173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1425 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1425  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 191 aa  393  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1017  oligoribonuclease  69.11 
 
 		 196 aa  281  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1126  oligoribonuclease  68.06 
 
 		 198 aa  278  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.499716  normal  0.391456 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28650  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  70.39 
 
 		 202 aa  274  5e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0552434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1056  oligoribonuclease  68.59 
 
 		 208 aa  271  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0686541  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2012  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  65.97 
 
 		 194 aa  270  9e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1466  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  71.51 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2543  oligoribonuclease  67.02 
 
 		 214 aa  268  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12533  oligoribonuclease  65.78 
 
 		 215 aa  268  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3640  oligoribonuclease  65.97 
 
 		 215 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00635145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3713  oligoribonuclease  65.97 
 
 		 215 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4100  oligoribonuclease  63.87 
 
 		 214 aa  263  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0350683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3645  oligoribonuclease  65.97 
 
 		 215 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7676  putative oligoribonuclease; K01175  66.49 
 
 		 200 aa  261  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1782  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  64.8 
 
 		 212 aa  254  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1339  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  62.83 
 
 		 198 aa  251  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1254  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  66.11 
 
 		 204 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24870  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  63.35 
 
 		 220 aa  249  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.82834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2680  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  66.11 
 
 		 198 aa  249  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1649  oligoribonuclease  63.83 
 
 		 269 aa  248  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.554791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2269  oligoribonuclease  64.44 
 
 		 213 aa  245  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1040  oligoribonuclease  62.23 
 
 		 250 aa  243  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0564  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  61.7 
 
 		 216 aa  240  9e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.686303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1083  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  63.89 
 
 		 212 aa  238  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00161655  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5510  oligoribonuclease  60.99 
 
 		 210 aa  235  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2655  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  63.89 
 
 		 235 aa  234  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.785262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5970  oligoribonuclease  61.98 
 
 		 213 aa  231  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2185  oligoribonuclease  57.98 
 
 		 208 aa  228  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000203098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1351  oligoribonuclease  58.51 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2435  oligoribonuclease  56.54 
 
 		 211 aa  224  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3716  oligoribonuclease  59.68 
 
 		 206 aa  222  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.952269  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0907  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  58.51 
 
 		 222 aa  221  7e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.206307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08840  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  59.26 
 
 		 223 aa  216  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0178877  normal  0.0713087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1343  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  60 
 
 		 229 aa  216  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.801458  hitchhiker  0.000880887 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  54.5 
 
 		 634 aa  210  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09680  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  55.03 
 
 		 208 aa  208  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.508062  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5181  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  55.43 
 
 		 187 aa  198  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1081  exonuclease  50.79 
 
 		 235 aa  193  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1900  oligoribonuclease  50.79 
 
 		 216 aa  188  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0633  oligoribonuclease  52.84 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0863  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  50.28 
 
 		 188 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.859258  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1893  oligoribonuclease  52 
 
 		 193 aa  174  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.53221  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3335  oligoribonuclease  49.71 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.475979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1994  oligoribonuclease  52.07 
 
 		 182 aa  168  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0106356  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0225  oligoribonuclease  52.25 
 
 		 183 aa  168  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0254555  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0778  oligoribonuclease  49.71 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101637 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0539  oligoribonuclease  52.6 
 
 		 181 aa  164  8e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1959  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.03 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.552747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2911  oligoribonuclease  52.07 
 
 		 191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2320  oligoribonuclease Orn  46.03 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0942  oligoribonuclease  46.6 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2776  oligoribonuclease  47.98 
 
 		 180 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0559  oligoribonuclease  49.71 
 
 		 181 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.198605 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0564  oligoribonuclease  47.43 
 
 		 178 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2574  oligoribonuclease  48.24 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4950  oligoribonuclease  46.86 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1473  oligoribonuclease  49.11 
 
 		 183 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.777714  normal  0.355719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1700  oligoribonuclease  49.41 
 
 		 187 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.104292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2638  oligoribonuclease  45.66 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0115664  hitchhiker  0.0000000947663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0907  oligoribonuclease  48.52 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1016  oligoribonuclease  46.11 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1552  oligoribonuclease  48.02 
 
 		 195 aa  157  7e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145931  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4192  oligoribonuclease  47.43 
 
 		 206 aa  157  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.872573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0551  oligoribonuclease  47.4 
 
 		 181 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000104193  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3774  oligoribonuclease  47.4 
 
 		 181 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00192179  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3900  oligoribonuclease  47.4 
 
 		 181 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2676  oligoribonuclease  49.7 
 
 		 181 aa  157  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1483  oligoribonuclease  47.4 
 
 		 198 aa  157  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135513  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5680  oligoribonuclease  49.7 
 
 		 180 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1847  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.75 
 
 		 188 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0353601 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1839  oligoribonuclease  47.93 
 
 		 182 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1734  oligoribonuclease  47.46 
 
 		 195 aa  156  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0026371  normal  0.333729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65410  oligoribonuclease  49.11 
 
 		 180 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2743  oligoribonuclease  47.4 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147297  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2694  oligoribonuclease  47.93 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0592  oligoribonuclease  47.4 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1470  oligoribonuclease  48.52 
 
 		 187 aa  156  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.255303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3346  oligoribonuclease  47.93 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0311181 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3717  oligoribonuclease  46.82 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.624227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07470  oligoribonuclease  49.7 
 
 		 180 aa  156  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1566  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  48.55 
 
 		 183 aa  155  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3753  oligoribonuclease  49.7 
 
 		 180 aa  155  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0591  oligoribonuclease  46.82 
 
 		 181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  hitchhiker  0.000123281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3439  oligoribonuclease  46.82 
 
 		 181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2783  oligoribonuclease  46.82 
 
 		 181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4379  oligoribonuclease  46.24 
 
 		 181 aa  154  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1670  oligoribonuclease  46.29 
 
 		 229 aa  154  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3212  oligoribonuclease  45.66 
 
 		 181 aa  154  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0590  oligoribonuclease  46.82 
 
 		 181 aa  154  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254654 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0341  oligoribonuclease  44.97 
 
 		 183 aa  154  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0714  oligoribonuclease  46.15 
 
 		 184 aa  154  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.705267  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2426  oligoribonuclease  47.06 
 
 		 190 aa  154  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2968  oligoribonuclease  45.56 
 
 		 203 aa  154  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139128  normal  0.188792 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3287  oligoribonuclease  46.24 
 
 		 181 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.161862  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2225  oligoribonuclease  48.57 
 
 		 211 aa  153  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  48.52 
 
 		 181 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000318857  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4633  oligoribonuclease  48.52 
 
 		 181 aa  153  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387491  normal  0.0592166 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3032  oligoribonuclease  45.66 
 
 		 181 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0324  oligoribonuclease  47.4 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4403  oligoribonuclease  48.52 
 
 		 181 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000656326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>