188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1351 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1351  oligoribonuclease  100 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24870  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  62.44 
 
 		 220 aa  278  5e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.82834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2185  oligoribonuclease  66.49 
 
 		 208 aa  277  8e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000203098 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1083  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  69.4 
 
 		 212 aa  270  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00161655  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1649  oligoribonuclease  64.43 
 
 		 269 aa  270  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.554791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0564  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  59.73 
 
 		 216 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.686303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2435  oligoribonuclease  64.4 
 
 		 211 aa  269  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1343  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  67.93 
 
 		 229 aa  267  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.801458  hitchhiker  0.000880887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1254  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  65.59 
 
 		 204 aa  263  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2269  oligoribonuclease  64.86 
 
 		 213 aa  261  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5970  oligoribonuclease  69.39 
 
 		 213 aa  260  8.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7676  putative oligoribonuclease; K01175  63.02 
 
 		 200 aa  260  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0907  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  60.29 
 
 		 222 aa  258  5.0000000000000005e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.206307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3716  oligoribonuclease  62.05 
 
 		 206 aa  258  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.952269  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2680  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  63.24 
 
 		 198 aa  256  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  57.89 
 
 		 634 aa  251  6e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5510  oligoribonuclease  63.24 
 
 		 210 aa  250  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1040  oligoribonuclease  62.83 
 
 		 250 aa  248  5e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08840  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  59.18 
 
 		 223 aa  246  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0178877  normal  0.0713087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1056  oligoribonuclease  63.35 
 
 		 208 aa  243  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0686541  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2655  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  55.2 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.785262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28650  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  62.37 
 
 		 202 aa  242  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0552434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1782  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  56.86 
 
 		 212 aa  239  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09680  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  61.17 
 
 		 208 aa  239  2.9999999999999997e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.508062  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1017  oligoribonuclease  61.54 
 
 		 196 aa  238  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1126  oligoribonuclease  62.3 
 
 		 198 aa  236  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.499716  normal  0.391456 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1900  oligoribonuclease  57.29 
 
 		 216 aa  235  3e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1339  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  61.26 
 
 		 198 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3640  oligoribonuclease  54.63 
 
 		 215 aa  231  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00635145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3713  oligoribonuclease  54.63 
 
 		 215 aa  231  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3645  oligoribonuclease  54.63 
 
 		 215 aa  231  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12533  oligoribonuclease  58.33 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2012  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  60.43 
 
 		 194 aa  229  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2543  oligoribonuclease  55.33 
 
 		 214 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4100  oligoribonuclease  54.31 
 
 		 214 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0350683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1081  exonuclease  56.38 
 
 		 235 aa  224  6e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1466  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  55.4 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1425  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  56.91 
 
 		 191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5181  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  51.7 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0633  oligoribonuclease  46.59 
 
 		 184 aa  168  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2426  oligoribonuclease  46.82 
 
 		 190 aa  168  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00920  oligoribonuclease  46.49 
 
 		 194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0529998  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2638  oligoribonuclease  47.16 
 
 		 185 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0115664  hitchhiker  0.0000000947663 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2743  oligoribonuclease  45.76 
 
 		 181 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147297  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0863  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.65 
 
 		 188 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.859258  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3335  oligoribonuclease  48.04 
 
 		 179 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.475979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2574  oligoribonuclease  46.78 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00551  oligoribonuclease  46.55 
 
 		 181 aa  159  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002252  oligoribonuclease  44.07 
 
 		 181 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000410797  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1566  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.89 
 
 		 183 aa  158  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0539  oligoribonuclease  48.86 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0907  oligoribonuclease  47.06 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0942  oligoribonuclease  44.15 
 
 		 219 aa  155  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00112  oligoribonuclease  42.94 
 
 		 181 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1847  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  43.24 
 
 		 188 aa  154  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0353601 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1959  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  43.92 
 
 		 194 aa  154  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.552747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2320  oligoribonuclease Orn  43.92 
 
 		 194 aa  154  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2776  oligoribonuclease  44.89 
 
 		 180 aa  154  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0811  oligoribonuclease  44.25 
 
 		 193 aa  154  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0543642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0591  oligoribonuclease  43.75 
 
 		 193 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0559  oligoribonuclease  45.98 
 
 		 181 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.198605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0778  oligoribonuclease  45.45 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2968  oligoribonuclease  44.51 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139128  normal  0.188792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65410  oligoribonuclease  47.13 
 
 		 180 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5680  oligoribonuclease  47.13 
 
 		 180 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2676  oligoribonuclease  44.83 
 
 		 181 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1700  oligoribonuclease  45.66 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.104292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1473  oligoribonuclease  45.71 
 
 		 183 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.777714  normal  0.355719 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1839  oligoribonuclease  47.37 
 
 		 182 aa  151  8e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0225  oligoribonuclease  47.65 
 
 		 183 aa  151  8e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0254555  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1470  oligoribonuclease  44.25 
 
 		 187 aa  151  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.255303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4950  oligoribonuclease  44.69 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1016  oligoribonuclease  43.96 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0564  oligoribonuclease  44.13 
 
 		 178 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1080  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.98 
 
 		 181 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0324  oligoribonuclease  43.58 
 
 		 195 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1276  oligoribonuclease  40.11 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0268591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0525  oligoribonuclease  41.21 
 
 		 195 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.214811  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0546  oligoribonuclease  43.18 
 
 		 193 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1552  oligoribonuclease  45.51 
 
 		 195 aa  149  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145931  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1670  oligoribonuclease  42.94 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3212  oligoribonuclease  43.68 
 
 		 181 aa  149  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1994  oligoribonuclease  48.54 
 
 		 182 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0106356  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1734  oligoribonuclease  44.94 
 
 		 195 aa  149  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0026371  normal  0.333729 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4379  oligoribonuclease  42.53 
 
 		 181 aa  148  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4192  oligoribonuclease  43.18 
 
 		 206 aa  148  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.872573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2911  oligoribonuclease  46.55 
 
 		 191 aa  147  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0790  oligoribonuclease  44.25 
 
 		 181 aa  148  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4902  oligoribonuclease  44.83 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3481  oligoribonuclease  42.05 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122162  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4778  oligoribonuclease  44.83 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0708  oligoribonuclease  46.33 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.367398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2783  oligoribonuclease  40.45 
 
 		 181 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3808  oligoribonuclease  46.33 
 
 		 181 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000372044  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1270  oligoribonuclease  45.98 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.768994  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0591  oligoribonuclease  43.68 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  hitchhiker  0.000123281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3439  oligoribonuclease  43.68 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4954  oligoribonuclease  44.25 
 
 		 180 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3661  oligoribonuclease  46.33 
 
 		 181 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474416  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3547  oligoribonuclease  42.29 
 
 		 181 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>