224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12860 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_12860  metalloendopeptidase-like membrane protein  100 
 
 
281 aa  554  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2205  Peptidase M23  41.09 
 
 
295 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3404  Peptidase M23  50 
 
 
287 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27670  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.6 
 
 
279 aa  168  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1320  hypothetical protein  35.44 
 
 
230 aa  123  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  37.84 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0268  Peptidase M23  28.38 
 
 
303 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.839567 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2926  Peptidase M23  36.91 
 
 
502 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902001  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2320  hypothetical protein  31.36 
 
 
399 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2463  hypothetical protein  30.4 
 
 
399 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4198  peptidase M23B  36.04 
 
 
398 aa  91.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.354904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2837  Peptidase M23  32.04 
 
 
424 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000204146  normal  0.0350761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0377  Peptidase M23  34.64 
 
 
409 aa  82.4  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1742  M24/M37 family peptidase  29.75 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1879  M23/37 family peptidase  29.75 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2272  peptidase M23B  30.77 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2233  peptidase M23B  30.77 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1717  cell wall endopeptidase  29.94 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.402348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1914  peptidase, M23/M37 family  31.06 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000487 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1743  peptidase M23B  32.28 
 
 
404 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1958  M24/M37 family peptidase  30.43 
 
 
286 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186178  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0711  Peptidase M23  30.9 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.324034 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1691  cell wall endopeptidase  30 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1538  Peptidase M23  27.14 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000553648 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3471  peptidase, M23/M37 family  30.63 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0239412  hitchhiker  0.000000108931 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1987  peptidase, M23/M37 family  37.37 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.431203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1462  peptidase M23B  41.77 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0490484  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2536  Peptidase M23  44.16 
 
 
413 aa  72.8  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2599  peptidase M23  31.06 
 
 
251 aa  72  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3898  Peptidase M23  33.58 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0247447  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1872  peptidase, M23/M37 family  31.41 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.917362  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0942  peptidase M23B  33.57 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0501696  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  44.44 
 
 
300 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  43.06 
 
 
298 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  52.83 
 
 
298 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3642  Peptidase M23  28.98 
 
 
339 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3591  peptidase M23B  33.05 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6259  Peptidase M23  32.61 
 
 
308 aa  59.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485379  normal  0.820011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  43.06 
 
 
268 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  41.67 
 
 
298 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  41.67 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.47 
 
 
309 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  39.19 
 
 
319 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  41.67 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  43.06 
 
 
299 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  43.06 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1660  peptidase M23B  44.44 
 
 
348 aa  55.8  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190766  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  40.28 
 
 
300 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  50.94 
 
 
281 aa  52.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  45.28 
 
 
454 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  30.38 
 
 
348 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  30 
 
 
414 aa  52.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  41.33 
 
 
269 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  30.08 
 
 
482 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  43.86 
 
 
550 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  33.66 
 
 
333 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  37.5 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1270  Peptidase M23  44.07 
 
 
341 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.71077  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  36 
 
 
293 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1745  peptidase M23B  32.77 
 
 
365 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0803102  normal  0.1621 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  33.66 
 
 
333 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  34.62 
 
 
199 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  43.55 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  46.27 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  34.31 
 
 
293 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  39.34 
 
 
290 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  37.5 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  39.34 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0696  Peptidase M23  34.69 
 
 
487 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  34.07 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  31.19 
 
 
328 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  38.36 
 
 
458 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  43.4 
 
 
457 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  43.4 
 
 
457 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  36.11 
 
 
538 aa  50.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  43.4 
 
 
457 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  43.4 
 
 
450 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1148  phage-associated peptidase  40.68 
 
 
979 aa  49.3  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.602861  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1761  hypothetical protein  40.68 
 
 
929 aa  49.3  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  45.28 
 
 
343 aa  49.3  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  34.72 
 
 
300 aa  48.9  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  43.4 
 
 
345 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0115  Peptidase M23  47.37 
 
 
334 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  28.48 
 
 
334 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  36.59 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  37.7 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  43.28 
 
 
332 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  45.28 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  42.86 
 
 
360 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  38.81 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  42.86 
 
 
360 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  42.86 
 
 
360 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  41.94 
 
 
378 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  38.46 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1006  Peptidase M23  37.37 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  30.14 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  42.86 
 
 
319 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  34.21 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2558  peptidase M23B  48.15 
 
 
351 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  42.37 
 
 
339 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>