260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_18101 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 249 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  70.28 
 
 		 249 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  71.89 
 
 		 250 aa  364  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18131  rod shape-determining protein MreC  67.07 
 
 		 249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570389  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  45.45 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  44.72 
 
 		 251 aa  215  4e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  43.9 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  47.42 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01801  rod shape-determining protein MreC  44.3 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0150  rod shape-determining protein MreC  45.62 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  36.28 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  37.66 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  32.31 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  35.59 
 
 		 257 aa  134  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  33.2 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  33.2 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  28.97 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  32.73 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  30.38 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  32.29 
 
 		 274 aa  86.3  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  32.8 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 348 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  29.93 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  30.95 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  31.13 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  30.82 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 286 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  33.12 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  30.5 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  28.74 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  28.37 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  29.7 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  24.67 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  28.86 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  29.8 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  29.29 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  28.87 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  25.9 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  27.66 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  32.48 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  30.1 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  27.59 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  33.14 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  30.67 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  29.27 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  28.76 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  27.59 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  33.73 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  27.56 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  32.12 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  34.42 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  30.5 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1209  Rod shape-determining protein MreC  32.42 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0276789  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  29.22 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  27.11 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  29.45 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  26.58 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  26.51 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  27.53 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  29.22 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  35.2 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  30.06 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  34.34 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  33.76 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  26.92 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  28.48 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  31.16 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  25.49 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  31.61 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  29.22 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  26.6 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  33.54 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  29.34 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  26.6 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  25.86 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  26.6 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  30.64 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  33.13 
 
 		 283 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  33.13 
 
 		 283 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1380  rod shape-determining protein MreC  28.49 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  28.99 
 
 		 334 aa  67  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  28.08 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  28.08 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0106  Rod shape-determining protein MreC  26 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 294 aa  67  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  28.19 
 
 		 317 aa  67  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  32.47 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  32.47 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  31.08 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  29.59 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>