More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1387 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1387  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
424 aa  847    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3333  Extracellular ligand-binding receptor  66.59 
 
 
422 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  34.77 
 
 
404 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  31.75 
 
 
421 aa  155  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  29.95 
 
 
418 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2091  branched-chain/neutral amino acids amide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein 1  42.86 
 
 
365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.649007  normal  0.0283766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  30.47 
 
 
442 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  30.21 
 
 
440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  30.21 
 
 
440 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1736  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  42.05 
 
 
425 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  29.8 
 
 
441 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3090  Extracellular ligand-binding receptor  40.83 
 
 
425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.989636  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  29.55 
 
 
440 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1522  putative periplasmic ligand-binding protein  34.72 
 
 
395 aa  126  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.371953 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  26.86 
 
 
439 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  28.76 
 
 
425 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  28.11 
 
 
433 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  29.3 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3932  extracellular ligand-binding receptor  30.26 
 
 
394 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  30.05 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  29.11 
 
 
439 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  31.75 
 
 
394 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  31.75 
 
 
394 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2165  extracellular ligand-binding receptor  34.21 
 
 
399 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131423  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  31.75 
 
 
394 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  25.47 
 
 
397 aa  103  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 
372 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 
401 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  30.18 
 
 
399 aa  99.8  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  28.24 
 
 
420 aa  99  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0957  Extracellular ligand-binding receptor  29.9 
 
 
415 aa  96.3  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  25.76 
 
 
442 aa  94  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2423  Extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 
410 aa  93.6  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0867221 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
372 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  23.36 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  27.5 
 
 
386 aa  91.3  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  24.02 
 
 
427 aa  90.5  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  24.32 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  28.45 
 
 
399 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  27.33 
 
 
383 aa  87.4  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  25.85 
 
 
392 aa  87  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 
400 aa  86.7  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  26.29 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  23.68 
 
 
447 aa  83.6  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  24.47 
 
 
450 aa  83.2  0.000000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.42 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  25.39 
 
 
424 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1548  Extracellular ligand-binding receptor  25.34 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 
449 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1892  extracellular ligand-binding receptor  26.81 
 
 
422 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.130266  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3025  extracellular ligand-binding receptor  27.02 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  24.92 
 
 
377 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  23.79 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.73 
 
 
396 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  26.55 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  23.91 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  25.68 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2975  extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.225754  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  23.79 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  26.73 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  25.64 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  22.31 
 
 
451 aa  73.2  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  23.79 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.04 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.43 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.04 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  23.79 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.79 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.79 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  23.94 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2649  Extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000293817  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.79 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  22.05 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.79 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  20.53 
 
 
449 aa  71.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  22.76 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  23.2 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  24.16 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  21.64 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  23.53 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.53 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.53 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  24.16 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  23.79 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  23.68 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  21.99 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3401  extracellular ligand-binding receptor  23.81 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3401  extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 
379 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.388266 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  24.13 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.91 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  24.76 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  21.87 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  24.28 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  22.52 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  24.59 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1863  Extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 
814 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.190846  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>