62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_55850 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_55850  putative pilus assembly protein  100 
 
 		 245 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4866  putative lipoprotein  81.75 
 
 		 253 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0643  hypothetical protein  43.17 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4856  TPR domain protein  43.57 
 
 		 250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4396  TPR repeat-containing protein  44.22 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0843  TPR repeat-containing protein  45.34 
 
 		 233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1637  hypothetical protein  35.33 
 
 		 252 aa  93.2  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.735654  normal  0.200173 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2157  hypothetical protein  40.23 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  0.0292686 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3659  flp pilus assembly protein  33.94 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  34.08 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1448  TPR repeat-containing protein  37.43 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1727  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000433623 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.91 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1408  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1526  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40396  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1046  tetratricopeptide TPR_2  28.46 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959559  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2793  putative lipoprotein transmembrane  35.63 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184399  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5414  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  29.53 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.53 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.99 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.99 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78139  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1948  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000693981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1285  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0393543  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1773  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0358765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1043  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1773  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0122  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000708393  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02589  lipoprotein transmembrane  29.8 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1794  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00170146  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4666  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  32.72 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988456  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  40.16 
 
 		 744 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2537  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 295 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  30.85 
 
 		 311 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  35.83 
 
 		 847 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2067  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 343 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.457723  normal  0.512607 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 762 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 1421 aa  49.3  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.38 
 
 		 1034 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 306 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  35.42 
 
 		 733 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 878 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0312  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 293 aa  45.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.542961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1106  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 371 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1660  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.67 
 
 		 370 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3102  TPR domain protein  29.41 
 
 		 389 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0131637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2970  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 364 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47174  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  33.67 
 
 		 480 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.01 
 
 		 810 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2610  tetratricopeptide TPR_2  26.76 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.104861  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.93 
 
 		 1056 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.93 
 
 		 988 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  31.37 
 
 		 299 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.49 
 
 		 725 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3982  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 603 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 795 aa  42.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  48 
 
 		 645 aa  41.6  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>