235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3898 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3898  Peptidase M23  100 
 
 
442 aa  881    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0247447  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2536  Peptidase M23  40.58 
 
 
413 aa  262  6.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2837  Peptidase M23  38.78 
 
 
424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000204146  normal  0.0350761 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4198  peptidase M23B  37.6 
 
 
398 aa  216  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.354904 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2794  hypothetical protein  40.13 
 
 
360 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220092  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2320  hypothetical protein  32.26 
 
 
399 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2463  hypothetical protein  31.87 
 
 
399 aa  163  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0377  Peptidase M23  31.12 
 
 
409 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1743  peptidase M23B  27.2 
 
 
404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1745  peptidase M23B  31.97 
 
 
365 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0803102  normal  0.1621 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1538  Peptidase M23  31.68 
 
 
362 aa  90.1  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000553648 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1320  hypothetical protein  30.14 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0268  Peptidase M23  31.85 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.839567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2205  Peptidase M23  28.32 
 
 
295 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0711  Peptidase M23  35.14 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.324034 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2926  Peptidase M23  35.71 
 
 
502 aa  73.6  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902001  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12860  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.58 
 
 
281 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2233  peptidase M23B  30.41 
 
 
284 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2272  peptidase M23B  30.41 
 
 
284 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  28.03 
 
 
307 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1958  M24/M37 family peptidase  32.06 
 
 
286 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186178  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1717  cell wall endopeptidase  32.06 
 
 
286 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.402348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1914  peptidase, M23/M37 family  31.3 
 
 
286 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000487 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1872  peptidase, M23/M37 family  30.53 
 
 
187 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.917362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1987  peptidase, M23/M37 family  30.53 
 
 
286 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.431203  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  37.12 
 
 
999 aa  60.1  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1691  cell wall endopeptidase  30.53 
 
 
286 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27670  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.11 
 
 
279 aa  59.3  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  32.43 
 
 
994 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  36.52 
 
 
281 aa  58.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3471  peptidase, M23/M37 family  29.77 
 
 
234 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0239412  hitchhiker  0.000000108931 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3591  peptidase M23B  32.58 
 
 
302 aa  57  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2599  peptidase M23  33.33 
 
 
251 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3642  Peptidase M23  33.07 
 
 
339 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1742  M24/M37 family peptidase  28.24 
 
 
286 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1879  M23/37 family peptidase  28.24 
 
 
262 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  30.65 
 
 
343 aa  53.5  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3404  Peptidase M23  29.77 
 
 
287 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  35.58 
 
 
603 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  33.91 
 
 
298 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  38.1 
 
 
314 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  35.58 
 
 
603 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  33.33 
 
 
484 aa  51.2  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  33.91 
 
 
298 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  45 
 
 
454 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  33.91 
 
 
298 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000457  peptidase M23  34.12 
 
 
325 aa  50.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  34.78 
 
 
300 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0640  peptidase M23B  31.93 
 
 
386 aa  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000535366  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  30.26 
 
 
340 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  30.26 
 
 
340 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  33.33 
 
 
298 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0779  peptidase, M23/M37 family  32.77 
 
 
384 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0000701566  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  37.5 
 
 
274 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  32.2 
 
 
268 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1389  M24/M37 family peptidase  29.33 
 
 
204 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000798303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  36.99 
 
 
564 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  39.06 
 
 
564 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1500  M23/37 family peptidase  29.33 
 
 
204 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000118576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  36.99 
 
 
564 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4552  peptidase, M23/M37 family  31.93 
 
 
384 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000312233  normal  0.0469454 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  30.3 
 
 
467 aa  49.7  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  36.99 
 
 
564 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  29.61 
 
 
339 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  27.27 
 
 
430 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  34.58 
 
 
300 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  34.65 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  31.37 
 
 
995 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1534  peptidase, M23/M37 family  29.33 
 
 
204 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  30.43 
 
 
305 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  45.59 
 
 
266 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  38.46 
 
 
470 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  30 
 
 
340 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  37.39 
 
 
174 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0794  M24/M37 family peptidase  31.09 
 
 
384 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000011526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0876  peptidase, M23/M37 family  31.09 
 
 
386 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  30.48 
 
 
284 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0690  M24/M37 family peptidase  31.09 
 
 
386 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000234103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  31.09 
 
 
386 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000528425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0724  M23/37 family peptidase  31.09 
 
 
386 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000754893  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1660  peptidase M23B  30.3 
 
 
348 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190766  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  46.94 
 
 
387 aa  48.5  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1705  Peptidase M23  38.32 
 
 
360 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4002  peptidase M23B  48.15 
 
 
328 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  33.66 
 
 
223 aa  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  29.72 
 
 
499 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  31.37 
 
 
550 aa  47.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  30 
 
 
439 aa  47.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  30.53 
 
 
392 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  33.33 
 
 
440 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  33.33 
 
 
441 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  41.67 
 
 
450 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  33.05 
 
 
290 aa  47.4  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  36.99 
 
 
564 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  43.33 
 
 
352 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4707  Peptidase M23  45.71 
 
 
294 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.440213  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  29.25 
 
 
524 aa  47  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  41.1 
 
 
347 aa  47.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  35.29 
 
 
666 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  31.09 
 
 
386 aa  47  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.2041900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>