60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_20991 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_20991  hypothetical protein  100 
 
 
486 aa  992    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  33.12 
 
 
531 aa  117  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  33.44 
 
 
531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  33.95 
 
 
820 aa  115  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3402  neutral zinc metallopeptidase  37.55 
 
 
451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  35.59 
 
 
480 aa  106  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  33.65 
 
 
785 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  31.96 
 
 
614 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  33.88 
 
 
479 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  36.07 
 
 
476 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  33.47 
 
 
479 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  35.5 
 
 
481 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  35 
 
 
476 aa  101  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  34.31 
 
 
475 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  34.45 
 
 
474 aa  100  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  33.9 
 
 
504 aa  100  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  27.54 
 
 
490 aa  99.8  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  30.84 
 
 
478 aa  99.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  31.35 
 
 
486 aa  99  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  31.35 
 
 
1631 aa  97.4  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  30.6 
 
 
444 aa  92  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  30.6 
 
 
442 aa  92  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04541  hypothetical protein  44.36 
 
 
299 aa  90.9  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  30.35 
 
 
444 aa  88.2  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  29.53 
 
 
727 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3363  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  32.58 
 
 
468 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  29.72 
 
 
1112 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  29.34 
 
 
713 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1442  metalloprotease  32.38 
 
 
513 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.066501  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  28.74 
 
 
713 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  26.11 
 
 
606 aa  63.9  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  29.07 
 
 
1112 aa  61.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  29.17 
 
 
641 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.95 
 
 
1180 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  24.57 
 
 
648 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  39.24 
 
 
1037 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0060  peptidase, metallopeptidase  30.19 
 
 
421 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210793  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  25.3 
 
 
745 aa  50.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  32.48 
 
 
856 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  33.05 
 
 
1279 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.9 
 
 
928 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  41.27 
 
 
1895 aa  47.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  30.34 
 
 
1134 aa  47  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  28.02 
 
 
535 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  26.7 
 
 
2542 aa  46.6  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  37.97 
 
 
2885 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12801  hypothetical protein  25 
 
 
339 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.103012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  40 
 
 
2775 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  40.3 
 
 
998 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  36.05 
 
 
1839 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  37.33 
 
 
5218 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 
1286 aa  44.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  32.12 
 
 
656 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.56 
 
 
5962 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  35.29 
 
 
2097 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  27.96 
 
 
491 aa  43.9  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  36.19 
 
 
2667 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  26.38 
 
 
1133 aa  43.9  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  28.21 
 
 
572 aa  43.5  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  35.16 
 
 
1610 aa  43.5  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>