More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0854 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
311 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  73.95 
 
 
309 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  71.52 
 
 
308 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  72.26 
 
 
310 aa  424  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  69.68 
 
 
309 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  67.75 
 
 
307 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  69.64 
 
 
310 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  62.46 
 
 
315 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  65.25 
 
 
311 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  61.76 
 
 
308 aa  364  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  60.32 
 
 
316 aa  361  7.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  62.25 
 
 
308 aa  359  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  62.15 
 
 
337 aa  358  9e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  60.93 
 
 
308 aa  355  5.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  59.48 
 
 
309 aa  351  7e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  60.51 
 
 
315 aa  344  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  55.7 
 
 
324 aa  342  4e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  57.69 
 
 
319 aa  330  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  56.44 
 
 
306 aa  328  8e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  58.1 
 
 
318 aa  318  6e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  58.01 
 
 
313 aa  318  6e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  59.93 
 
 
311 aa  318  6e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  57.1 
 
 
307 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  56.09 
 
 
310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  52.85 
 
 
336 aa  312  4.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  56.63 
 
 
310 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  58.67 
 
 
306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  53.31 
 
 
311 aa  299  4e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  55.08 
 
 
312 aa  296  3e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  54.15 
 
 
306 aa  295  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  56.44 
 
 
308 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  56.44 
 
 
308 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  56.44 
 
 
308 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  56.58 
 
 
311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 
317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 
328 aa  250  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  47.63 
 
 
327 aa  249  6e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  45.12 
 
 
308 aa  228  7e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 
312 aa  216  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  37.29 
 
 
310 aa  208  9e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  40.6 
 
 
314 aa  206  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  40.6 
 
 
314 aa  206  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  36.89 
 
 
312 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  40.73 
 
 
301 aa  203  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  40.84 
 
 
318 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  39.62 
 
 
312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  38.82 
 
 
312 aa  199  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  36.86 
 
 
311 aa  199  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  38.16 
 
 
318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  35.79 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  39.38 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 
311 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  35.45 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2272  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 
320 aa  195  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775496 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  38.05 
 
 
315 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  38.05 
 
 
315 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  38.05 
 
 
315 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  41.01 
 
 
325 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  38.05 
 
 
315 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  35.03 
 
 
312 aa  195  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  38.05 
 
 
315 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  39.6 
 
 
314 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  38.05 
 
 
315 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  42.38 
 
 
359 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 
313 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  37.71 
 
 
315 aa  193  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  36.98 
 
 
317 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  33.99 
 
 
313 aa  193  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  41.46 
 
 
310 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  36.66 
 
 
311 aa  192  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 
315 aa  192  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  44.67 
 
 
314 aa  192  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  37.71 
 
 
314 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  39.19 
 
 
319 aa  192  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  34.08 
 
 
314 aa  192  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  36.54 
 
 
317 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  34.08 
 
 
314 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  35.22 
 
 
314 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  39.05 
 
 
320 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  43.85 
 
 
308 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  34.11 
 
 
309 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  38.69 
 
 
315 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  37.71 
 
 
315 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  37.84 
 
 
315 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  37.84 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4832  methionyl-tRNA formyltransferase  35.62 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000322713  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  37.84 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  39.3 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  37.84 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  40.63 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  37.84 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  43.14 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  35.08 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 
313 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  41.27 
 
 
313 aa  188  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  33.86 
 
 
314 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  33.86 
 
 
314 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  40.39 
 
 
366 aa  188  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0761  methionyl-tRNA formyltransferase  35.12 
 
 
314 aa  188  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000194014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>