More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4471 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4471  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 487 aa  910    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5900  major facilitator superfamily transporter  71.73 
 
 		 482 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5926  major facilitator superfamily MFS_1  50.22 
 
 		 480 aa  344  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 523 aa  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 494 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0115  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 554 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.434385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  31.92 
 
 		 477 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 503 aa  109  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  28.35 
 
 		 485 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 678 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 477 aa  103  9e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 517 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1011  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 650 aa  101  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 		 484 aa  100  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 499 aa  99.8  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  29 
 
 		 476 aa  99.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  31.91 
 
 		 492 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 464 aa  94  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 485 aa  93.2  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 504 aa  90.9  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 488 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  28.87 
 
 		 487 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 457 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 		 512 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 482 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 471 aa  87.4  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 492 aa  87  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 484 aa  87  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 473 aa  82.4  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  30.55 
 
 		 548 aa  80.1  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  30.62 
 
 		 500 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 473 aa  79.7  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4687  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 491 aa  76.6  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.09 
 
 		 534 aa  76.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0464  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.74 
 
 		 514 aa  74.7  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3536  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 529 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.03 
 
 		 570 aa  74.7  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 470 aa  73.9  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.09 
 
 		 607 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 448 aa  72  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0186  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 643 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  25.7 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 643 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.74 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  31.49 
 
 		 643 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0773  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 518 aa  71.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.26 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1748  major facilitator superfamily permease  25.57 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000637074  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.26 
 
 		 510 aa  70.1  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.32 
 
 		 520 aa  70.1  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1015  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.449105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 487 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.63 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 548 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  20.75 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  20.75 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  20.75 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.24 
 
 		 523 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  20.75 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.25 
 
 		 480 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.65 
 
 		 522 aa  67.4  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  26.82 
 
 		 500 aa  67.4  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.24 
 
 		 530 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0082  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 474 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  23.02 
 
 		 525 aa  67  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.11 
 
 		 480 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 512 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  26.84 
 
 		 683 aa  66.6  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  24.03 
 
 		 511 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  25 
 
 		 498 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0988  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.43 
 
 		 491 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7236  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 545 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  20.91 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4325  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.48 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25.43 
 
 		 529 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  20.64 
 
 		 480 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.42 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  24.2 
 
 		 526 aa  65.1  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.89 
 
 		 592 aa  65.1  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  21.32 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.87 
 
 		 521 aa  65.1  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.12 
 
 		 528 aa  65.1  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.51 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.42 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>