More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3446 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  100 
 
 		 399 aa  785    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  66.58 
 
 		 387 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  67.96 
 
 		 384 aa  498  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  68.04 
 
 		 390 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  66.05 
 
 		 390 aa  479  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  65.46 
 
 		 388 aa  478  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  65.81 
 
 		 418 aa  477  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  63.31 
 
 		 398 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  63.27 
 
 		 412 aa  465  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  64.01 
 
 		 401 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  62.6 
 
 		 400 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  60.61 
 
 		 422 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  61.95 
 
 		 408 aa  457  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3650  aminotransferase, class V  63.09 
 
 		 416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  61.3 
 
 		 391 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1079  aminotransferase class V  62.56 
 
 		 419 aa  443  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2105  aminotransferase, class V  61.08 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  63.33 
 
 		 401 aa  440  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  62.27 
 
 		 391 aa  439  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  61.5 
 
 		 400 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2360  Cysteine desulfurase  59.17 
 
 		 387 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.66071 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  56.86 
 
 		 412 aa  434  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  60 
 
 		 397 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  60 
 
 		 397 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3255  aminotransferase class V  59.8 
 
 		 413 aa  430  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  59.74 
 
 		 397 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  59.13 
 
 		 407 aa  430  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1213  aminotransferase, class V  64.86 
 
 		 424 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.885701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13041  cysteine desulfurase iscS  58.89 
 
 		 393 aa  418  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315275  hitchhiker  0.00290952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1106  aminotransferase class V  64.34 
 
 		 391 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2910  Cysteine desulfurase  60.1 
 
 		 401 aa  406  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1307  aminotransferase class V  59.74 
 
 		 408 aa  398  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  46.02 
 
 		 398 aa  335  9e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14810  cysteine desulfurase family protein  51.16 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  47.04 
 
 		 399 aa  329  6e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 384 aa  329  6e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  44.22 
 
 		 400 aa  328  9e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  43.15 
 
 		 392 aa  325  8.000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  42.93 
 
 		 398 aa  323  3e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  42.05 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  42.71 
 
 		 393 aa  323  4e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  42.27 
 
 		 384 aa  322  6e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  41.65 
 
 		 394 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  43.59 
 
 		 398 aa  319  6e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  44.13 
 
 		 388 aa  319  6e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  45.5 
 
 		 396 aa  317  3e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  44.47 
 
 		 409 aa  317  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.73 
 
 		 396 aa  316  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  44.39 
 
 		 388 aa  315  6e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  42.2 
 
 		 398 aa  316  6e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  42.2 
 
 		 398 aa  316  6e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  43.48 
 
 		 389 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  43.51 
 
 		 398 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  40.87 
 
 		 404 aa  310  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1361  aminotransferase class V  52.13 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  44.22 
 
 		 382 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  42.6 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  41.43 
 
 		 394 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  41.69 
 
 		 392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  45.91 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  42.2 
 
 		 392 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  41.54 
 
 		 414 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  42.05 
 
 		 402 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  43.67 
 
 		 379 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  47.06 
 
 		 393 aa  296  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  37.73 
 
 		 382 aa  296  5e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  42.42 
 
 		 396 aa  296  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  44.25 
 
 		 390 aa  295  7e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  43.04 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  42.09 
 
 		 389 aa  293  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2557  aminotransferase, class V  46.7 
 
 		 381 aa  293  5e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102305  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  43.19 
 
 		 394 aa  293  5e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  42.42 
 
 		 407 aa  292  9e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  41.86 
 
 		 383 aa  290  2e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  41.18 
 
 		 384 aa  290  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  45.31 
 
 		 385 aa  287  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  41.6 
 
 		 383 aa  286  4e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  41.69 
 
 		 391 aa  285  8e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  41.65 
 
 		 391 aa  285  8e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  41.9 
 
 		 388 aa  285  9e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  43.8 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  42.78 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  40.87 
 
 		 398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  40.36 
 
 		 393 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  40.98 
 
 		 381 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  41.37 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  42.71 
 
 		 398 aa  281  1e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  39.74 
 
 		 401 aa  280  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  40.26 
 
 		 393 aa  280  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  41.24 
 
 		 381 aa  279  6e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  41.24 
 
 		 381 aa  278  9e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  42.71 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  41.07 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  40.25 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  38.05 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  41.77 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  40.05 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  40.05 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  40.98 
 
 		 381 aa  276  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>