More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4411 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4411  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 541 aa  1097    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1338  peptide chain release factor 3  62.05 
 
 		 528 aa  667    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.476931 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0359  peptide chain release factor 3  79.81 
 
 		 542 aa  860    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5464  peptide chain release factor 3  59.15 
 
 		 540 aa  640    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.934757  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2802  peptide chain release factor 3  62.14 
 
 		 521 aa  646    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1328  peptide chain release factor 3  60.3 
 
 		 556 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.693943  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1592  peptide chain release factor 3  65.52 
 
 		 527 aa  709    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1529  peptide chain release factor 3  62.69 
 
 		 540 aa  676    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.816656  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06080  peptide chain release factor 3  61.29 
 
 		 544 aa  649    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38845  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3212  peptide chain release factor 3  62.34 
 
 		 538 aa  663    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714231  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1516  peptide chain release factor 3  58.49 
 
 		 545 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1492  peptide chain release factor 3  58.67 
 
 		 569 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.473522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1494  peptide chain release factor 3  58.49 
 
 		 545 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0346  peptide chain release factor 3  58.08 
 
 		 537 aa  622  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0191  peptide chain release factor 3  56.45 
 
 		 535 aa  602  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4207  peptide chain release factor 3  56.32 
 
 		 544 aa  593  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0348722 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0079  small GTP-binding protein  56.89 
 
 		 523 aa  594  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.125969  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5645  peptide chain release factor 3  51.53 
 
 		 538 aa  522  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  46.53 
 
 		 540 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  44.92 
 
 		 542 aa  487  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  46.72 
 
 		 556 aa  485  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  48.44 
 
 		 548 aa  479  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  45.94 
 
 		 539 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  45.83 
 
 		 539 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  45.61 
 
 		 555 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  45.61 
 
 		 555 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  44.73 
 
 		 542 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  46.17 
 
 		 555 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  44.19 
 
 		 540 aa  462  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  45.42 
 
 		 563 aa  464  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  45.69 
 
 		 543 aa  460  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  42.54 
 
 		 545 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  48.92 
 
 		 548 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  44.04 
 
 		 545 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  44.11 
 
 		 545 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  46.99 
 
 		 571 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2968  peptide chain release factor 3  45.7 
 
 		 533 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.720802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6925  peptide chain release factor 3  46.14 
 
 		 533 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  42.59 
 
 		 545 aa  438  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  41.6 
 
 		 539 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  41.02 
 
 		 533 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4287  peptide chain release factor 3  46.35 
 
 		 533 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  46.62 
 
 		 542 aa  430  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  42.29 
 
 		 567 aa  429  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1037  peptide chain release factor 3  42.61 
 
 		 520 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1018  peptide chain release factor 3  42.61 
 
 		 520 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0165348  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  46.21 
 
 		 542 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0609  peptide chain release factor 3  42.66 
 
 		 520 aa  423  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00905219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  43.48 
 
 		 527 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4412  peptide chain release factor 3  43.85 
 
 		 527 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000888652  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  43.05 
 
 		 528 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  43.55 
 
 		 526 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  43.61 
 
 		 526 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2330  peptide chain release factor 3  45.53 
 
 		 535 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  42.58 
 
 		 532 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  43.44 
 
 		 526 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  45.51 
 
 		 541 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  42 
 
 		 529 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  42.34 
 
 		 524 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  42.38 
 
 		 527 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  42.67 
 
 		 533 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  42 
 
 		 538 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  42.64 
 
 		 528 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  41.75 
 
 		 538 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  41.19 
 
 		 529 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  42.86 
 
 		 528 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0435  peptide chain release factor 3  41.43 
 
 		 531 aa  412  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  42.11 
 
 		 531 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  40.31 
 
 		 526 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0380  peptide chain release factor 3  41.55 
 
 		 531 aa  412  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.864644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0807  peptide chain release factor 3  41.89 
 
 		 527 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.986611  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0792  peptide chain release factor 3  42.05 
 
 		 527 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  42.69 
 
 		 528 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  44.93 
 
 		 541 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  41.27 
 
 		 530 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1828  peptide chain release factor 3  40.34 
 
 		 544 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0422  peptide chain release factor 3  41.55 
 
 		 531 aa  410  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27956  predicted protein  42.91 
 
 		 634 aa  409  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  42.11 
 
 		 531 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3858  peptide chain release factor 3  43.18 
 
 		 547 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2046  peptide chain release factor 3  41.13 
 
 		 531 aa  410  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.840556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  42.88 
 
 		 535 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4971  peptide chain release factor 3  41.83 
 
 		 529 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00185733  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4918  peptide chain release factor 3  41.83 
 
 		 529 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100391  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4062  peptide chain release factor 3  41.89 
 
 		 542 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  43.95 
 
 		 536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4253  peptide chain release factor 3  42.42 
 
 		 527 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.995333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  43.19 
 
 		 531 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4306  peptide chain release factor 3  41.89 
 
 		 527 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.546945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  44.55 
 
 		 541 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4609  peptide chain release factor 3  41.83 
 
 		 529 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00121865  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0596  peptide chain release factor 3  41.59 
 
 		 541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0652  peptide chain release factor 3  43.42 
 
 		 529 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3466  peptide chain release factor 3  42.4 
 
 		 529 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3682  peptide chain release factor 3  41.83 
 
 		 529 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297475  hitchhiker  0.00075439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3762  peptide chain release factor 3  42.39 
 
 		 539 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0113142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  42.39 
 
 		 524 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13410  peptide chain release factor 3  41.62 
 
 		 527 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.898041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0617  peptide chain release factor 3  41.59 
 
 		 541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1011  peptide chain release factor 3  39.89 
 
 		 528 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>