179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2185 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2185  oligoribonuclease  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000203098 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2435  oligoribonuclease  85.99 
 
 		 211 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24870  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  68.04 
 
 		 220 aa  292  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.82834 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1083  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  70.05 
 
 		 212 aa  278  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00161655  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1351  oligoribonuclease  66.49 
 
 		 222 aa  277  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1343  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  69.35 
 
 		 229 aa  275  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.801458  hitchhiker  0.000880887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2655  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  63.55 
 
 		 235 aa  266  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.785262 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3716  oligoribonuclease  63.83 
 
 		 206 aa  266  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.952269  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7676  putative oligoribonuclease; K01175  64.29 
 
 		 200 aa  265  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1649  oligoribonuclease  63.78 
 
 		 269 aa  265  2.9999999999999995e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.554791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0564  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  64.8 
 
 		 216 aa  265  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.686303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2269  oligoribonuclease  64.67 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1254  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  65.22 
 
 		 204 aa  259  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0907  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  62.83 
 
 		 222 aa  259  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.206307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2680  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  66.3 
 
 		 198 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09680  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  61.54 
 
 		 208 aa  252  3e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.508062  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1056  oligoribonuclease  59.9 
 
 		 208 aa  249  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0686541  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  59.38 
 
 		 634 aa  246  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5970  oligoribonuclease  65.15 
 
 		 213 aa  246  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08840  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  60.41 
 
 		 223 aa  243  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0178877  normal  0.0713087 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1782  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  63.39 
 
 		 212 aa  242  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28650  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  59.46 
 
 		 202 aa  234  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0552434 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1081  exonuclease  57.65 
 
 		 235 aa  233  1.0000000000000001e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1126  oligoribonuclease  57.79 
 
 		 198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.499716  normal  0.391456 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1017  oligoribonuclease  58.33 
 
 		 196 aa  232  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1040  oligoribonuclease  56.7 
 
 		 250 aa  231  8.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1900  oligoribonuclease  54.55 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12533  oligoribonuclease  57.53 
 
 		 215 aa  228  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2543  oligoribonuclease  55.39 
 
 		 214 aa  226  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5510  oligoribonuclease  58.15 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4100  oligoribonuclease  56.12 
 
 		 214 aa  224  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0350683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2012  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  58.38 
 
 		 194 aa  224  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1466  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  58.15 
 
 		 225 aa  222  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1339  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  55.22 
 
 		 198 aa  219  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1425  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  55.85 
 
 		 191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3640  oligoribonuclease  53.4 
 
 		 215 aa  208  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00635145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3713  oligoribonuclease  53.4 
 
 		 215 aa  208  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3645  oligoribonuclease  53.4 
 
 		 215 aa  208  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5181  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  48.3 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002252  oligoribonuclease  44.2 
 
 		 181 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000410797  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2743  oligoribonuclease  45.6 
 
 		 181 aa  161  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147297  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00112  oligoribonuclease  43.09 
 
 		 181 aa  160  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0863  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  44.69 
 
 		 188 aa  160  9e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.859258  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0539  oligoribonuclease  47.16 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3335  oligoribonuclease  45.81 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.475979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00920  oligoribonuclease  45.16 
 
 		 194 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0529998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2783  oligoribonuclease  44.2 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2426  oligoribonuclease  45.09 
 
 		 190 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0564  oligoribonuclease  46.93 
 
 		 178 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04032  oligoribonuclease  45.25 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000706599  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.25 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000318857  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4950  oligoribonuclease  46.37 
 
 		 178 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4694  oligoribonuclease  45.25 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.76072e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3848  oligoribonuclease  45.25 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000498222  hitchhiker  0.0000133205 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4633  oligoribonuclease  45.25 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387491  normal  0.0592166 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03994  hypothetical protein  45.25 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000413347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2776  oligoribonuclease  44.94 
 
 		 180 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4403  oligoribonuclease  45.25 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000656326  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4719  oligoribonuclease  45.25 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000375023  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0633  oligoribonuclease  43.89 
 
 		 184 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1080  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.24 
 
 		 181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4619  oligoribonuclease  45.81 
 
 		 181 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4747  oligoribonuclease  45.81 
 
 		 181 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00828868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4711  oligoribonuclease  45.81 
 
 		 181 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.036759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4768  oligoribonuclease  45.81 
 
 		 181 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.0613691 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4628  oligoribonuclease  45.81 
 
 		 181 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0348  oligoribonuclease  44.38 
 
 		 181 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000355346  unclonable  0.00000209228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5678  oligoribonuclease  44.69 
 
 		 181 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000295119  normal  0.99134 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1566  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1552  oligoribonuclease  45.51 
 
 		 195 aa  152  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145931  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3212  oligoribonuclease  44 
 
 		 181 aa  152  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2638  oligoribonuclease  43.09 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0115664  hitchhiker  0.0000000947663 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1734  oligoribonuclease  45.51 
 
 		 195 aa  151  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0026371  normal  0.333729 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2574  oligoribonuclease  45.14 
 
 		 205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0942  oligoribonuclease  42.19 
 
 		 219 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00551  oligoribonuclease  43.09 
 
 		 181 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4192  oligoribonuclease  44.26 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.872573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1670  oligoribonuclease  42.93 
 
 		 229 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2676  oligoribonuclease  44.38 
 
 		 181 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1847  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  44.32 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0353601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5680  oligoribonuclease  46.24 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65410  oligoribonuclease  46.24 
 
 		 180 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0811  oligoribonuclease  44.83 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0543642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0424  oligoribonuclease  43.82 
 
 		 181 aa  148  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000286047  hitchhiker  0.000000586556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0778  oligoribonuclease  43.33 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101637 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4379  oligoribonuclease  41.99 
 
 		 181 aa  148  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0907  oligoribonuclease  44.83 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4693  oligoribonuclease  46.51 
 
 		 180 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4954  oligoribonuclease  46.24 
 
 		 180 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4902  oligoribonuclease  46.24 
 
 		 180 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4778  oligoribonuclease  46.24 
 
 		 180 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0387  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  43.18 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0225  oligoribonuclease  45.76 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0254555  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0476  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  42.61 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459407  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0592  oligoribonuclease  44.25 
 
 		 181 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0515  oligoribonuclease  45.35 
 
 		 180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460562  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1893  oligoribonuclease  44.86 
 
 		 193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.53221  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3717  oligoribonuclease  44.25 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.624227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0551  oligoribonuclease  44.25 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000104193  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3900  oligoribonuclease  44.25 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262855  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>