180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1649 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1649  oligoribonuclease  100 
 
 		 269 aa  532  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.554791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2680  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  76.22 
 
 		 198 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1254  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  72.04 
 
 		 204 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2269  oligoribonuclease  72.43 
 
 		 213 aa  278  5e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7676  putative oligoribonuclease; K01175  69.79 
 
 		 200 aa  278  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0564  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  68.53 
 
 		 216 aa  278  7e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.686303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24870  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  66.49 
 
 		 220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.82834 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1351  oligoribonuclease  64.43 
 
 		 222 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28650  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  69.35 
 
 		 202 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0552434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2185  oligoribonuclease  63.78 
 
 		 208 aa  264  8.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000203098 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2435  oligoribonuclease  63.73 
 
 		 211 aa  263  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1056  oligoribonuclease  65.84 
 
 		 208 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0686541  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3716  oligoribonuclease  64.95 
 
 		 206 aa  262  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.952269  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1083  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  67.21 
 
 		 212 aa  261  8e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00161655  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5970  oligoribonuclease  67.34 
 
 		 213 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1343  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  66.85 
 
 		 229 aa  258  8e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.801458  hitchhiker  0.000880887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4100  oligoribonuclease  62.62 
 
 		 214 aa  257  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0350683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2543  oligoribonuclease  64.18 
 
 		 214 aa  256  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1017  oligoribonuclease  63.78 
 
 		 196 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3640  oligoribonuclease  64.29 
 
 		 215 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00635145  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0907  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  59.7 
 
 		 222 aa  251  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.206307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3713  oligoribonuclease  64.29 
 
 		 215 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3645  oligoribonuclease  64.29 
 
 		 215 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1040  oligoribonuclease  62.89 
 
 		 250 aa  248  6e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1126  oligoribonuclease  62.24 
 
 		 198 aa  248  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.499716  normal  0.391456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2655  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  64.25 
 
 		 235 aa  248  7e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.785262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2012  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  65.93 
 
 		 194 aa  248  7e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5510  oligoribonuclease  64.86 
 
 		 210 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12533  oligoribonuclease  61.22 
 
 		 215 aa  245  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1782  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  59.69 
 
 		 212 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08840  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  61.54 
 
 		 223 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0178877  normal  0.0713087 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  57.29 
 
 		 634 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1339  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  61.26 
 
 		 198 aa  237  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1466  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  62.09 
 
 		 225 aa  234  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1425  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  61.7 
 
 		 191 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09680  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  55.96 
 
 		 208 aa  215  7e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.508062  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1081  exonuclease  54.69 
 
 		 235 aa  214  9e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1900  oligoribonuclease  52.04 
 
 		 216 aa  210  3e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5181  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  54.24 
 
 		 187 aa  190  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0863  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  49.18 
 
 		 188 aa  175  6e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.859258  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1847  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  50 
 
 		 188 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0353601 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0633  oligoribonuclease  46.63 
 
 		 184 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3335  oligoribonuclease  48.3 
 
 		 179 aa  169  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.475979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2743  oligoribonuclease  48.85 
 
 		 181 aa  168  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147297  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1552  oligoribonuclease  48.31 
 
 		 195 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145931  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4192  oligoribonuclease  47.73 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.872573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1734  oligoribonuclease  47.75 
 
 		 195 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0026371  normal  0.333729 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0539  oligoribonuclease  49.43 
 
 		 181 aa  166  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00551  oligoribonuclease  47.7 
 
 		 181 aa  166  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0942  oligoribonuclease  47.22 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0778  oligoribonuclease  47.73 
 
 		 207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101637 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0559  oligoribonuclease  48.28 
 
 		 181 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.198605 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00920  oligoribonuclease  47.06 
 
 		 194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0529998  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0811  oligoribonuclease  45.76 
 
 		 193 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0543642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2574  oligoribonuclease  45.66 
 
 		 205 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04032  oligoribonuclease  47.49 
 
 		 181 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000706599  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.49 
 
 		 181 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000318857  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03994  hypothetical protein  47.49 
 
 		 181 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000413347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4633  oligoribonuclease  47.49 
 
 		 181 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387491  normal  0.0592166 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4694  oligoribonuclease  47.49 
 
 		 181 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.76072e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2426  oligoribonuclease  46.24 
 
 		 190 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3848  oligoribonuclease  47.49 
 
 		 181 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000498222  hitchhiker  0.0000133205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4403  oligoribonuclease  47.49 
 
 		 181 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000656326  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4719  oligoribonuclease  47.49 
 
 		 181 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000375023  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1670  oligoribonuclease  45.41 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1016  oligoribonuclease  45.79 
 
 		 207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0476  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  48.6 
 
 		 180 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00112  oligoribonuclease  45.98 
 
 		 181 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4950  oligoribonuclease  47.16 
 
 		 178 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0591  oligoribonuclease  46.02 
 
 		 181 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  hitchhiker  0.000123281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3439  oligoribonuclease  46.02 
 
 		 181 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002252  oligoribonuclease  45.98 
 
 		 181 aa  162  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000410797  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2776  oligoribonuclease  46.02 
 
 		 180 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3287  oligoribonuclease  45.2 
 
 		 181 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.161862  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3900  oligoribonuclease  45.76 
 
 		 181 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0387  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.49 
 
 		 180 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0564  oligoribonuclease  47.16 
 
 		 178 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3931  oligoribonuclease  47.16 
 
 		 180 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3212  oligoribonuclease  44.89 
 
 		 181 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0586  oligoribonuclease  47.06 
 
 		 184 aa  160  2e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.51167  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1080  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  48.55 
 
 		 181 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2968  oligoribonuclease  46.15 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139128  normal  0.188792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0551  oligoribonuclease  45.76 
 
 		 181 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000104193  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3774  oligoribonuclease  45.76 
 
 		 181 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00192179  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4902  oligoribonuclease  49.15 
 
 		 180 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0592  oligoribonuclease  46.02 
 
 		 181 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5678  oligoribonuclease  46.93 
 
 		 181 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000295119  normal  0.99134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4778  oligoribonuclease  49.15 
 
 		 180 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4954  oligoribonuclease  48.59 
 
 		 180 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445881 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0424  oligoribonuclease  44.57 
 
 		 181 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000286047  hitchhiker  0.000000586556 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4693  oligoribonuclease  48.59 
 
 		 180 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0907  oligoribonuclease  46.33 
 
 		 210 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4747  oligoribonuclease  46.67 
 
 		 181 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00828868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4768  oligoribonuclease  46.67 
 
 		 181 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.0613691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0590  oligoribonuclease  44.89 
 
 		 181 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254654 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4619  oligoribonuclease  46.67 
 
 		 181 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4711  oligoribonuclease  46.67 
 
 		 181 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.036759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4628  oligoribonuclease  46.67 
 
 		 181 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3547  oligoribonuclease  46.59 
 
 		 181 aa  159  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3717  oligoribonuclease  45.2 
 
 		 181 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.624227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>