183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2269 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2269  oligoribonuclease  100 
 
 		 213 aa  441  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0564  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  77.51 
 
 		 216 aa  348  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.686303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7676  putative oligoribonuclease; K01175  76.41 
 
 		 200 aa  317  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2680  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  77.3 
 
 		 198 aa  304  6e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1254  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  71.89 
 
 		 204 aa  291  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1649  oligoribonuclease  67.91 
 
 		 269 aa  288  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.554791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24870  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  63.29 
 
 		 220 aa  281  5.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.82834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2655  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  60.09 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.785262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2435  oligoribonuclease  62.12 
 
 		 211 aa  270  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1351  oligoribonuclease  64.58 
 
 		 222 aa  269  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3716  oligoribonuclease  63.21 
 
 		 206 aa  268  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.952269  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2185  oligoribonuclease  63.78 
 
 		 208 aa  268  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000203098 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1083  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  68.31 
 
 		 212 aa  267  8.999999999999999e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00161655  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0907  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  58.1 
 
 		 222 aa  265  5.999999999999999e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.206307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1343  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  67.03 
 
 		 229 aa  264  7e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.801458  hitchhiker  0.000880887 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1017  oligoribonuclease  63.27 
 
 		 196 aa  257  9e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1056  oligoribonuclease  63.45 
 
 		 208 aa  256  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0686541  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1040  oligoribonuclease  63.4 
 
 		 250 aa  255  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3640  oligoribonuclease  61.73 
 
 		 215 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00635145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3713  oligoribonuclease  61.73 
 
 		 215 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3645  oligoribonuclease  61.73 
 
 		 215 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2543  oligoribonuclease  60.89 
 
 		 214 aa  255  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1782  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  60.89 
 
 		 212 aa  254  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1126  oligoribonuclease  62.89 
 
 		 198 aa  254  7e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.499716  normal  0.391456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4100  oligoribonuclease  56.94 
 
 		 214 aa  250  9.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0350683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2012  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  63.35 
 
 		 194 aa  250  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5970  oligoribonuclease  62.31 
 
 		 213 aa  248  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28650  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  63.44 
 
 		 202 aa  247  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0552434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5510  oligoribonuclease  62.5 
 
 		 210 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12533  oligoribonuclease  56.93 
 
 		 215 aa  241  6e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601507 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  57.37 
 
 		 634 aa  241  7.999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1466  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  61.05 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1425  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  63.3 
 
 		 191 aa  234  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1900  oligoribonuclease  57.73 
 
 		 216 aa  232  3e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08840  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  57.73 
 
 		 223 aa  232  4.0000000000000004e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0178877  normal  0.0713087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1339  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  60.21 
 
 		 198 aa  231  9e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09680  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  57.36 
 
 		 208 aa  227  9e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.508062  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1081  exonuclease  52.6 
 
 		 235 aa  208  4e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5181  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  50 
 
 		 187 aa  171  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0633  oligoribonuclease  48.31 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0863  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.49 
 
 		 188 aa  169  4e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.859258  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57408  predicted protein  45.86 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.241449  normal  0.12604 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2743  oligoribonuclease  46.33 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147297  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2776  oligoribonuclease  47.16 
 
 		 180 aa  157  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0539  oligoribonuclease  47.37 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2426  oligoribonuclease  46.24 
 
 		 190 aa  155  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0942  oligoribonuclease  46.24 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0564  oligoribonuclease  46.63 
 
 		 178 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3335  oligoribonuclease  44.32 
 
 		 179 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.475979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002252  oligoribonuclease  43.5 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000410797  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0811  oligoribonuclease  45.4 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0543642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5680  oligoribonuclease  47.37 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65410  oligoribonuclease  47.37 
 
 		 180 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1552  oligoribonuclease  46.63 
 
 		 195 aa  152  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145931  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00920  oligoribonuclease  44.68 
 
 		 194 aa  152  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0529998  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2676  oligoribonuclease  45.09 
 
 		 181 aa  151  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00112  oligoribonuclease  42.94 
 
 		 181 aa  151  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1734  oligoribonuclease  46.07 
 
 		 195 aa  151  8e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0026371  normal  0.333729 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4950  oligoribonuclease  45.51 
 
 		 178 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0225  oligoribonuclease  47.37 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0254555  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2574  oligoribonuclease  45.93 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1847  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  44.75 
 
 		 188 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0353601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2638  oligoribonuclease  43.18 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0115664  hitchhiker  0.0000000947663 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1379  oligoribonuclease  44.83 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.969782  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1320  oligoribonuclease  44.83 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255771  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1016  oligoribonuclease  42.19 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1893  oligoribonuclease  46.89 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.53221  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2783  oligoribonuclease  44.13 
 
 		 181 aa  148  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10348  RNA exonuclease Rex2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11820)  43.89 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.111499 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2797  oligoribonuclease  43.93 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2666  oligoribonuclease  43.93 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02760  oligoribonuclease, putative  50.7 
 
 		 184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0341  oligoribonuclease  41.86 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2968  oligoribonuclease  41.94 
 
 		 203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139128  normal  0.188792 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2320  oligoribonuclease Orn  42.02 
 
 		 194 aa  146  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1959  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  42.02 
 
 		 194 aa  146  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.552747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00551  oligoribonuclease  41.81 
 
 		 181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1100  oligoribonuclease  43.86 
 
 		 184 aa  145  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0275698  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0324  oligoribonuclease  45.09 
 
 		 195 aa  145  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1270  oligoribonuclease  44.51 
 
 		 187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.768994  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0778  oligoribonuclease  43.5 
 
 		 207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4693  oligoribonuclease  46.51 
 
 		 180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1994  oligoribonuclease  44.44 
 
 		 182 aa  144  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0106356  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4902  oligoribonuclease  46.2 
 
 		 180 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1470  oligoribonuclease  44.51 
 
 		 187 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.255303 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1566  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  43.75 
 
 		 183 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4778  oligoribonuclease  46.2 
 
 		 180 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0884  oligoribonuclease  44.67 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.373133 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04032  oligoribonuclease  42.44 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000706599  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  42.44 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000318857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3848  oligoribonuclease  42.44 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000498222  hitchhiker  0.0000133205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0907  oligoribonuclease  44.77 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03994  hypothetical protein  42.44 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000413347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4633  oligoribonuclease  42.44 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387491  normal  0.0592166 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4694  oligoribonuclease  42.44 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.76072e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4954  oligoribonuclease  45.61 
 
 		 180 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445881 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4403  oligoribonuclease  42.44 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000656326  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4719  oligoribonuclease  42.44 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000375023  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1700  oligoribonuclease  45.66 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.104292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5678  oligoribonuclease  42.44 
 
 		 181 aa  142  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000295119  normal  0.99134 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>