92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3338 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  100 
 
 		 789 aa  1596    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  55.08 
 
 		 799 aa  800    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  37.89 
 
 		 779 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  37.87 
 
 		 779 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  32.81 
 
 		 819 aa  355  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  34.61 
 
 		 816 aa  349  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  34.2 
 
 		 795 aa  343  9e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  33.54 
 
 		 778 aa  340  7e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  33.08 
 
 		 763 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  32.44 
 
 		 772 aa  336  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  37.4 
 
 		 773 aa  335  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  33.08 
 
 		 773 aa  334  5e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  32.98 
 
 		 762 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  33.33 
 
 		 795 aa  332  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  33.46 
 
 		 814 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  32.57 
 
 		 760 aa  330  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  33.59 
 
 		 795 aa  330  8e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  33.42 
 
 		 779 aa  328  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  33.64 
 
 		 805 aa  327  6e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  33.71 
 
 		 842 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  33.5 
 
 		 770 aa  325  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  32.41 
 
 		 737 aa  322  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  32.7 
 
 		 769 aa  320  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  32.43 
 
 		 804 aa  310  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  29.98 
 
 		 855 aa  283  9e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  28.91 
 
 		 854 aa  270  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  29.89 
 
 		 855 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  29.51 
 
 		 855 aa  267  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  28.79 
 
 		 854 aa  267  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.76 
 
 		 855 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  28.59 
 
 		 854 aa  265  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  31.56 
 
 		 824 aa  264  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  29.06 
 
 		 793 aa  262  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  28.75 
 
 		 841 aa  260  6e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  28.66 
 
 		 860 aa  258  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  28.22 
 
 		 852 aa  251  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  22.88 
 
 		 725 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  21.14 
 
 		 708 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  20.87 
 
 		 674 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  25.83 
 
 		 718 aa  97.4  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  27.07 
 
 		 712 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.31 
 
 		 694 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  22.68 
 
 		 701 aa  75.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  22.05 
 
 		 724 aa  67.8  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  24.93 
 
 		 818 aa  66.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  24.82 
 
 		 787 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  24.2 
 
 		 788 aa  64.3  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  24.11 
 
 		 788 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  25.47 
 
 		 792 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  24.59 
 
 		 787 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  24.65 
 
 		 795 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  26.17 
 
 		 813 aa  58.2  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  24.48 
 
 		 795 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  24.13 
 
 		 810 aa  57.8  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4469  peptidase S45 penicillin amidase  21.55 
 
 		 738 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.767372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  24.53 
 
 		 821 aa  55.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  24.25 
 
 		 809 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0200  peptidase S45 penicillin amidase  25.77 
 
 		 742 aa  54.3  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  23.37 
 
 		 811 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  27.41 
 
 		 762 aa  52.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  24.49 
 
 		 818 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  24.37 
 
 		 809 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  22.91 
 
 		 812 aa  52.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4037  peptidase S45 penicillin amidase  25.64 
 
 		 947 aa  51.6  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3892  penicillin amidase  25.1 
 
 		 947 aa  51.6  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  26.22 
 
 		 761 aa  51.2  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  22.29 
 
 		 848 aa  50.8  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  23.39 
 
 		 829 aa  50.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3996  peptidase S45 penicillin amidase  24.08 
 
 		 947 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0961  penicillin amidase  34.31 
 
 		 804 aa  49.7  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  25.24 
 
 		 808 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1767  Penicillin amidase  38.03 
 
 		 963 aa  48.5  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.439064  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  25 
 
 		 795 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  23.7 
 
 		 810 aa  48.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  21.26 
 
 		 847 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  20.97 
 
 		 847 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  24.57 
 
 		 795 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  28.09 
 
 		 857 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  27.09 
 
 		 833 aa  47.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  25.74 
 
 		 809 aa  46.6  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  24.37 
 
 		 819 aa  46.6  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  24.49 
 
 		 819 aa  46.6  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  35.05 
 
 		 785 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  21.27 
 
 		 837 aa  46.6  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.89 
 
 		 796 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  33.93 
 
 		 841 aa  45.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  26.29 
 
 		 803 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  37.84 
 
 		 872 aa  45.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  24.63 
 
 		 847 aa  44.3  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3458  penicillin amidase  24.45 
 
 		 694 aa  44.3  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  35.19 
 
 		 792 aa  44.3  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.05 
 
 		 796 aa  44.3  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>