176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0348 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0348  oligoribonuclease  100 
 
 
181 aa  377  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000355346  unclonable  0.00000209228 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4633  oligoribonuclease  95.03 
 
 
181 aa  362  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387491  normal  0.0592166 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04032  oligoribonuclease  95.03 
 
 
181 aa  362  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000706599  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  95.03 
 
 
181 aa  362  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000318857  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03994  hypothetical protein  95.03 
 
 
181 aa  362  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000413347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3848  oligoribonuclease  95.03 
 
 
181 aa  362  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000498222  hitchhiker  0.0000133205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4403  oligoribonuclease  95.03 
 
 
181 aa  362  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000656326  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4719  oligoribonuclease  95.03 
 
 
181 aa  362  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000375023  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4694  oligoribonuclease  95.03 
 
 
181 aa  362  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.76072e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5678  oligoribonuclease  94.48 
 
 
181 aa  359  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000295119  normal  0.99134 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4628  oligoribonuclease  93.92 
 
 
181 aa  357  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4619  oligoribonuclease  93.92 
 
 
181 aa  357  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4768  oligoribonuclease  93.92 
 
 
181 aa  357  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.0613691 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4747  oligoribonuclease  93.92 
 
 
181 aa  357  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00828868  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4711  oligoribonuclease  93.92 
 
 
181 aa  357  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.036759  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0424  oligoribonuclease  88.4 
 
 
181 aa  341  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000286047  hitchhiker  0.000000586556 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0476  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  88.2 
 
 
180 aa  336  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459407  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0387  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  87.08 
 
 
180 aa  332  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3753  oligoribonuclease  85.96 
 
 
180 aa  332  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0708  oligoribonuclease  85.56 
 
 
181 aa  329  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.367398  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3808  oligoribonuclease  85 
 
 
181 aa  328  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000372044  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3661  oligoribonuclease  85 
 
 
181 aa  328  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474416  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3931  oligoribonuclease  82.12 
 
 
180 aa  320  5e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00112  oligoribonuclease  69.61 
 
 
181 aa  277  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0586  oligoribonuclease  68.18 
 
 
184 aa  275  3e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.51167  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002252  oligoribonuclease  67.4 
 
 
181 aa  271  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000410797  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2783  oligoribonuclease  67.4 
 
 
181 aa  271  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1100  oligoribonuclease  67.4 
 
 
184 aa  270  8.000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0275698  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0628  oligoribonuclease  69.49 
 
 
180 aa  267  7e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2743  oligoribonuclease  66.85 
 
 
181 aa  266  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147297  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3547  oligoribonuclease  68 
 
 
181 aa  264  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0559  oligoribonuclease  66.85 
 
 
181 aa  263  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.198605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2676  oligoribonuclease  68.51 
 
 
181 aa  262  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3212  oligoribonuclease  66.85 
 
 
181 aa  260  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0790  oligoribonuclease  65.19 
 
 
181 aa  258  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0592  oligoribonuclease  65.19 
 
 
181 aa  257  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3717  oligoribonuclease  64.64 
 
 
181 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.624227  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0591  oligoribonuclease  64.09 
 
 
181 aa  256  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  hitchhiker  0.000123281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3439  oligoribonuclease  64.09 
 
 
181 aa  256  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0590  oligoribonuclease  64.09 
 
 
181 aa  256  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000254654 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0551  oligoribonuclease  64.64 
 
 
181 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000104193  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3287  oligoribonuclease  64.09 
 
 
181 aa  255  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.161862  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3900  oligoribonuclease  64.64 
 
 
181 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262855  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3774  oligoribonuclease  64.64 
 
 
181 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00192179  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3032  oligoribonuclease  65.19 
 
 
181 aa  255  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102944  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00551  oligoribonuclease  64.09 
 
 
181 aa  254  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4902  oligoribonuclease  68.57 
 
 
180 aa  254  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4778  oligoribonuclease  68.57 
 
 
180 aa  254  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0515  oligoribonuclease  68 
 
 
180 aa  253  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460562  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2638  oligoribonuclease  63.54 
 
 
185 aa  253  8e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0115664  hitchhiker  0.0000000947663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4954  oligoribonuclease  68.57 
 
 
180 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.445881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4693  oligoribonuclease  67.43 
 
 
180 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1502  oligoribonuclease  65.75 
 
 
193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.678384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07470  oligoribonuclease  67.23 
 
 
180 aa  251  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2776  oligoribonuclease  63.69 
 
 
180 aa  251  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3481  oligoribonuclease  61.88 
 
 
181 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122162  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3317  oligoribonuclease  61.88 
 
 
181 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000232212  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4178  oligoribonuclease  62.98 
 
 
181 aa  250  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0564  oligoribonuclease  67.23 
 
 
178 aa  249  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5680  oligoribonuclease  65.17 
 
 
180 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65410  oligoribonuclease  65.17 
 
 
180 aa  248  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134577  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4950  oligoribonuclease  66.67 
 
 
178 aa  248  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0225  oligoribonuclease  62.98 
 
 
183 aa  247  6e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0254555  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1270  oligoribonuclease  63.79 
 
 
187 aa  244  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.768994  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2911  oligoribonuclease  66.3 
 
 
191 aa  245  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1566  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  64 
 
 
183 aa  245  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0539  oligoribonuclease  61.88 
 
 
181 aa  243  8e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2574  oligoribonuclease  61.93 
 
 
205 aa  243  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1080  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  65.19 
 
 
181 aa  243  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2797  oligoribonuclease  62.92 
 
 
187 aa  242  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2666  oligoribonuclease  62.92 
 
 
187 aa  242  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0907  oligoribonuclease  61.93 
 
 
210 aa  241  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1847  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  61.33 
 
 
188 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0353601 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1473  oligoribonuclease  59.12 
 
 
183 aa  237  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.777714  normal  0.355719 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0985  oligoribonuclease  64 
 
 
187 aa  237  6.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3335  oligoribonuclease  58.99 
 
 
179 aa  237  6.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.475979  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0942  oligoribonuclease  59.66 
 
 
219 aa  235  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1994  oligoribonuclease  59.67 
 
 
182 aa  233  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0106356  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1379  oligoribonuclease  58.01 
 
 
183 aa  232  3e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.969782  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0813  oligoribonuclease  61.93 
 
 
219 aa  231  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526826  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1320  oligoribonuclease  58.01 
 
 
183 aa  232  3e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255771  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0341  oligoribonuclease  59.67 
 
 
183 aa  231  5e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0714  oligoribonuclease  59.44 
 
 
184 aa  231  6e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.705267  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1839  oligoribonuclease  57.78 
 
 
182 aa  230  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3001  oligoribonuclease  58.66 
 
 
184 aa  229  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217558  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4192  oligoribonuclease  59.09 
 
 
206 aa  228  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.872573  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0884  oligoribonuclease  61.36 
 
 
215 aa  228  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1670  oligoribonuclease  57.95 
 
 
229 aa  227  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0633  oligoribonuclease  61.14 
 
 
184 aa  227  9e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1734  oligoribonuclease  60.34 
 
 
195 aa  226  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0026371  normal  0.333729 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0811  oligoribonuclease  60.92 
 
 
193 aa  226  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0543642  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0778  oligoribonuclease  58.96 
 
 
207 aa  226  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.101637 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1552  oligoribonuclease  59.77 
 
 
195 aa  226  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145931  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1016  oligoribonuclease  58.38 
 
 
207 aa  225  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1483  oligoribonuclease  55.8 
 
 
198 aa  225  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135513  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2968  oligoribonuclease  57.8 
 
 
203 aa  224  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139128  normal  0.188792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1700  oligoribonuclease  55 
 
 
187 aa  224  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.104292  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0525  oligoribonuclease  57.3 
 
 
195 aa  223  8e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.214811  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1893  oligoribonuclease  58.38 
 
 
193 aa  222  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.53221  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2535  oligoribonuclease  58.52 
 
 
201 aa  221  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>