286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1295 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  100 
 
 		 280 aa  578  1e-164  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  46.93 
 
 		 285 aa  258  1e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.91 
 
 		 283 aa  232  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  42.5 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  39.93 
 
 		 282 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.13 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  42.61 
 
 		 292 aa  216  5e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.41 
 
 		 285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.6 
 
 		 287 aa  212  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.49 
 
 		 294 aa  211  7.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  41.37 
 
 		 281 aa  209  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.1 
 
 		 288 aa  208  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  37.01 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.05 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  39.26 
 
 		 283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.55 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.91 
 
 		 294 aa  198  9e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  34.07 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.23 
 
 		 312 aa  188  7e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.33 
 
 		 282 aa  182  7e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.16 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.58 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.71 
 
 		 283 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.47 
 
 		 282 aa  168  8e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.96 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  35.41 
 
 		 267 aa  159  6e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.21 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  32.01 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  37.11 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  36.49 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  36.19 
 
 		 292 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  31.9 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  35.24 
 
 		 292 aa  112  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  35.71 
 
 		 292 aa  112  9e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  34.76 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  29.86 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  29.93 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  30.45 
 
 		 266 aa  106  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0115  alpha-L-glutamate ligase  30.19 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  29.48 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  28.94 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.42 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  31.17 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.46 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  30.22 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  27.47 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.73 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.34 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.33 
 
 		 310 aa  92.4  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  26.44 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.33 
 
 		 314 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  29.1 
 
 		 317 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  25.97 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.55 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.96 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  27.88 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  27.46 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  29.71 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  31.44 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0928  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.16 
 
 		 447 aa  82  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3149  alpha-L-glutamate ligase  27.36 
 
 		 332 aa  82  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  29.29 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.29 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.26 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.31 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  29.29 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.56 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  29.29 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.76 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  29.29 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  29.29 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.56 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  29.29 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  32.04 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.04 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  29.58 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  26.16 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.04 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  27.66 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  27.4 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.65 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.07 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  27.31 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  25.09 
 
 		 459 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.21 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  28.02 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  28.03 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.6 
 
 		 324 aa  79  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0655  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.84 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.922088  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0763  alpha-L-glutamate ligase  32.16 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.708688  normal  0.325873 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  27.82 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  27.93 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  26.15 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.84 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  25.96 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  27.62 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0531  alpha-L-glutamate ligase  34.29 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.73 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  28.11 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  24.51 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>