161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3866 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
355 aa  707    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  77.08 
 
 
349 aa  527  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  64.61 
 
 
357 aa  461  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  64.15 
 
 
352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  64.15 
 
 
352 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  56.02 
 
 
355 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  54.78 
 
 
356 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  49.01 
 
 
351 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  36.73 
 
 
359 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  38.15 
 
 
360 aa  166  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30.32 
 
 
351 aa  165  9e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  31.85 
 
 
356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  40.47 
 
 
347 aa  164  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  32.81 
 
 
351 aa  162  9e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  33.45 
 
 
354 aa  160  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  38.25 
 
 
359 aa  160  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  35.29 
 
 
351 aa  157  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  39.04 
 
 
359 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  34.47 
 
 
354 aa  153  5e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  38.21 
 
 
352 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.61 
 
 
357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.42 
 
 
350 aa  143  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.53 
 
 
360 aa  142  9e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  32.86 
 
 
356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  34.77 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  32.05 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  31.52 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.22 
 
 
352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  36.97 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  32.55 
 
 
334 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.15 
 
 
349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  31.19 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  34.78 
 
 
342 aa  129  6e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  30.92 
 
 
342 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  29.67 
 
 
353 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  28.57 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  28.69 
 
 
353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.3 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.81 
 
 
405 aa  105  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  27.67 
 
 
358 aa  102  8e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  32.62 
 
 
334 aa  99.8  7e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.33 
 
 
389 aa  99.4  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.74 
 
 
403 aa  97.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.31 
 
 
403 aa  97.1  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  31.38 
 
 
334 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.56 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  32.74 
 
 
397 aa  89.7  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.67 
 
 
454 aa  83.2  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  24.73 
 
 
403 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.51 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  26.32 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  27.41 
 
 
321 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4112  3-dehydroquinate synthase  25.87 
 
 
321 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  25.13 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  23.47 
 
 
379 aa  63.2  0.000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  30.43 
 
 
459 aa  63.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.44 
 
 
367 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  27.22 
 
 
365 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.37 
 
 
396 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.34 
 
 
368 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  21.4 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  29.27 
 
 
417 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.06 
 
 
378 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.29 
 
 
367 aa  57  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27210  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  21.76 
 
 
352 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  26.05 
 
 
364 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  26.05 
 
 
364 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  25.21 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  29.08 
 
 
371 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.1 
 
 
364 aa  54.7  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  29.11 
 
 
367 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  23.66 
 
 
363 aa  53.5  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.1 
 
 
377 aa  53.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  23.72 
 
 
368 aa  53.1  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.08 
 
 
339 aa  52.8  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  26.3 
 
 
451 aa  52.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0661  glycerol dehydrogenase family protein  27.5 
 
 
372 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  27.39 
 
 
366 aa  51.2  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14931  putative glycerol dehydrogenase  27.5 
 
 
372 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115918  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.1 
 
 
364 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  24.33 
 
 
362 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2145  3-dehydroquinate synthase  26.9 
 
 
375 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000281313  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.81 
 
 
373 aa  50.1  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1441  3-dehydroquinate synthase  25.5 
 
 
361 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  24.92 
 
 
362 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  24.18 
 
 
418 aa  50.1  0.00006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  27.41 
 
 
379 aa  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  29.22 
 
 
398 aa  49.7  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.05 
 
 
380 aa  49.7  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  25.83 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.64 
 
 
384 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  25.4 
 
 
359 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  26.41 
 
 
364 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1673  3-dehydroquinate synthase  26.38 
 
 
363 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.333487  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.63 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.02 
 
 
366 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  25.52 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.09 
 
 
360 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  29.25 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>