206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3666 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  50.41 
 
 
968 aa  744    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
924 aa  1847    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  99.54 
 
 
976 aa  1733    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  30.92 
 
 
983 aa  412  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  30.3 
 
 
992 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  34.78 
 
 
988 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  34.67 
 
 
988 aa  386  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  33.6 
 
 
964 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  34.52 
 
 
988 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  34.52 
 
 
988 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  33.15 
 
 
988 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  33.48 
 
 
988 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  33.37 
 
 
988 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  33.37 
 
 
988 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  33.37 
 
 
988 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  33.37 
 
 
988 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  32.92 
 
 
988 aa  381  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  32.89 
 
 
988 aa  383  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  32.99 
 
 
988 aa  378  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  32.99 
 
 
988 aa  378  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  33.95 
 
 
1015 aa  379  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  32.81 
 
 
989 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  33.33 
 
 
1006 aa  379  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  29.94 
 
 
987 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  32.81 
 
 
985 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  33.22 
 
 
988 aa  376  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  32.93 
 
 
990 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  32.93 
 
 
990 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  32.67 
 
 
990 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  32.67 
 
 
990 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  32.67 
 
 
990 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  32.67 
 
 
990 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  32.67 
 
 
990 aa  366  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  31.95 
 
 
989 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  32.98 
 
 
988 aa  354  5e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  32.98 
 
 
988 aa  354  5e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  32.98 
 
 
988 aa  354  5e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  34.38 
 
 
988 aa  352  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  31.19 
 
 
994 aa  350  6e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  31.19 
 
 
994 aa  350  7e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  31.73 
 
 
994 aa  350  7e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  34.25 
 
 
988 aa  349  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  31.42 
 
 
862 aa  349  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  33.86 
 
 
755 aa  343  9e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  32.25 
 
 
996 aa  337  5.999999999999999e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  37.63 
 
 
606 aa  337  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  31.05 
 
 
997 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  31.56 
 
 
996 aa  325  3e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  31.56 
 
 
996 aa  325  3e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  31.56 
 
 
996 aa  325  3e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  31.36 
 
 
991 aa  324  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  31.36 
 
 
991 aa  324  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  31.23 
 
 
991 aa  323  8e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  31.76 
 
 
999 aa  320  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  33.02 
 
 
992 aa  308  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  33.02 
 
 
992 aa  308  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  29.15 
 
 
988 aa  307  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4142  putative transposase  45.78 
 
 
423 aa  293  9e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  32.46 
 
 
877 aa  291  5.0000000000000004e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  30.77 
 
 
983 aa  290  7e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  29.63 
 
 
991 aa  290  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  29.63 
 
 
991 aa  290  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  36.5 
 
 
550 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  33.81 
 
 
771 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  38.9 
 
 
435 aa  268  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  29.93 
 
 
1028 aa  259  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  29.12 
 
 
1075 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  29.28 
 
 
961 aa  254  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  40 
 
 
371 aa  254  7e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  28.55 
 
 
772 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  40.71 
 
 
338 aa  240  8e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  27.18 
 
 
1029 aa  240  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  25.76 
 
 
986 aa  235  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  32.49 
 
 
573 aa  233  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  25.47 
 
 
990 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  29.38 
 
 
731 aa  224  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  25.53 
 
 
993 aa  220  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  25.53 
 
 
993 aa  220  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  24.43 
 
 
990 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  26.35 
 
 
1059 aa  217  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  25.21 
 
 
1013 aa  214  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  28.12 
 
 
1018 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  28.06 
 
 
738 aa  212  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  31.39 
 
 
546 aa  213  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  28.06 
 
 
613 aa  212  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  25.91 
 
 
1012 aa  211  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  25.68 
 
 
999 aa  207  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  25.68 
 
 
999 aa  207  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  25.68 
 
 
999 aa  207  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  25.68 
 
 
999 aa  207  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  22.3 
 
 
995 aa  206  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  25.46 
 
 
994 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  22.99 
 
 
995 aa  206  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  26.03 
 
 
989 aa  204  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  24.97 
 
 
929 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  27.55 
 
 
1028 aa  201  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  26.59 
 
 
977 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  26.59 
 
 
977 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  24.53 
 
 
1004 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  24.53 
 
 
1004 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>