68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3191 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  100 
 
 		 697 aa  1418    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  65.79 
 
 		 473 aa  431  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  64.91 
 
 		 540 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  64.91 
 
 		 540 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  68.25 
 
 		 399 aa  364  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  79.34 
 
 		 401 aa  346  8.999999999999999e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  66.3 
 
 		 588 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  55.71 
 
 		 498 aa  336  7e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  55.62 
 
 		 485 aa  336  9e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  73.25 
 
 		 646 aa  329  8e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  69.86 
 
 		 419 aa  311  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  60.74 
 
 		 561 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  62.41 
 
 		 557 aa  300  7e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  75.56 
 
 		 340 aa  286  9e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  75.56 
 
 		 479 aa  286  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  61.75 
 
 		 371 aa  275  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  83.97 
 
 		 660 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  72.04 
 
 		 621 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  54.41 
 
 		 452 aa  265  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  75.56 
 
 		 462 aa  257  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  67.38 
 
 		 689 aa  256  8e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  59.53 
 
 		 399 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  39.82 
 
 		 570 aa  246  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  54.33 
 
 		 673 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  40 
 
 		 583 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  56 
 
 		 689 aa  194  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  61.59 
 
 		 714 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  47.46 
 
 		 682 aa  186  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  56.41 
 
 		 504 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  55.06 
 
 		 554 aa  180  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  55.13 
 
 		 554 aa  179  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  40.72 
 
 		 493 aa  165  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  40.72 
 
 		 552 aa  163  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  41.18 
 
 		 581 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  55.56 
 
 		 580 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  43.32 
 
 		 280 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  52.6 
 
 		 1007 aa  140  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  45.86 
 
 		 691 aa  133  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  39.2 
 
 		 242 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1039  hypothetical protein  44.79 
 
 		 304 aa  132  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3650  Phage-related tail fibre protein-like protein  43.42 
 
 		 251 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  40.78 
 
 		 505 aa  126  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  40.12 
 
 		 817 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  38.56 
 
 		 483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1619  tail fiber-related protein  35.98 
 
 		 205 aa  103  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0231  tail fiber protein H, putative  31.55 
 
 		 359 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218449  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2331  bacteriophage tail fiber protein  35.98 
 
 		 385 aa  95.5  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37440  Phage P2 tail fiber gpH-like protein  33.63 
 
 		 299 aa  88.2  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  39.33 
 
 		 962 aa  85.1  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  41.18 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  40.44 
 
 		 442 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  33.68 
 
 		 519 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  42.86 
 
 		 892 aa  78.2  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  35.33 
 
 		 525 aa  75.5  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2214  hypothetical protein  34.31 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0691  hypothetical protein  39.8 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6579  hypothetical protein  55.41 
 
 		 522 aa  67.8  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  54.05 
 
 		 791 aa  67.4  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  54.05 
 
 		 790 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  34.84 
 
 		 590 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2356  variable tail fibre protein  61.54 
 
 		 639 aa  61.2  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164257  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  38.97 
 
 		 805 aa  60.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  50.91 
 
 		 387 aa  57.4  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0558  hypothetical protein  58.97 
 
 		 397 aa  50.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209812  hitchhiker  0.0000583469 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3056  pyocin R2_PP, tail fiber protein, putative  33.04 
 
 		 292 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172022 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0855  hypothetical protein  41.18 
 
 		 130 aa  45.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1209  putative pyocin R2_PP, tail fiber protein  31.25 
 
 		 228 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391701 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2509  hypothetical protein  26.67 
 
 		 362 aa  44.7  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>