More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0377 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0377  Peptidase M23  100 
 
 		 409 aa  820    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2837  Peptidase M23  37.84 
 
 		 424 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000204146  normal  0.0350761 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4198  peptidase M23B  37.91 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.354904 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2536  Peptidase M23  33.96 
 
 		 413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2320  hypothetical protein  28.65 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2463  hypothetical protein  31.03 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3898  Peptidase M23  30.85 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0247447  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1743  peptidase M23B  31.67 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0711  Peptidase M23  41.48 
 
 		 340 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324034 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1320  hypothetical protein  31.92 
 
 		 230 aa  92  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1538  Peptidase M23  31.87 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000553648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  32.97 
 
 		 307 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2233  peptidase M23B  32.87 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2272  peptidase M23B  32.87 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12860  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.64 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1745  peptidase M23B  32.31 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0803102  normal  0.1621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2205  Peptidase M23  37.5 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288171  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2599  peptidase M23  30.6 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0268  Peptidase M23  31.65 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.839567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2794  hypothetical protein  25.77 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220092  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2926  Peptidase M23  35.9 
 
 		 502 aa  73.9  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1742  M24/M37 family peptidase  34.38 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1879  M23/37 family peptidase  34.38 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1987  peptidase, M23/M37 family  37.1 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.431203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1914  peptidase, M23/M37 family  37.9 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000487 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1958  M24/M37 family peptidase  41 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186178  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1717  cell wall endopeptidase  38.58 
 
 		 286 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.402348  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3471  peptidase, M23/M37 family  37.19 
 
 		 234 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0239412  hitchhiker  0.000000108931 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1691  cell wall endopeptidase  37.93 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1872  peptidase, M23/M37 family  37.1 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.917362  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27670  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.31 
 
 		 279 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1660  peptidase M23B  38.89 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190766  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  37.36 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  36.26 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  33.11 
 
 		 298 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  33.11 
 
 		 298 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  43.21 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  37.36 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  36.52 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2234  Peptidase M23  33.8 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.417932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3571  M23 peptidase domain protein  38.46 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.3 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5760  peptidase M23B  42.59 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  32.14 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  36.36 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  34.09 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  37.62 
 
 		 995 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.78 
 
 		 547 aa  58.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  49.09 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  30.63 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  36.36 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  37.5 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2172  Peptidase M23  33.1 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  36.26 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  34.09 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0737  Peptidase M23  63.04 
 
 		 580 aa  57.4  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.200765  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  57  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  36 
 
 		 297 aa  57  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  49.18 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1705  Peptidase M23  37.5 
 
 		 360 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  46.03 
 
 		 244 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  39.25 
 
 		 297 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0031  M24/M37 family peptidase  31.25 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1462  peptidase M23B  49.12 
 
 		 111 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0490484  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.03 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3591  peptidase M23B  37.36 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  43.75 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  40.96 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3642  Peptidase M23  37.36 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  44.44 
 
 		 266 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  46.3 
 
 		 384 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  34.34 
 
 		 268 aa  54.7  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0671  peptidase M23B  34.82 
 
 		 431 aa  54.3  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0143037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2558  peptidase M23B  34.82 
 
 		 351 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  42.86 
 
 		 273 aa  53.9  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  36.67 
 
 		 241 aa  53.9  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  45.76 
 
 		 300 aa  53.5  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 255 aa  53.5  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  44.12 
 
 		 337 aa  53.1  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  31.9 
 
 		 592 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  45.9 
 
 		 286 aa  53.1  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.44 
 
 		 235 aa  53.1  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  42.47 
 
 		 302 aa  53.1  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.99 
 
 		 304 aa  53.1  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  45.76 
 
 		 300 aa  53.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  37.63 
 
 		 348 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  35.09 
 
 		 333 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4002  peptidase M23B  37.65 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  35.09 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  29.88 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  46.43 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  51.85 
 
 		 494 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  24.87 
 
 		 437 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  39.39 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  33.94 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  42.67 
 
 		 305 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  39.44 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  46.3 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  44.44 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>