More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1630 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1630  Cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 386 aa  791    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1550  cystathionine gamma-lyase  38.5 
 
 		 379 aa  280  4e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1501  cystathionine gamma-lyase  38.8 
 
 		 379 aa  277  2e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289622  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2419  hypothetical protein  40.37 
 
 		 390 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.337062 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3322  hypothetical protein  39.34 
 
 		 392 aa  249  7e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0572768 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  36.22 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  38.92 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  36.56 
 
 		 377 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  36.73 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  36.73 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  37.43 
 
 		 378 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  36.46 
 
 		 377 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  36.19 
 
 		 377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  37.37 
 
 		 392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  35.66 
 
 		 407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  35.2 
 
 		 392 aa  236  6e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  36.46 
 
 		 377 aa  236  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  36.46 
 
 		 377 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  36.46 
 
 		 377 aa  235  8e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  35.08 
 
 		 392 aa  235  8e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4805  MATE efflux family protein  37.9 
 
 		 868 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  37.37 
 
 		 392 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  35.36 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  37.37 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  35.92 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  37.31 
 
 		 426 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  36.78 
 
 		 391 aa  233  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3552  hypothetical protein  35.68 
 
 		 383 aa  233  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  35.92 
 
 		 377 aa  233  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  37.9 
 
 		 394 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5346  hypothetical protein  37.27 
 
 		 390 aa  232  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  37.11 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5727  hypothetical protein  38.75 
 
 		 395 aa  232  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0500191  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0355  hypothetical protein  35.98 
 
 		 389 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  36.56 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  36.04 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  37.37 
 
 		 391 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  38.59 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  35.75 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  37.37 
 
 		 391 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  36.58 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  36.65 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  37.37 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  35.81 
 
 		 377 aa  230  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  37.11 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  36.79 
 
 		 426 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  37.2 
 
 		 398 aa  229  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6766  hypothetical protein  37.04 
 
 		 390 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  37.05 
 
 		 426 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5853  hypothetical protein  37.3 
 
 		 390 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  36.41 
 
 		 391 aa  229  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  36.13 
 
 		 377 aa  229  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  36.17 
 
 		 397 aa  229  8e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  35.31 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  36.46 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  32.56 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  33.59 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  35.47 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  37.67 
 
 		 896 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  36.89 
 
 		 401 aa  227  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  36.51 
 
 		 411 aa  227  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  36.46 
 
 		 398 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  37.04 
 
 		 399 aa  226  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  35.47 
 
 		 397 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  37.76 
 
 		 418 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  35.9 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  36.46 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  35.47 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  36.17 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  35.85 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2413  cystathionine beta-lyase  35.58 
 
 		 415 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.190027 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  34.95 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  36.15 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  35.41 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  36.51 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  38.46 
 
 		 391 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  36.84 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1621  cystathionine beta-lyase  36.16 
 
 		 396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  34.66 
 
 		 393 aa  222  9e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  36.24 
 
 		 393 aa  222  9e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  36.99 
 
 		 407 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0426  cystathionine beta-lyase  38.18 
 
 		 356 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  35.88 
 
 		 397 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  35.14 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  37.74 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  34.61 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  37.99 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  37.43 
 
 		 399 aa  220  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  36.89 
 
 		 399 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  36.89 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  35.39 
 
 		 379 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  36.89 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  36.89 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0701  cystathionine beta-lyase  35.6 
 
 		 388 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  36.66 
 
 		 399 aa  219  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  34.83 
 
 		 397 aa  219  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  35.98 
 
 		 393 aa  219  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  38.1 
 
 		 400 aa  219  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  36.19 
 
 		 418 aa  219  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  35.04 
 
 		 379 aa  219  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>