211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1948 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  565  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  62.72 
 
 		 278 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  56.27 
 
 		 279 aa  287  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4215  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 		 281 aa  191  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  37.72 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  36.97 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  35.09 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  35.11 
 
 		 277 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  35.09 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  35.46 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  34.16 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  35.11 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  35.71 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  33.46 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  35.85 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  35.31 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3035  UspA domain-containing protein  32.85 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.415696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  41.14 
 
 		 281 aa  133  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  29.72 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  34.8 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  42.71 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  31.56 
 
 		 280 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  30.6 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  42.59 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  38.38 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  32.21 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  31.21 
 
 		 280 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  31.32 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  31.84 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  31.84 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  41.08 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  31.84 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  31.84 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  31.84 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  31.84 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  32.31 
 
 		 286 aa  116  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  34.98 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  40.78 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  32.66 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  40.94 
 
 		 286 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  34.08 
 
 		 242 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 		 279 aa  112  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  36.06 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  36.06 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  30.88 
 
 		 273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  36.06 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  36.06 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  39.38 
 
 		 281 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  40.11 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  40.22 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  31.97 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  40.26 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  40.26 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  33.82 
 
 		 278 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  37.04 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  30.38 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  37.78 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  36.26 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  40.22 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  44.87 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  39.11 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  43.59 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  30.38 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  30.38 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  40.79 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  38.55 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  36.1 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  37.57 
 
 		 282 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  33.17 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  31.32 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  38.24 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  37.14 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  39.8 
 
 		 271 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  32.16 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  35.67 
 
 		 276 aa  99.4  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  41.72 
 
 		 274 aa  99.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  36.52 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  37.93 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  29.64 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  33.04 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  29.86 
 
 		 280 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  29.6 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  35 
 
 		 275 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  32.74 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  32.6 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  38.06 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 		 268 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  29.43 
 
 		 294 aa  95.9  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  32.74 
 
 		 277 aa  95.5  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  32.13 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  32.13 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  31.7 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>