175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5510 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5510  oligoribonuclease  100 
 
 		 210 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1040  oligoribonuclease  78.85 
 
 		 250 aa  333  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0564  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  64.97 
 
 		 216 aa  261  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.686303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7676  putative oligoribonuclease; K01175  65.46 
 
 		 200 aa  261  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1466  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  68.85 
 
 		 225 aa  260  8.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1351  oligoribonuclease  63.87 
 
 		 222 aa  258  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1056  oligoribonuclease  65.66 
 
 		 208 aa  258  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0686541  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1254  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  66.49 
 
 		 204 aa  257  8e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24870  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  64.43 
 
 		 220 aa  257  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.82834 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1649  oligoribonuclease  65.46 
 
 		 269 aa  257  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.554791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28650  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  67.39 
 
 		 202 aa  255  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0552434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1017  oligoribonuclease  64.43 
 
 		 196 aa  251  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1126  oligoribonuclease  64.43 
 
 		 198 aa  251  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.499716  normal  0.391456 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2680  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  65.22 
 
 		 198 aa  249  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1083  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  63.49 
 
 		 212 aa  248  5e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00161655  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1782  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  61.73 
 
 		 212 aa  247  9e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3640  oligoribonuclease  62.89 
 
 		 215 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00635145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3713  oligoribonuclease  62.89 
 
 		 215 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3645  oligoribonuclease  62.89 
 
 		 215 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2543  oligoribonuclease  60.82 
 
 		 214 aa  244  6e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2269  oligoribonuclease  62.5 
 
 		 213 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12533  oligoribonuclease  60.82 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4100  oligoribonuclease  60.42 
 
 		 214 aa  239  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0350683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1339  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  61.38 
 
 		 198 aa  238  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08840  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  58.74 
 
 		 223 aa  235  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0178877  normal  0.0713087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2655  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  59.79 
 
 		 235 aa  234  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.785262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2012  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  62.84 
 
 		 194 aa  231  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3716  oligoribonuclease  57.36 
 
 		 206 aa  231  7.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.952269  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1425  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  59.69 
 
 		 191 aa  229  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1343  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  60.87 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.801458  hitchhiker  0.000880887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2435  oligoribonuclease  55.84 
 
 		 211 aa  229  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5970  oligoribonuclease  60.61 
 
 		 213 aa  228  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0907  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  59.38 
 
 		 222 aa  229  3e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.206307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2185  oligoribonuclease  55.84 
 
 		 208 aa  228  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000203098 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  55.5 
 
 		 634 aa  228  5e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09680  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  56.92 
 
 		 208 aa  223  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.508062  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1081  exonuclease  52.55 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1900  oligoribonuclease  51.27 
 
 		 216 aa  204  7e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5181  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  52.84 
 
 		 187 aa  194  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0863  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  50.54 
 
 		 188 aa  187  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.859258  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0907  oligoribonuclease  50.81 
 
 		 210 aa  184  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2574  oligoribonuclease  50.54 
 
 		 205 aa  184  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0633  oligoribonuclease  46.93 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0942  oligoribonuclease  47.45 
 
 		 219 aa  171  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4379  oligoribonuclease  46.29 
 
 		 181 aa  171  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1473  oligoribonuclease  50.56 
 
 		 183 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.777714  normal  0.355719 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2320  oligoribonuclease Orn  48.15 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1959  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  48.15 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.552747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2776  oligoribonuclease  46.93 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0225  oligoribonuclease  50.85 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0254555  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2638  oligoribonuclease  46.02 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0115664  hitchhiker  0.0000000947663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1839  oligoribonuclease  49.42 
 
 		 182 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1994  oligoribonuclease  48.54 
 
 		 182 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0106356  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0985  oligoribonuclease  45.5 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1483  oligoribonuclease  45.5 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135513  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1893  oligoribonuclease  49.43 
 
 		 193 aa  166  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.53221  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0564  oligoribonuclease  46.15 
 
 		 178 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2676  oligoribonuclease  47.4 
 
 		 181 aa  165  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3335  oligoribonuclease  45.45 
 
 		 179 aa  165  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.475979  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4950  oligoribonuclease  45.6 
 
 		 178 aa  164  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00551  oligoribonuclease  46.86 
 
 		 181 aa  164  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2743  oligoribonuclease  46.55 
 
 		 181 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147297  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0778  oligoribonuclease  47.73 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101637 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1470  oligoribonuclease  46.78 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.255303 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0811  oligoribonuclease  44.94 
 
 		 193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0543642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002252  oligoribonuclease  45.14 
 
 		 181 aa  162  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000410797  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1700  oligoribonuclease  47.37 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.104292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00112  oligoribonuclease  45.14 
 
 		 181 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3931  oligoribonuclease  47.98 
 
 		 180 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0539  oligoribonuclease  48.28 
 
 		 181 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2694  oligoribonuclease  45.71 
 
 		 192 aa  161  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1080  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.98 
 
 		 181 aa  161  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2968  oligoribonuclease  44.78 
 
 		 203 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139128  normal  0.188792 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3346  oligoribonuclease  45.71 
 
 		 192 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0311181 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00920  oligoribonuclease  45 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0529998  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0813  oligoribonuclease  49.17 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0884  oligoribonuclease  47.94 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4192  oligoribonuclease  46.02 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.872573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1016  oligoribonuclease  43.56 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1847  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  44.86 
 
 		 188 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0353601 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1379  oligoribonuclease  46.59 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.969782  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1320  oligoribonuclease  46.59 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255771  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0559  oligoribonuclease  46.55 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.198605 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1552  oligoribonuclease  46.63 
 
 		 195 aa  159  4e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145931  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2426  oligoribonuclease  42.62 
 
 		 190 aa  158  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1270  oligoribonuclease  44.62 
 
 		 187 aa  157  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.768994  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1734  oligoribonuclease  46.07 
 
 		 195 aa  157  8e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0026371  normal  0.333729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5680  oligoribonuclease  46.78 
 
 		 180 aa  157  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4954  oligoribonuclease  47.37 
 
 		 180 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445881 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.24 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000318857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0341  oligoribonuclease  44.94 
 
 		 183 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1670  oligoribonuclease  45.45 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3848  oligoribonuclease  46.24 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000498222  hitchhiker  0.0000133205 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4694  oligoribonuclease  46.24 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.76072e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65410  oligoribonuclease  46.78 
 
 		 180 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5678  oligoribonuclease  46.24 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000295119  normal  0.99134 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4633  oligoribonuclease  46.24 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387491  normal  0.0592166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4778  oligoribonuclease  47.37 
 
 		 180 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03994  hypothetical protein  46.24 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000413347  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4403  oligoribonuclease  46.24 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000656326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>