More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4603 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4603  ABC transporter related  100 
 
 		 229 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.609954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3626  ABC transporter related  56.5 
 
 		 233 aa  234  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118592  hitchhiker  0.00961975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1933  hypothetical protein  57.4 
 
 		 236 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2884  ABC transporter related protein  56.33 
 
 		 250 aa  224  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192299  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3383  ABC transporter related  53.3 
 
 		 235 aa  215  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.15 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.02 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3482  ABC transporter related protein  49.11 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4150  ABC transporter related  52.02 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  52.68 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2485  ABC transporter related  52.61 
 
 		 232 aa  185  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0651372  normal  0.613414 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04060  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.66 
 
 		 259 aa  177  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0552358 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1745  ABC transporter related  46.46 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  42.86 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  43.04 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  45.74 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  39.01 
 
 		 223 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 		 223 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 		 223 aa  161  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  39.01 
 
 		 223 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 		 223 aa  161  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 		 223 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  42.22 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  41.07 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  38.57 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  47.3 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  44.64 
 
 		 247 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1100  ABC transporter related  37.95 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  45.29 
 
 		 260 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  45.89 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  42.53 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2386  ABC transporter related  38.84 
 
 		 229 aa  155  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  38.57 
 
 		 225 aa  155  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  38.84 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  44.64 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  43.67 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  40.81 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5942  ABC transporter related protein  45.81 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  39.74 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  41.07 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  42.15 
 
 		 280 aa  155  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  37.33 
 
 		 246 aa  155  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  39.82 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  40 
 
 		 225 aa  154  8e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2413  ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1029  ABC transporter related  47.09 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  43.72 
 
 		 231 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  43.32 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  37.73 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17000  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  47.53 
 
 		 323 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.115214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  39.46 
 
 		 224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  40.44 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  45.67 
 
 		 280 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  39.83 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  43.81 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  41.31 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  38.84 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  44.3 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  39.04 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  39.02 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  43.75 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  38.94 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  44.2 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2437  ABC transporter related  40.72 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  45.05 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 233 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  42.67 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  40.79 
 
 		 236 aa  151  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  40.36 
 
 		 231 aa  151  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1744  ABC transporter related protein  40 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  37.61 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  39.38 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.17 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  45.16 
 
 		 445 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  40.62 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  41.33 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  41.44 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  39.73 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.84 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  37.67 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  39.62 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1857  ABC transporter related  37.22 
 
 		 229 aa  149  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  36.49 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  40.62 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3632  ABC transporter related  35.37 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.256668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  40.36 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  38.22 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  39.82 
 
 		 240 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  42.6 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4071  ABC transporter related  46.19 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00128971  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  37.5 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  38.77 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  42.27 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>