More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0547 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  100 
 
 		 365 aa  746    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  50.97 
 
 		 364 aa  387  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  50.42 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  49.86 
 
 		 364 aa  376  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  49.17 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  50.14 
 
 		 352 aa  360  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  48.66 
 
 		 373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  50.14 
 
 		 359 aa  355  6.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  48.47 
 
 		 355 aa  348  8e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  45.03 
 
 		 366 aa  346  4e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  47.16 
 
 		 363 aa  346  4e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  49.58 
 
 		 364 aa  345  7e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  45.5 
 
 		 373 aa  345  1e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  49.86 
 
 		 354 aa  344  2e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  46.9 
 
 		 377 aa  340  2e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  48.87 
 
 		 359 aa  339  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  45.68 
 
 		 360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0690  chorismate synthase  45.53 
 
 		 357 aa  332  5e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140082  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  47.62 
 
 		 358 aa  332  5e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  47.19 
 
 		 358 aa  332  6e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0691  chorismate synthase  45.63 
 
 		 357 aa  332  6e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0522046  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  45.94 
 
 		 363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  48.02 
 
 		 362 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  48.02 
 
 		 362 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  47.61 
 
 		 364 aa  325  7e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  49.16 
 
 		 362 aa  325  7e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  48.88 
 
 		 362 aa  322  7e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  47.08 
 
 		 365 aa  322  8e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  47.38 
 
 		 362 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  47.06 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  48.02 
 
 		 363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  45.79 
 
 		 365 aa  319  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1010  chorismate synthase  45.68 
 
 		 369 aa  318  1e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0494741  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  45.94 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0578  chorismate synthase  46.51 
 
 		 373 aa  316  4e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.778585  normal  0.127119 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  46.07 
 
 		 361 aa  316  5e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  46.05 
 
 		 362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  47.46 
 
 		 370 aa  313  3.9999999999999997e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  45.63 
 
 		 366 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  44.79 
 
 		 364 aa  312  5.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1340  chorismate synthase  45.97 
 
 		 386 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  43.32 
 
 		 384 aa  311  7.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  45.04 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  46.61 
 
 		 362 aa  310  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  44.94 
 
 		 363 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  44.26 
 
 		 360 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  44.94 
 
 		 363 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  44.92 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  44.51 
 
 		 365 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  45.79 
 
 		 366 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  46.52 
 
 		 366 aa  306  3e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  43.98 
 
 		 360 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  45.79 
 
 		 366 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  46.2 
 
 		 366 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  46.05 
 
 		 362 aa  305  7e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  46.41 
 
 		 442 aa  305  7e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  45.92 
 
 		 366 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  45.92 
 
 		 366 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1649  chorismate synthase  44.35 
 
 		 357 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0108012 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  45.35 
 
 		 366 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  47.06 
 
 		 364 aa  304  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  45.63 
 
 		 366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  43.66 
 
 		 364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1257  chorismate synthase  47.34 
 
 		 370 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.234528  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  45.63 
 
 		 366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  46.2 
 
 		 366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  46.2 
 
 		 352 aa  303  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  43.38 
 
 		 366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  45.63 
 
 		 366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  45.92 
 
 		 352 aa  302  5.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  45.07 
 
 		 365 aa  302  7.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  44.51 
 
 		 366 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  45.07 
 
 		 365 aa  301  9e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  44.41 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0260  chorismate synthase  45.97 
 
 		 373 aa  300  3e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  43.38 
 
 		 369 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  43.94 
 
 		 361 aa  299  6e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  45.2 
 
 		 361 aa  298  7e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  44.23 
 
 		 364 aa  298  7e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  43.65 
 
 		 371 aa  298  8e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  45.81 
 
 		 366 aa  298  8e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  44.48 
 
 		 373 aa  298  9e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  44.51 
 
 		 369 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  44.79 
 
 		 369 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  44.1 
 
 		 371 aa  298  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  44.51 
 
 		 369 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  44.51 
 
 		 369 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2995  chorismate synthase  43.82 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  44.2 
 
 		 391 aa  297  2e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  44.51 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  44.51 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  43.94 
 
 		 364 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  43.94 
 
 		 364 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  43.94 
 
 		 364 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  45.2 
 
 		 361 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  43.66 
 
 		 367 aa  296  3e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  44.51 
 
 		 430 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0977  chorismate synthase  47.19 
 
 		 371 aa  296  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  43.94 
 
 		 364 aa  296  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  45.81 
 
 		 458 aa  296  5e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>