175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7676 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7676  putative oligoribonuclease; K01175  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2680  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  84.32 
 
 		 198 aa  331  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2269  oligoribonuclease  78.38 
 
 		 213 aa  308  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0564  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  73.85 
 
 		 216 aa  308  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.686303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1254  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  77.84 
 
 		 204 aa  308  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24870  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  67.18 
 
 		 220 aa  285  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.82834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2655  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  68.69 
 
 		 235 aa  281  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.785262 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1649  oligoribonuclease  69.79 
 
 		 269 aa  279  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.554791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2185  oligoribonuclease  64.29 
 
 		 208 aa  265  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000203098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1343  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  69.73 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.801458  hitchhiker  0.000880887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2435  oligoribonuclease  63.08 
 
 		 211 aa  261  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1351  oligoribonuclease  63.02 
 
 		 222 aa  260  6.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0907  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  63.35 
 
 		 222 aa  260  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.206307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1083  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  68.31 
 
 		 212 aa  257  7e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00161655  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5510  oligoribonuclease  67.39 
 
 		 210 aa  257  9e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5970  oligoribonuclease  66.84 
 
 		 213 aa  255  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1040  oligoribonuclease  63.13 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3716  oligoribonuclease  64.55 
 
 		 206 aa  254  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.952269  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1017  oligoribonuclease  64.25 
 
 		 196 aa  254  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28650  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  66.13 
 
 		 202 aa  253  9e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0552434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1056  oligoribonuclease  66.49 
 
 		 208 aa  249  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0686541  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1126  oligoribonuclease  63.73 
 
 		 198 aa  250  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.499716  normal  0.391456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12533  oligoribonuclease  64.71 
 
 		 215 aa  249  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1782  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  61.81 
 
 		 212 aa  248  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3640  oligoribonuclease  63.21 
 
 		 215 aa  247  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00635145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3713  oligoribonuclease  63.21 
 
 		 215 aa  247  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3645  oligoribonuclease  63.21 
 
 		 215 aa  247  8e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1425  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  63.35 
 
 		 191 aa  245  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2012  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  65.19 
 
 		 194 aa  243  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  58.59 
 
 		 634 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1466  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  65.57 
 
 		 225 aa  241  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4100  oligoribonuclease  62.7 
 
 		 214 aa  239  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0350683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2543  oligoribonuclease  62.7 
 
 		 214 aa  239  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08840  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  62.18 
 
 		 223 aa  233  9e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0178877  normal  0.0713087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1339  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  61.83 
 
 		 198 aa  229  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09680  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  59.9 
 
 		 208 aa  226  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.508062  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1900  oligoribonuclease  55.21 
 
 		 216 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1081  exonuclease  51.55 
 
 		 235 aa  202  2e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0863  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  51.11 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.859258  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5181  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  53.14 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2776  oligoribonuclease  48.86 
 
 		 180 aa  165  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2426  oligoribonuclease  48.55 
 
 		 190 aa  162  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00920  oligoribonuclease  46.81 
 
 		 194 aa  162  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0529998  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0633  oligoribonuclease  47.43 
 
 		 184 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002252  oligoribonuclease  46.55 
 
 		 181 aa  158  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000410797  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0539  oligoribonuclease  48.28 
 
 		 181 aa  158  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1552  oligoribonuclease  48.88 
 
 		 195 aa  157  7e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145931  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1734  oligoribonuclease  48.31 
 
 		 195 aa  157  8e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0026371  normal  0.333729 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0564  oligoribonuclease  48.24 
 
 		 178 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2574  oligoribonuclease  49.41 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0225  oligoribonuclease  49.16 
 
 		 183 aa  157  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0254555  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2743  oligoribonuclease  48.28 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147297  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1994  oligoribonuclease  46.47 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0106356  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1839  oligoribonuclease  45.76 
 
 		 182 aa  155  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3335  oligoribonuclease  45.4 
 
 		 179 aa  155  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.475979  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0942  oligoribonuclease  45.6 
 
 		 219 aa  154  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4950  oligoribonuclease  47.06 
 
 		 178 aa  154  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0778  oligoribonuclease  46.29 
 
 		 207 aa  154  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101637 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1847  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  48.82 
 
 		 188 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0353601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65410  oligoribonuclease  48.24 
 
 		 180 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1959  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  43.46 
 
 		 194 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.552747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0811  oligoribonuclease  45.4 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0543642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5680  oligoribonuclease  48.24 
 
 		 180 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2320  oligoribonuclease Orn  43.46 
 
 		 194 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1379  oligoribonuclease  45.45 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.969782  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1320  oligoribonuclease  45.45 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255771  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00112  oligoribonuclease  44.83 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04032  oligoribonuclease  47.06 
 
 		 181 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000706599  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.06 
 
 		 181 aa  152  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000318857  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4633  oligoribonuclease  47.06 
 
 		 181 aa  152  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387491  normal  0.0592166 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4694  oligoribonuclease  47.06 
 
 		 181 aa  152  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.76072e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03994  hypothetical protein  47.06 
 
 		 181 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000413347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3848  oligoribonuclease  47.06 
 
 		 181 aa  152  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000498222  hitchhiker  0.0000133205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4403  oligoribonuclease  47.06 
 
 		 181 aa  152  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000656326  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4719  oligoribonuclease  47.06 
 
 		 181 aa  152  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000375023  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0790  oligoribonuclease  45.4 
 
 		 181 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1566  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.98 
 
 		 183 aa  151  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2676  oligoribonuclease  46.47 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1016  oligoribonuclease  43.98 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0591  oligoribonuclease  44.51 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5678  oligoribonuclease  47.06 
 
 		 181 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000295119  normal  0.99134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0907  oligoribonuclease  47.37 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1700  oligoribonuclease  47.65 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.104292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2968  oligoribonuclease  43.48 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139128  normal  0.188792 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0546  oligoribonuclease  44.51 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0559  oligoribonuclease  45.4 
 
 		 181 aa  148  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.198605 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2638  oligoribonuclease  43.1 
 
 		 185 aa  148  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0115664  hitchhiker  0.0000000947663 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1893  oligoribonuclease  48.04 
 
 		 193 aa  147  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.53221  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4902  oligoribonuclease  47.65 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4693  oligoribonuclease  47.37 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1270  oligoribonuclease  43.5 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.768994  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4778  oligoribonuclease  47.65 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0708  oligoribonuclease  45.88 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.367398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4711  oligoribonuclease  44.71 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.036759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1670  oligoribonuclease  44.02 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4619  oligoribonuclease  44.71 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3808  oligoribonuclease  45.88 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000372044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4178  oligoribonuclease  44.25 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4747  oligoribonuclease  44.71 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00828868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4954  oligoribonuclease  47.06 
 
 		 180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445881 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>