200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3458 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2745  penicillin amidase  65.62 
 
 		 692 aa  774    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155883  decreased coverage  0.00157811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3272  Penicillin amidase  52.48 
 
 		 698 aa  650    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2556  penicillin amidase  64.28 
 
 		 702 aa  785    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102799  normal  0.386886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3458  penicillin amidase  100 
 
 		 694 aa  1355    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0200  peptidase S45 penicillin amidase  43.91 
 
 		 742 aa  451  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1800  Penicillin amidase  41.12 
 
 		 739 aa  435  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.0000000164269  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  34.29 
 
 		 761 aa  350  4e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  35.66 
 
 		 762 aa  347  5e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5851  peptidase S45 penicillin amidase  32.19 
 
 		 724 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390713  normal  0.0954334 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  28.87 
 
 		 817 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  29.48 
 
 		 769 aa  207  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  26.13 
 
 		 819 aa  202  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  26.81 
 
 		 783 aa  197  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  28.86 
 
 		 809 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  25.59 
 
 		 819 aa  195  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  31.81 
 
 		 827 aa  196  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  28.11 
 
 		 796 aa  194  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  28.11 
 
 		 796 aa  193  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.91 
 
 		 796 aa  193  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  27.38 
 
 		 829 aa  193  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  28.61 
 
 		 770 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.11 
 
 		 796 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.91 
 
 		 796 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.91 
 
 		 796 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.11 
 
 		 796 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.84 
 
 		 796 aa  191  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.77 
 
 		 796 aa  189  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  28.89 
 
 		 809 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  28.52 
 
 		 827 aa  188  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  26.37 
 
 		 804 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  24.54 
 
 		 821 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  26.84 
 
 		 796 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  28.94 
 
 		 813 aa  180  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  25.67 
 
 		 847 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  25.96 
 
 		 847 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  26.94 
 
 		 821 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  25.65 
 
 		 810 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  28.93 
 
 		 818 aa  173  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  26.81 
 
 		 779 aa  170  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  27.68 
 
 		 803 aa  170  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  27.18 
 
 		 822 aa  168  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  24.87 
 
 		 816 aa  165  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  29.49 
 
 		 821 aa  165  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  26.5 
 
 		 837 aa  161  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  23.4 
 
 		 810 aa  161  4e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  28.75 
 
 		 855 aa  160  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  29.01 
 
 		 787 aa  159  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  26.77 
 
 		 809 aa  158  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  26.77 
 
 		 809 aa  158  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  23.85 
 
 		 818 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  24.26 
 
 		 824 aa  156  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  25.9 
 
 		 839 aa  154  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  24.45 
 
 		 824 aa  154  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  26.47 
 
 		 843 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  25.27 
 
 		 774 aa  152  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  29.33 
 
 		 870 aa  151  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  22.35 
 
 		 811 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  31.22 
 
 		 864 aa  151  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  26.25 
 
 		 823 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  26.25 
 
 		 823 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  30.18 
 
 		 856 aa  148  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  27.88 
 
 		 857 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  29.29 
 
 		 858 aa  147  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1137  penicillin amidase  25.94 
 
 		 813 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.416343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  25.52 
 
 		 821 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  28.72 
 
 		 854 aa  144  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  23.26 
 
 		 780 aa  143  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  28.5 
 
 		 903 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  23.68 
 
 		 848 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30580  penicilin amidase  28.35 
 
 		 898 aa  142  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0787437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  25.55 
 
 		 829 aa  141  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4305  penicillin amidase  25.81 
 
 		 813 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1147  penicillin amidase  25.13 
 
 		 813 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1108  acylase  25.59 
 
 		 813 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77464  normal  0.714706 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4002  penicillin amidase  28.33 
 
 		 818 aa  138  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  27.39 
 
 		 806 aa  138  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  25 
 
 		 823 aa  137  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  25.39 
 
 		 795 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  30.9 
 
 		 872 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  28.52 
 
 		 854 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  26.03 
 
 		 827 aa  134  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  22.83 
 
 		 807 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  29.03 
 
 		 844 aa  132  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  25.7 
 
 		 782 aa  131  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  24.94 
 
 		 795 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  29.62 
 
 		 847 aa  127  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  29.36 
 
 		 812 aa  126  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  27.36 
 
 		 889 aa  125  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  31.01 
 
 		 906 aa  124  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  31.27 
 
 		 789 aa  121  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  24.26 
 
 		 826 aa  120  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1588  penicillin amidase  25.04 
 
 		 693 aa  120  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0427638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  24.7 
 
 		 787 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  25.66 
 
 		 786 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  27.31 
 
 		 641 aa  117  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0806  penicillin amidase family protein  26.12 
 
 		 802 aa  117  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0950  peptidase S45 penicillin amidase  26.12 
 
 		 759 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.841423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  25.1 
 
 		 792 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  25.2 
 
 		 795 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2114  penicillin acylase-like protein  27.47 
 
 		 774 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>