185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_09680 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_09680  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  100 
 
 		 208 aa  419  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.508062  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2435  oligoribonuclease  63.87 
 
 		 211 aa  252  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2185  oligoribonuclease  61.54 
 
 		 208 aa  252  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000203098 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24870  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  59.79 
 
 		 220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.82834 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1083  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  63.83 
 
 		 212 aa  241  6e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00161655  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0907  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  61.38 
 
 		 222 aa  239  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.206307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1343  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  63.54 
 
 		 229 aa  239  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.801458  hitchhiker  0.000880887 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1351  oligoribonuclease  61.17 
 
 		 222 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0564  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  61.03 
 
 		 216 aa  232  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.686303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1040  oligoribonuclease  60.32 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7676  putative oligoribonuclease; K01175  59.9 
 
 		 200 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1081  exonuclease  56.06 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1900  oligoribonuclease  59.26 
 
 		 216 aa  224  8e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2655  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  59.07 
 
 		 235 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.785262 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  55.5 
 
 		 634 aa  223  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2680  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  60.99 
 
 		 198 aa  222  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5970  oligoribonuclease  60.51 
 
 		 213 aa  221  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2269  oligoribonuclease  59.67 
 
 		 213 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1254  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  58.24 
 
 		 204 aa  219  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08840  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  53.05 
 
 		 223 aa  218  3.9999999999999997e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0178877  normal  0.0713087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5510  oligoribonuclease  58.47 
 
 		 210 aa  217  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1649  oligoribonuclease  55.96 
 
 		 269 aa  216  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.554791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3716  oligoribonuclease  54.84 
 
 		 206 aa  211  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.952269  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1425  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  55.03 
 
 		 191 aa  200  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1339  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  50.26 
 
 		 198 aa  192  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28650  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  53.3 
 
 		 202 aa  192  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0552434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12533  oligoribonuclease  50.51 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1782  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  50.76 
 
 		 212 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2543  oligoribonuclease  50.79 
 
 		 214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2012  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  52.6 
 
 		 194 aa  188  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1056  oligoribonuclease  51.85 
 
 		 208 aa  188  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0686541  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3640  oligoribonuclease  51.32 
 
 		 215 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00635145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3713  oligoribonuclease  51.32 
 
 		 215 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3645  oligoribonuclease  51.32 
 
 		 215 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1466  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  52.75 
 
 		 225 aa  187  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4100  oligoribonuclease  50.26 
 
 		 214 aa  187  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0350683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1126  oligoribonuclease  48.45 
 
 		 198 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.499716  normal  0.391456 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1017  oligoribonuclease  48.15 
 
 		 196 aa  185  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5181  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  50 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0559  oligoribonuclease  44.63 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.198605 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3335  oligoribonuclease  46.15 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.475979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0586  oligoribonuclease  44.51 
 
 		 184 aa  157  2e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.51167  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002252  oligoribonuclease  43.35 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000410797  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2638  oligoribonuclease  44.25 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0115664  hitchhiker  0.0000000947663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0907  oligoribonuclease  47.93 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3212  oligoribonuclease  42.46 
 
 		 181 aa  155  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2574  oligoribonuclease  45 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2743  oligoribonuclease  42.77 
 
 		 181 aa  155  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147297  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1473  oligoribonuclease  47.65 
 
 		 183 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.777714  normal  0.355719 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3481  oligoribonuclease  44.38 
 
 		 181 aa  154  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122162  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3547  oligoribonuclease  43.35 
 
 		 181 aa  154  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4379  oligoribonuclease  43.86 
 
 		 181 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00112  oligoribonuclease  41.62 
 
 		 181 aa  153  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0387  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.65 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00551  oligoribonuclease  42.22 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0708  oligoribonuclease  47.93 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.367398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0790  oligoribonuclease  41.81 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4711  oligoribonuclease  46.15 
 
 		 181 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.036759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4747  oligoribonuclease  46.15 
 
 		 181 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00828868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4628  oligoribonuclease  46.15 
 
 		 181 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4619  oligoribonuclease  46.15 
 
 		 181 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3717  oligoribonuclease  42.46 
 
 		 181 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.624227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0551  oligoribonuclease  42.46 
 
 		 181 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000104193  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3900  oligoribonuclease  42.46 
 
 		 181 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4768  oligoribonuclease  46.15 
 
 		 181 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.0613691 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3774  oligoribonuclease  42.46 
 
 		 181 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00192179  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0592  oligoribonuclease  43.5 
 
 		 181 aa  151  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3808  oligoribonuclease  47.93 
 
 		 181 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000372044  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3661  oligoribonuclease  47.93 
 
 		 181 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474416  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0863  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  43.58 
 
 		 188 aa  151  7e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.859258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2676  oligoribonuclease  45.71 
 
 		 181 aa  151  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0348  oligoribonuclease  42.86 
 
 		 181 aa  151  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000355346  unclonable  0.00000209228 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0424  oligoribonuclease  46.02 
 
 		 181 aa  151  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000286047  hitchhiker  0.000000586556 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04032  oligoribonuclease  45.56 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000706599  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.56 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000318857  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1566  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.25 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4633  oligoribonuclease  45.56 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387491  normal  0.0592166 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2783  oligoribonuclease  41.38 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03994  hypothetical protein  45.56 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000413347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3848  oligoribonuclease  45.56 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000498222  hitchhiker  0.0000133205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2776  oligoribonuclease  44.97 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5678  oligoribonuclease  45.56 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000295119  normal  0.99134 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0476  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.88 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4694  oligoribonuclease  45.56 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.76072e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4403  oligoribonuclease  45.56 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000656326  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4719  oligoribonuclease  45.56 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000375023  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0942  oligoribonuclease  41.09 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4178  oligoribonuclease  42.37 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1670  oligoribonuclease  42.93 
 
 		 229 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0591  oligoribonuclease  42.94 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  hitchhiker  0.000123281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3439  oligoribonuclease  42.94 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3317  oligoribonuclease  41.81 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000232212  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0590  oligoribonuclease  42.94 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254654 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3032  oligoribonuclease  41.81 
 
 		 181 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1959  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.85 
 
 		 194 aa  148  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.552747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0813  oligoribonuclease  42.18 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2320  oligoribonuclease Orn  41.85 
 
 		 194 aa  148  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2968  oligoribonuclease  42.05 
 
 		 203 aa  148  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139128  normal  0.188792 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2426  oligoribonuclease  42.22 
 
 		 190 aa  148  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0778  oligoribonuclease  42.86 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101637 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>