein  31.82 
 
 
408 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 
347 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  30.1 
 
 
398 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  31.66 
 
 
399 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  31.66 
 
 
399 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  30.32 
 
 
405 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  31.12 
 
 
405 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  27.2 
 
 
405 aa  152  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  54.33 
 
 
347 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  29.18 
 
 
394 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  53.85 
 
 
345 aa  138  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  25.84 
 
 
412 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1421  response regulator receiver protein  27.79 
 
 
384 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0650838  normal  0.210106 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  25.27 
 
 
421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4284  response regulator receiver protein  27.03 
 
 
391 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4344  response regulator receiver protein  27.03 
 
 
391 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0880263  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  27.14 
 
 
398 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  26.76 
 
 
382 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  44.07 
 
 
161 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  44.92 
 
 
165 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  44.92 
 
 
152 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  25.42 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  45.3 
 
 
130 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  44.25 
 
 
131 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  45.54 
 
 
423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  45.54 
 
 
423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  42.24 
 
 
125 aa  114  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  46.02 
 
 
132 aa  114  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  43.59 
 
 
133 aa  113  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  42.24 
 
 
125 aa  113  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3774  response regulator receiver protein  48.08 
 
 
123 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  45.87 
 
 
129 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  42.48 
 
 
137 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  36.43 
 
 
147 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  42.37 
 
 
167 aa  109  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  45.13 
 
 
117 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  43.59 
 
 
138 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  41.38 
 
 
135 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  40.48 
 
 
143 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  44.25 
 
 
135 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  39.32 
 
 
145 aa  109  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  43.59 
 
 
138 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  44.25 
 
 
135 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  44.25 
 
 
135 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  39.82 
 
 
141 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  34.97 
 
 
160 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  42.24 
 
 
138 aa  108  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  41.88 
 
 
179 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  43.36 
 
 
136 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  43.36 
 
 
136 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  43.36 
 
 
136 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  40.52 
 
 
130 aa  107  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  42.48 
 
 
134 aa  106  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  40.71 
 
 
133 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  41.59 
 
 
133 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  41.59 
 
 
133 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  38.33 
 
 
132 aa  106  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  41.59 
 
 
133 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  41.59 
 
 
135 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  40.71 
 
 
133 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  35.38 
 
 
136 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
144 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  37.07 
 
 
132 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
132 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  35.34 
 
 
132 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  34.48 
 
 
130 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  24.12 
 
 
396 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  24.12 
 
 
396 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  34.48 
 
 
130 aa  99  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  28.8 
 
 
1834 aa  98.2  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  33.57 
 
 
2301 aa  96.3  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
2539 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
1725 aa  94.7  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
2212 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
503 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
1725 aa  94.7  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35 
 
 
1177 aa  94  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 
1832 aa  93.2  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  36.84 
 
 
2301 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
1629 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  35.4 
 
 
123 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  42.48 
 
 
1128 aa  90.9  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  38.94 
 
 
123 aa  90.9  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
384 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00677544 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
1609 aa  90.5  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
1907 aa  90.1  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
383 aa  90.1  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 
272 aa  90.1  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  38.39 
 
 
2284 aa  90.1  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  33.83 
 
 
2476 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  39.45 
 
 
246 aa  89.7  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 
234 aa  89.7  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5086  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.29 
 
 
465 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 
232 aa  89.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>