168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0925 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 229 aa  462  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  57.69 
 
 		 209 aa  245  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  61.06 
 
 		 212 aa  238  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  58.05 
 
 		 208 aa  235  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  58.13 
 
 		 214 aa  228  4e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  55.29 
 
 		 209 aa  228  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  54.73 
 
 		 211 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  57.82 
 
 		 223 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  54.72 
 
 		 215 aa  220  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  60.29 
 
 		 218 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  56.16 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  55.39 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  52.11 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  53.59 
 
 		 211 aa  215  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  54.98 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  53.92 
 
 		 208 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  54.55 
 
 		 211 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  51.15 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  52.4 
 
 		 217 aa  207  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  52.53 
 
 		 202 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  52.53 
 
 		 202 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  52.53 
 
 		 202 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  55.78 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  52.86 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  50.47 
 
 		 214 aa  202  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  53.23 
 
 		 218 aa  201  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  54.95 
 
 		 215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  52.36 
 
 		 226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  54.68 
 
 		 215 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  53.61 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  52.45 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  50.7 
 
 		 221 aa  194  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  49.77 
 
 		 215 aa  188  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  50.77 
 
 		 200 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  52.86 
 
 		 224 aa  188  7e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  53.23 
 
 		 202 aa  186  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  39.27 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  34.6 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 		 363 aa  58.9  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  24.17 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  36.15 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  27.15 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  27.15 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  36.63 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.8 
 
 		 356 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.95 
 
 		 369 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  28.18 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 220 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  32.72 
 
 		 440 aa  52.4  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  34.31 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  27.73 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  30.33 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  39.08 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.22 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  30.15 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  30.87 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  41.25 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  35.1 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  31.8 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  24.87 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  39.08 
 
 		 241 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  39.08 
 
 		 245 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  29.91 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  27.21 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  33.64 
 
 		 383 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  28.1 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  34.59 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 218 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  46.38 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>