More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0383 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0383  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  285  1e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.900371 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1587  AsnC family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5771  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 		 240 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647844  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  30.4 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  35.88 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  26.39 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  26.43 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  25.36 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  29.27 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  31.11 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  30.84 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 295 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  27.14 
 
 		 157 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  23.7 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0409  AsnC family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 150 aa  62  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  25.74 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 157 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3194  AsnC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  26.12 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  26.87 
 
 		 192 aa  62  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.07 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.6 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  29.55 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  23.7 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.03 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  27.34 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.82 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  28.24 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.03 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.03 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.03 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  28.45 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  27.34 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  29.91 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  29.91 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.27 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.32 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.03 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.27 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>