More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2099 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 133 aa  259  8.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0973  hypothetical protein  61.24 
 
 		 136 aa  161  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2796  Endoribonuclease L-PSP  66.4 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.909637  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  68.22 
 
 		 132 aa  143  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  64.71 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0311  Endoribonuclease L-PSP  70.48 
 
 		 135 aa  141  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480909  hitchhiker  0.000163264 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13810  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  64.34 
 
 		 135 aa  140  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4052  Endoribonuclease L-PSP  43.85 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0820  Endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  42.42 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  39.85 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  39.55 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2269  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  43.52 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  35.61 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  40.15 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  27.34 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  27.34 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  36.84 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  27.34 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  41.79 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  27.34 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  36.13 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  36.13 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  26.56 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  36.97 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  27.27 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  26.56 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  26.56 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  31.3 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  31.3 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0370  Endoribonuclease L-PSP  39.85 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  31.06 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  28.07 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  25.78 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  42 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  35.92 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  35.92 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  32.04 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 185 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  26.56 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  25.58 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  37.76 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  29.84 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  41.75 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  36.59 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  28.46 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  36.63 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>