More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2806 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2806  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
434 aa  848    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2812  major facilitator superfamily MFS_1  46.57 
 
 
427 aa  342  1e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0852  major facilitator superfamily MFS_1  40.28 
 
 
438 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.207548 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  24.61 
 
 
404 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  23.82 
 
 
404 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  24.08 
 
 
414 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
392 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  24.61 
 
 
406 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  24.08 
 
 
404 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  24.08 
 
 
404 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
408 aa  100  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  24.66 
 
 
402 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  27.35 
 
 
408 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  23.58 
 
 
409 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  23.4 
 
 
399 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  25.84 
 
 
415 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  25.45 
 
 
415 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  22.13 
 
 
408 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 
404 aa  86.7  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  25.13 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  25.06 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  26.05 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  25.07 
 
 
435 aa  77  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  24.42 
 
 
413 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  23.06 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  23.21 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2625  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  23.21 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  23.21 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  26.21 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  25.75 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  26.02 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  23.01 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  23.01 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  25.07 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  26.01 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0966  major facilitator transporter  24.23 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.582345  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 
443 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  24.69 
 
 
424 aa  69.3  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  23.46 
 
 
460 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  23.39 
 
 
456 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 
446 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  24.69 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  22.69 
 
 
448 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  23.45 
 
 
422 aa  67.8  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  22.92 
 
 
455 aa  67  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  26.1 
 
 
528 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  23.88 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 
441 aa  67  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 
430 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  22.46 
 
 
426 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  23.17 
 
 
443 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  25.74 
 
 
418 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  24.13 
 
 
419 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  23.21 
 
 
455 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3599  major facilitator transporter  24.44 
 
 
435 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  23.38 
 
 
429 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  22.14 
 
 
444 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  24.87 
 
 
411 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2353  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 
436 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 
424 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 
439 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  21.43 
 
 
430 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  22.81 
 
 
463 aa  64.3  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1347  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
410 aa  64.3  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.258837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  23.66 
 
 
432 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  25.72 
 
 
404 aa  64.3  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  21.26 
 
 
451 aa  64.3  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0624  regulatory protein UhpC  24.88 
 
 
436 aa  64.3  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  21.72 
 
 
449 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 
427 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  21.21 
 
 
446 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  25 
 
 
448 aa  63.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  24.47 
 
 
414 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  23.7 
 
 
454 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  22.5 
 
 
448 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 
420 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  23.85 
 
 
427 aa  62.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  22.5 
 
 
448 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1313  major facilitator transporter  23.35 
 
 
433 aa  62.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.720769  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  22.5 
 
 
448 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0939  major facilitator transporter  25.26 
 
 
417 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.464819  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4078  regulatory protein UhpC  24.15 
 
 
443 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  22.7 
 
 
437 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0083  regulatory protein UhpC  24.15 
 
 
443 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644662  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  23.98 
 
 
411 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  21.67 
 
 
447 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  22.5 
 
 
448 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  20.43 
 
 
428 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  21.67 
 
 
447 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  21.67 
 
 
447 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  22.5 
 
 
448 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  22.5 
 
 
448 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  23.7 
 
 
454 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  22.5 
 
 
448 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  21.54 
 
 
427 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  22.81 
 
 
450 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  23.69 
 
 
430 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>