More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1385 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1385  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 280 aa  545  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3335  Polyprenyl synthetase  83.93 
 
 		 280 aa  442  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1268  Polyprenyl synthetase  74.64 
 
 		 281 aa  387  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.635974 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0241  Polyprenyl synthetase  70 
 
 		 280 aa  365  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362047 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1426  Polyprenyl synthetase  69.64 
 
 		 280 aa  362  3e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  40.47 
 
 		 322 aa  149  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  32.53 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  32.63 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  37.18 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  32.31 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  32.72 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  34.45 
 
 		 294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  35.62 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  32.77 
 
 		 300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  32.77 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  33.45 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  35.99 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  32.43 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  34.69 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  32.43 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  29.83 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  31.6 
 
 		 331 aa  132  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  31.63 
 
 		 316 aa  132  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  32.09 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  34.1 
 
 		 332 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  37.56 
 
 		 328 aa  132  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  31.08 
 
 		 295 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  37.56 
 
 		 340 aa  132  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  34.07 
 
 		 295 aa  132  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  37.56 
 
 		 356 aa  132  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  31.62 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  32.53 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  35.96 
 
 		 344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  35.47 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  37.44 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  34.8 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  35.38 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  34.36 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  35.12 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  29.04 
 
 		 332 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  30.82 
 
 		 307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  37.31 
 
 		 332 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  29.87 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  34.23 
 
 		 338 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  34.58 
 
 		 322 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  35.24 
 
 		 323 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  29.97 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  33.57 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  33.64 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  29.43 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  34.01 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  32.82 
 
 		 320 aa  126  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  31.25 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  36.26 
 
 		 295 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  36.26 
 
 		 295 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  34.93 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  35.35 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  33.64 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  35.27 
 
 		 294 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  33.49 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2241  polyprenyl synthetase  35.11 
 
 		 316 aa  125  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  0.0529545 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  32.07 
 
 		 323 aa  125  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  30.42 
 
 		 322 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  35.15 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  29.26 
 
 		 326 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  31.63 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  31.63 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  31.43 
 
 		 327 aa  125  9e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  34.34 
 
 		 317 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  36.32 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.15 
 
 		 325 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  32.91 
 
 		 327 aa  124  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.64 
 
 		 322 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  35.14 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  35.02 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  34.98 
 
 		 323 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  36.95 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  36.76 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  36.41 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21410  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.45 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242583  hitchhiker  0.0000164953 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  36.76 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  32.6 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  33.18 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  29.9 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  36.76 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  34.18 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  32.61 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  36.76 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  33.5 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  35.59 
 
 		 325 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  28.97 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  34.09 
 
 		 338 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  35.96 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  38.83 
 
 		 331 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  34.78 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  31.29 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  33.45 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  33.33 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>