120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0797 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  100 
 
 		 330 aa  647    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  43.12 
 
 		 291 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  41.43 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  41.2 
 
 		 298 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  36.73 
 
 		 285 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  38.6 
 
 		 300 aa  182  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  40.64 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  41.04 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  33.86 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  35.49 
 
 		 305 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  35.49 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  36.23 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  34.8 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  33.71 
 
 		 328 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  35.29 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  35.66 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  32.22 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  34.19 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  34.19 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  32.97 
 
 		 289 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  29.28 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  27.57 
 
 		 288 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  32.08 
 
 		 291 aa  116  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  32.36 
 
 		 290 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  33.21 
 
 		 462 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  33.21 
 
 		 293 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  33.21 
 
 		 293 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  33.21 
 
 		 293 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  33.21 
 
 		 293 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  33.21 
 
 		 293 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  33.21 
 
 		 295 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  36.3 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  36.3 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  32.25 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  31.52 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  33.2 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  31.67 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  31.14 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  31.45 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  26.27 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  30.85 
 
 		 352 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  30.77 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  30.77 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  25.98 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  29.82 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  32.83 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  33.33 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  30.15 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  31.02 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  32.6 
 
 		 325 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  30.63 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  27.8 
 
 		 417 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  27.84 
 
 		 336 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  28.05 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  28.05 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  28.05 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  28.05 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  29.89 
 
 		 314 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  31.71 
 
 		 300 aa  89.4  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  28.57 
 
 		 473 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 300 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  29.18 
 
 		 302 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  31.25 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  27.53 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  27.53 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  30.17 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  30.42 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  29.41 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  29.41 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  26.52 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  26.8 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1956  alpha/beta fold family hydrolase  27.97 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.374782  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 341 aa  52.8  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2244  alpha/beta fold family hydrolase  28.37 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 279 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  29.66 
 
 		 310 aa  49.7  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  32.82 
 
 		 316 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  32.82 
 
 		 316 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0367  lysophospholipase-like protein  28.44 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  31.28 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  30 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  30 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  30 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 267 aa  48.5  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  34.91 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  37.5 
 
 		 272 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  34.91 
 
 		 289 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 		 289 aa  46.2  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>