180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1700 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1700  oligoribonuclease  100 
 
 		 187 aa  391  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.104292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1470  oligoribonuclease  88.24 
 
 		 187 aa  350  5.9999999999999994e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.255303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1483  oligoribonuclease  79.44 
 
 		 198 aa  315  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135513  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3346  oligoribonuclease  79.33 
 
 		 192 aa  304  5.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0311181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2694  oligoribonuclease  78.77 
 
 		 192 aa  303  9.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1893  oligoribonuclease  76.5 
 
 		 193 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.53221  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0324  oligoribonuclease  74.59 
 
 		 195 aa  296  9e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1412  oligoribonuclease  78.92 
 
 		 169 aa  289  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118858  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2911  oligoribonuclease  70.72 
 
 		 191 aa  279  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0907  oligoribonuclease  68.11 
 
 		 210 aa  271  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0985  oligoribonuclease  66.48 
 
 		 187 aa  270  7e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0778  oligoribonuclease  65.57 
 
 		 207 aa  269  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101637 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2574  oligoribonuclease  67.98 
 
 		 205 aa  268  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0942  oligoribonuclease  68.54 
 
 		 219 aa  266  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4192  oligoribonuclease  65.93 
 
 		 206 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.872573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1016  oligoribonuclease  66.48 
 
 		 207 aa  262  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2968  oligoribonuclease  64.84 
 
 		 203 aa  262  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139128  normal  0.188792 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1670  oligoribonuclease  64.84 
 
 		 229 aa  262  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2225  oligoribonuclease  68.13 
 
 		 211 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0813  oligoribonuclease  69.66 
 
 		 219 aa  251  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0954  oligoribonuclease  67.03 
 
 		 206 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0958  oligoribonuclease  67.03 
 
 		 206 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.8305 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0392  oligoribonuclease  65.38 
 
 		 201 aa  248  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.484174  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2535  oligoribonuclease  65.38 
 
 		 201 aa  248  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0908  oligoribonuclease  65.38 
 
 		 201 aa  248  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2848  oligoribonuclease  65.38 
 
 		 201 aa  248  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0239  oligoribonuclease  65.38 
 
 		 201 aa  248  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2958  oligoribonuclease  65.38 
 
 		 229 aa  248  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2908  oligoribonuclease  65.38 
 
 		 201 aa  248  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4726  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1037  oligoribonuclease  66.48 
 
 		 206 aa  248  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0599  oligoribonuclease  66.48 
 
 		 206 aa  248  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.62121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1078  oligoribonuclease  66.48 
 
 		 206 aa  248  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0884  oligoribonuclease  68.54 
 
 		 215 aa  247  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1473  oligoribonuclease  60 
 
 		 183 aa  246  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.777714  normal  0.355719 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1994  oligoribonuclease  60 
 
 		 182 aa  244  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0106356  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1839  oligoribonuclease  61.49 
 
 		 182 aa  243  9e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0525  oligoribonuclease  60.92 
 
 		 195 aa  243  9e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.214811  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0225  oligoribonuclease  62.71 
 
 		 183 aa  239  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0254555  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1276  oligoribonuclease  57.95 
 
 		 198 aa  239  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0268591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3001  oligoribonuclease  64.37 
 
 		 184 aa  238  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2776  oligoribonuclease  63.58 
 
 		 180 aa  237  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1100  oligoribonuclease  60.92 
 
 		 184 aa  235  3e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0275698  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3753  oligoribonuclease  59.66 
 
 		 180 aa  234  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07470  oligoribonuclease  60.57 
 
 		 180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0476  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  58.76 
 
 		 180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459407  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04032  oligoribonuclease  56.67 
 
 		 181 aa  231  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000706599  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  56.67 
 
 		 181 aa  231  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000318857  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03994  hypothetical protein  56.67 
 
 		 181 aa  231  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000413347  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4694  oligoribonuclease  56.67 
 
 		 181 aa  231  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.76072e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3848  oligoribonuclease  56.67 
 
 		 181 aa  231  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000498222  hitchhiker  0.0000133205 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4633  oligoribonuclease  56.67 
 
 		 181 aa  231  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387491  normal  0.0592166 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4403  oligoribonuclease  56.67 
 
 		 181 aa  231  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000656326  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4719  oligoribonuclease  56.67 
 
 		 181 aa  231  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000375023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0424  oligoribonuclease  56.11 
 
 		 181 aa  231  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000286047  hitchhiker  0.000000586556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0515  oligoribonuclease  60 
 
 		 180 aa  231  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460562  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4902  oligoribonuclease  60 
 
 		 180 aa  230  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0628  oligoribonuclease  60.92 
 
 		 180 aa  230  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4778  oligoribonuclease  60 
 
 		 180 aa  230  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5678  oligoribonuclease  56.67 
 
 		 181 aa  230  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000295119  normal  0.99134 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1847  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  55.56 
 
 		 188 aa  230  9e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0353601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0387  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  58.19 
 
 		 180 aa  230  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65410  oligoribonuclease  60 
 
 		 180 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5680  oligoribonuclease  60 
 
 		 180 aa  229  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4693  oligoribonuclease  60 
 
 		 180 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1080  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  59.2 
 
 		 181 aa  229  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3547  oligoribonuclease  58.48 
 
 		 181 aa  229  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2676  oligoribonuclease  57.63 
 
 		 181 aa  228  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0591  oligoribonuclease  59.77 
 
 		 181 aa  228  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  hitchhiker  0.000123281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3439  oligoribonuclease  59.77 
 
 		 181 aa  228  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4954  oligoribonuclease  59.43 
 
 		 180 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445881 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3931  oligoribonuclease  58.52 
 
 		 180 aa  228  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0592  oligoribonuclease  59.77 
 
 		 181 aa  228  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3212  oligoribonuclease  60.92 
 
 		 181 aa  228  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0559  oligoribonuclease  56.11 
 
 		 181 aa  228  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.198605 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0708  oligoribonuclease  56.67 
 
 		 181 aa  228  5e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.367398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0551  oligoribonuclease  59.77 
 
 		 181 aa  228  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000104193  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3774  oligoribonuclease  59.77 
 
 		 181 aa  228  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00192179  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3900  oligoribonuclease  59.77 
 
 		 181 aa  228  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3317  oligoribonuclease  58.62 
 
 		 181 aa  227  8e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000232212  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3717  oligoribonuclease  59.77 
 
 		 181 aa  227  9e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.624227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4768  oligoribonuclease  56.11 
 
 		 181 aa  227  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.0613691 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4747  oligoribonuclease  56.11 
 
 		 181 aa  227  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00828868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4619  oligoribonuclease  56.11 
 
 		 181 aa  227  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4628  oligoribonuclease  56.11 
 
 		 181 aa  227  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4711  oligoribonuclease  56.11 
 
 		 181 aa  227  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.036759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3808  oligoribonuclease  56.11 
 
 		 181 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000372044  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0590  oligoribonuclease  58.62 
 
 		 181 aa  226  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254654 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3661  oligoribonuclease  56.11 
 
 		 181 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474416  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3481  oligoribonuclease  58.86 
 
 		 181 aa  225  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122162  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0790  oligoribonuclease  56.9 
 
 		 181 aa  225  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002252  oligoribonuclease  58.76 
 
 		 181 aa  224  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000410797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0348  oligoribonuclease  55 
 
 		 181 aa  224  8e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000355346  unclonable  0.00000209228 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2797  oligoribonuclease  57.06 
 
 		 187 aa  223  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2666  oligoribonuclease  57.06 
 
 		 187 aa  223  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1502  oligoribonuclease  61.02 
 
 		 193 aa  223  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678384 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3287  oligoribonuclease  58.05 
 
 		 181 aa  223  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.161862  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00551  oligoribonuclease  56.25 
 
 		 181 aa  222  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0586  oligoribonuclease  56.82 
 
 		 184 aa  223  2e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.51167  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0341  oligoribonuclease  56.42 
 
 		 183 aa  221  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4178  oligoribonuclease  56.9 
 
 		 181 aa  220  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>