183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24870 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_24870  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  100 
 
 		 220 aa  449  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.82834 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1083  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  74.76 
 
 		 212 aa  305  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00161655  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1343  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  76.34 
 
 		 229 aa  300  9e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.801458  hitchhiker  0.000880887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2655  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  66.51 
 
 		 235 aa  296  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.785262 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0907  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  65.9 
 
 		 222 aa  294  6e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.206307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2185  oligoribonuclease  68.04 
 
 		 208 aa  292  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000203098 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2435  oligoribonuclease  66.49 
 
 		 211 aa  289  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7676  putative oligoribonuclease; K01175  67.18 
 
 		 200 aa  285  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0564  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  65.46 
 
 		 216 aa  279  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.686303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1351  oligoribonuclease  62.44 
 
 		 222 aa  278  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2680  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  70.11 
 
 		 198 aa  277  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1649  oligoribonuclease  66.49 
 
 		 269 aa  274  9e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.554791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1254  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  67.57 
 
 		 204 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2269  oligoribonuclease  66.3 
 
 		 213 aa  270  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3716  oligoribonuclease  62.63 
 
 		 206 aa  265  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.952269  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1040  oligoribonuclease  61.5 
 
 		 250 aa  261  6e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1056  oligoribonuclease  62.19 
 
 		 208 aa  255  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0686541  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5970  oligoribonuclease  65.15 
 
 		 213 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  59.09 
 
 		 634 aa  252  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5510  oligoribonuclease  65.22 
 
 		 210 aa  249  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1900  oligoribonuclease  55.67 
 
 		 216 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09680  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  59.79 
 
 		 208 aa  243  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.508062  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1081  exonuclease  56.16 
 
 		 235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08840  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  60.62 
 
 		 223 aa  242  3.9999999999999997e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0178877  normal  0.0713087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28650  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  61.08 
 
 		 202 aa  241  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0552434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12533  oligoribonuclease  58.67 
 
 		 215 aa  241  7e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1782  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  56.04 
 
 		 212 aa  240  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1126  oligoribonuclease  59.28 
 
 		 198 aa  240  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.499716  normal  0.391456 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1017  oligoribonuclease  59.28 
 
 		 196 aa  238  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2012  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  58.12 
 
 		 194 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3640  oligoribonuclease  58.55 
 
 		 215 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00635145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3713  oligoribonuclease  58.55 
 
 		 215 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3645  oligoribonuclease  58.55 
 
 		 215 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1425  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  61.78 
 
 		 191 aa  229  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2543  oligoribonuclease  58.03 
 
 		 214 aa  228  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4100  oligoribonuclease  56.99 
 
 		 214 aa  226  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0350683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1466  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  60.99 
 
 		 225 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1339  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  56.99 
 
 		 198 aa  224  8e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5181  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  50 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0942  oligoribonuclease  45.54 
 
 		 219 aa  167  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0633  oligoribonuclease  46.37 
 
 		 184 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0863  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.93 
 
 		 188 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.859258  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2426  oligoribonuclease  46.59 
 
 		 190 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2574  oligoribonuclease  46.07 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2968  oligoribonuclease  46.96 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139128  normal  0.188792 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002252  oligoribonuclease  43.72 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000410797  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2776  oligoribonuclease  45.81 
 
 		 180 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1847  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.21 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0353601 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00920  oligoribonuclease  45.99 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0529998  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1016  oligoribonuclease  44.74 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0778  oligoribonuclease  47.03 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101637 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00112  oligoribonuclease  43.72 
 
 		 181 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0907  oligoribonuclease  45.51 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1670  oligoribonuclease  45.41 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1700  oligoribonuclease  46.99 
 
 		 187 aa  158  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.104292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3212  oligoribonuclease  44.44 
 
 		 181 aa  157  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3335  oligoribonuclease  44.69 
 
 		 179 aa  157  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.475979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0591  oligoribonuclease  44.81 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  hitchhiker  0.000123281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3439  oligoribonuclease  44.81 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3287  oligoribonuclease  43.89 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.161862  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4711  oligoribonuclease  46.02 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.036759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4768  oligoribonuclease  46.02 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.0613691 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4619  oligoribonuclease  46.02 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1473  oligoribonuclease  47.4 
 
 		 183 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.777714  normal  0.355719 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4747  oligoribonuclease  46.02 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00828868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2743  oligoribonuclease  45.51 
 
 		 181 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147297  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4628  oligoribonuclease  46.02 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013917  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04032  oligoribonuclease  45.2 
 
 		 181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000706599  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.2 
 
 		 181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000318857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3848  oligoribonuclease  45.2 
 
 		 181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000498222  hitchhiker  0.0000133205 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4633  oligoribonuclease  45.2 
 
 		 181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387491  normal  0.0592166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0590  oligoribonuclease  44.26 
 
 		 181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254654 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1566  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  44.26 
 
 		 183 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4694  oligoribonuclease  45.2 
 
 		 181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.76072e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03994  hypothetical protein  45.2 
 
 		 181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000413347  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4403  oligoribonuclease  45.2 
 
 		 181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000656326  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4719  oligoribonuclease  45.2 
 
 		 181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000375023  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0592  oligoribonuclease  44.26 
 
 		 181 aa  155  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3900  oligoribonuclease  43.89 
 
 		 181 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0551  oligoribonuclease  43.89 
 
 		 181 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000104193  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3774  oligoribonuclease  43.89 
 
 		 181 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00192179  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1994  oligoribonuclease  50 
 
 		 182 aa  155  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0106356  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4192  oligoribonuclease  45.45 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.872573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3717  oligoribonuclease  43.33 
 
 		 181 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.624227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1552  oligoribonuclease  46.07 
 
 		 195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145931  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5678  oligoribonuclease  44.63 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000295119  normal  0.99134 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3032  oligoribonuclease  45.36 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1839  oligoribonuclease  45.88 
 
 		 182 aa  152  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1734  oligoribonuclease  45.51 
 
 		 195 aa  152  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0026371  normal  0.333729 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1470  oligoribonuclease  45.2 
 
 		 187 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.255303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1080  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.86 
 
 		 181 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4950  oligoribonuclease  45.45 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0564  oligoribonuclease  44.89 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3931  oligoribonuclease  46.02 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2320  oligoribonuclease Orn  44.57 
 
 		 194 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0813  oligoribonuclease  44.55 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1959  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  44.57 
 
 		 194 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.552747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2911  oligoribonuclease  47.49 
 
 		 191 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4902  oligoribonuclease  46.47 
 
 		 180 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4778  oligoribonuclease  46.47 
 
 		 180 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>