More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1812 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  48.07 
 
 		 710 aa  638    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  50.81 
 
 		 706 aa  689    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  51.87 
 
 		 711 aa  709    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  52.2 
 
 		 730 aa  728    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  49.23 
 
 		 721 aa  677    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  50.22 
 
 		 721 aa  662    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  51.72 
 
 		 711 aa  708    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  55.93 
 
 		 709 aa  737    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  51.63 
 
 		 720 aa  697    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  53.93 
 
 		 706 aa  723    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  51.63 
 
 		 704 aa  706    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  50.58 
 
 		 1537 aa  692    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  51.64 
 
 		 707 aa  713    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  49.15 
 
 		 714 aa  679    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  49.51 
 
 		 726 aa  700    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  51.76 
 
 		 720 aa  684    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  49.72 
 
 		 712 aa  669    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  51.48 
 
 		 706 aa  706    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  49.22 
 
 		 721 aa  680    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  52.41 
 
 		 701 aa  720    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  50.63 
 
 		 701 aa  654    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  48.6 
 
 		 715 aa  681    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  49.37 
 
 		 718 aa  700    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  48.73 
 
 		 708 aa  692    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  52.02 
 
 		 720 aa  731    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  50.57 
 
 		 701 aa  700    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  51.19 
 
 		 729 aa  648    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  51.48 
 
 		 701 aa  702    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  50.49 
 
 		 712 aa  672    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  47.84 
 
 		 776 aa  698    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  48.55 
 
 		 720 aa  684    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  48.32 
 
 		 712 aa  648    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  48.66 
 
 		 722 aa  671    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  50.29 
 
 		 719 aa  654    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  49.72 
 
 		 712 aa  668    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  54.37 
 
 		 703 aa  692    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  50.35 
 
 		 708 aa  669    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  49.5 
 
 		 727 aa  666    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  48.55 
 
 		 722 aa  684    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  49.15 
 
 		 714 aa  679    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  51.8 
 
 		 715 aa  660    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  51.39 
 
 		 722 aa  670    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  46.31 
 
 		 708 aa  635    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  48.45 
 
 		 711 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  51.69 
 
 		 711 aa  685    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  50.37 
 
 		 713 aa  672    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  48.31 
 
 		 707 aa  696    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  53.02 
 
 		 709 aa  689    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  50.82 
 
 		 717 aa  648    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  54.57 
 
 		 710 aa  691    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  51.77 
 
 		 751 aa  731    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  49.65 
 
 		 720 aa  683    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  50.07 
 
 		 752 aa  700    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  56.23 
 
 		 700 aa  761    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  53.12 
 
 		 712 aa  734    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  49.56 
 
 		 709 aa  677    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  50.83 
 
 		 733 aa  706    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 718 aa  1463    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  48.55 
 
 		 720 aa  684    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  49.15 
 
 		 714 aa  679    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  50.85 
 
 		 710 aa  716    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  48.96 
 
 		 714 aa  682    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  49.79 
 
 		 723 aa  707    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  51.41 
 
 		 779 aa  701    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  48.94 
 
 		 721 aa  667    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  49.7 
 
 		 714 aa  632  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  50.23 
 
 		 727 aa  633  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  49.93 
 
 		 720 aa  628  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  47.75 
 
 		 701 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  49.85 
 
 		 720 aa  626  1e-178  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  48.66 
 
 		 1464 aa  626  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3835  glycogen debranching enzyme GlgX  51 
 
 		 673 aa  625  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.124257  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  47.63 
 
 		 704 aa  623  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  47.75 
 
 		 727 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  47.09 
 
 		 716 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  43.92 
 
 		 718 aa  613  9.999999999999999e-175  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  47.75 
 
 		 717 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  47.59 
 
 		 727 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3037  glycogen debranching enzyme GlgX  43.59 
 
 		 730 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  47.16 
 
 		 716 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  46.94 
 
 		 845 aa  614  9.999999999999999e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3083  glycogen debranching enzyme GlgX  44.46 
 
 		 730 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  47.6 
 
 		 717 aa  612  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2010  glycogen debranching enzyme GlgX  45.43 
 
 		 788 aa  612  1e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3665  glycogen debranching protein GlgX  45.31 
 
 		 830 aa  611  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  47.27 
 
 		 733 aa  611  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  46.87 
 
 		 717 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  47.67 
 
 		 719 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  48.89 
 
 		 756 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3733  glycogen debranching enzyme GlgX  47.38 
 
 		 733 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.635331  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  47.16 
 
 		 717 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  46.73 
 
 		 719 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  47.08 
 
 		 779 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  47.19 
 
 		 728 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  46.19 
 
 		 755 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  47.7 
 
 		 745 aa  600  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  46.12 
 
 		 758 aa  600  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  46.12 
 
 		 758 aa  600  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  48.63 
 
 		 757 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3793  glycogen debranching enzyme GlgX  48.79 
 
 		 717 aa  598  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>