More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0894 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4060  putative inner membrane protein translocase component YidC  84.74 
 
 
379 aa  666    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4099  putative inner membrane protein translocase component YidC  84.74 
 
 
379 aa  666    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0894  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 
381 aa  771    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4710  putative inner membrane protein translocase component YidC  69.63 
 
 
382 aa  547  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.620699  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3435  putative inner membrane protein translocase component YidC  66.49 
 
 
380 aa  541  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98769  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0687  YidC/Oxa1 family lipolytic protein  65.01 
 
 
383 aa  526  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.852164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5265  putative inner membrane protein translocase component YidC  60.71 
 
 
396 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.0483383 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1617  putative inner membrane protein translocase component YidC  63.29 
 
 
392 aa  511  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.281889 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0577  putative inner membrane protein translocase component YidC  57.52 
 
 
376 aa  435  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06091  putative inner membrane protein translocase component YidC  57.78 
 
 
377 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0805  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.43 
 
 
382 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.792706  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1787  putative inner membrane protein translocase component YidC  55.09 
 
 
380 aa  431  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.169669  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16601  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.69 
 
 
382 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0685745  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13791  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.4 
 
 
380 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.429072  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13581  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.54 
 
 
379 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.13065  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1287  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.4 
 
 
380 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.495694  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12731  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.55 
 
 
383 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483232 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13871  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.93 
 
 
380 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0838115  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  44.12 
 
 
225 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  44.35 
 
 
587 aa  102  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  41.94 
 
 
584 aa  101  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  44.44 
 
 
268 aa  99.8  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  40.32 
 
 
585 aa  96.7  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.76 
 
 
533 aa  96.3  7e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.38 
 
 
544 aa  95.9  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2740  protein translocase subunit yidC  42.74 
 
 
579 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  40.32 
 
 
583 aa  94.4  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.84 
 
 
541 aa  94.4  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  43.12 
 
 
607 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.74 
 
 
600 aa  94  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.61 
 
 
530 aa  94  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  40.32 
 
 
583 aa  93.6  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  45.45 
 
 
217 aa  93.6  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  36.29 
 
 
584 aa  93.2  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.98 
 
 
543 aa  92.8  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.98 
 
 
544 aa  92.8  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.46 
 
 
526 aa  92.8  9e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  50 
 
 
341 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.66 
 
 
518 aa  92.4  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.48 
 
 
584 aa  92  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.21 
 
 
543 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.22 
 
 
553 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.75 
 
 
530 aa  91.3  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28520  preprotein translocase subunit YidC  42.59 
 
 
257 aa  91.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000336467  hitchhiker  0.00141204 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  41.67 
 
 
257 aa  91.7  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.75 
 
 
528 aa  91.3  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.01 
 
 
554 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.01 
 
 
554 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.16 
 
 
607 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.79 
 
 
517 aa  90.9  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  49.5 
 
 
229 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.21 
 
 
543 aa  90.5  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  35.9 
 
 
543 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0131  60 kDa inner membrane insertion protein  43.75 
 
 
459 aa  90.5  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.88 
 
 
577 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  36.72 
 
 
559 aa  90.1  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  36.67 
 
 
553 aa  90.1  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.79 
 
 
531 aa  90.1  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.21 
 
 
548 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.21 
 
 
548 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.21 
 
 
548 aa  89.7  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.21 
 
 
548 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  35 
 
 
548 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.21 
 
 
548 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.5 
 
 
575 aa  89.7  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.21 
 
 
548 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.01 
 
 
555 aa  89.7  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  39.47 
 
 
628 aa  89.4  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.16 
 
 
610 aa  89.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.16 
 
 
597 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.16 
 
 
610 aa  89.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.21 
 
 
545 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  39.06 
 
 
556 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_002620  TC0522  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.45 
 
 
787 aa  88.2  2e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.06 
 
 
540 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  36.72 
 
 
614 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  35.16 
 
 
547 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.72 
 
 
546 aa  88.6  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  37.5 
 
 
552 aa  88.6  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.72 
 
 
546 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.72 
 
 
546 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1631  60 kDa inner membrane insertion protein  44.07 
 
 
433 aa  88.2  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.22695  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
539 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.22 
 
 
555 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  39.06 
 
 
540 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  39.06 
 
 
609 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  37.21 
 
 
548 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  37.21 
 
 
548 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.21 
 
 
548 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.21 
 
 
548 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.21 
 
 
548 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.21 
 
 
548 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.38 
 
 
609 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.21 
 
 
548 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  37.21 
 
 
548 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  42.99 
 
 
261 aa  87.8  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  39.81 
 
 
209 aa  87  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.21 
 
 
548 aa  87  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2314  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.16 
 
 
565 aa  86.7  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.94 
 
 
632 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>