More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3016 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3016  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  530  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  71.32 
 
 		 290 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  73.31 
 
 		 257 aa  368  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  72.51 
 
 		 279 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  69.69 
 
 		 284 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  72.15 
 
 		 286 aa  362  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  72.46 
 
 		 256 aa  362  4e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  65.79 
 
 		 280 aa  351  8e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  72.61 
 
 		 271 aa  349  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  67.33 
 
 		 289 aa  348  4e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  52.59 
 
 		 247 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  54.94 
 
 		 243 aa  255  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  54.08 
 
 		 235 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0815  ATPase  53.65 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3969  ABC transporter related protein  53.02 
 
 		 249 aa  249  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  51.26 
 
 		 277 aa  248  8e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  51.52 
 
 		 276 aa  245  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  51.08 
 
 		 237 aa  244  8e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  52.54 
 
 		 245 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  53.45 
 
 		 242 aa  241  6e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  51.29 
 
 		 245 aa  241  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  50.43 
 
 		 236 aa  240  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.22 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  50.22 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  52.07 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3135  ABC transporter related  53.45 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0745  ABC transporter related  53.02 
 
 		 245 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0716  ABC transporter related  53.02 
 
 		 245 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1737  ABC transporter related protein  52.79 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3089  ABC transporter related protein  52.36 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2917  ABC transporter related  43.64 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2095  ABC transporter related  50.64 
 
 		 276 aa  209  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.156364  normal  0.0133806 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  45.98 
 
 		 235 aa  208  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  48.18 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  46.84 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  44.59 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  45.81 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  46.35 
 
 		 233 aa  202  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  45.3 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  46.82 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  46.61 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  44.49 
 
 		 237 aa  202  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  47.09 
 
 		 233 aa  201  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0600  ABC transporter related  47.21 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  43.9 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  45.7 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  42.49 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  44.58 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  43.93 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1980  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  43.72 
 
 		 240 aa  198  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.681741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  43.17 
 
 		 235 aa  198  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  47.22 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  47.22 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  46.4 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  43.89 
 
 		 237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2873  ABC transporter related  45.09 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296726  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6245  ABC transporter related  49.35 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.34 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.34 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  43.64 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  45.7 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  44.8 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.34 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6414  ABC transporter related  49.35 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0209306  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  43.89 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.34 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6647  ABC transporter related  49.35 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0490  ABC transporter related  46.19 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0438645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.34 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1566  ABC transporter related  44.68 
 
 		 234 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  45.7 
 
 		 242 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  43.23 
 
 		 235 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  45.5 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  43.89 
 
 		 238 aa  195  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  43.89 
 
 		 238 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.44 
 
 		 238 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  43.89 
 
 		 238 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.11 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.11 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.11 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  43.89 
 
 		 238 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.11 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.11 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  43.44 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  43.86 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  45.7 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  42.17 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  43.44 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  43.44 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1826  ABC transporter related  45.02 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.514017  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  46.15 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  44.02 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  44.84 
 
 		 239 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  44.14 
 
 		 247 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  44.14 
 
 		 247 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>