More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4198 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4198  peptidase M23B  100 
 
 		 398 aa  800    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.354904 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2536  Peptidase M23  37.6 
 
 		 413 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3898  Peptidase M23  37.6 
 
 		 442 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0247447  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2837  Peptidase M23  34.92 
 
 		 424 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000204146  normal  0.0350761 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2463  hypothetical protein  33.07 
 
 		 399 aa  196  6e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2320  hypothetical protein  32.86 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0377  Peptidase M23  37.91 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1743  peptidase M23B  29.53 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1745  peptidase M23B  33.54 
 
 		 365 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0803102  normal  0.1621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2794  hypothetical protein  31.21 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220092  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1538  Peptidase M23  35.79 
 
 		 362 aa  106  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000553648 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0268  Peptidase M23  33.33 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.839567 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1320  hypothetical protein  30.38 
 
 		 230 aa  102  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2205  Peptidase M23  33.82 
 
 		 295 aa  98.2  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288171  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  33 
 
 		 307 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12860  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.04 
 
 		 281 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0711  Peptidase M23  33.11 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1872  peptidase, M23/M37 family  32.97 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.917362  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2926  Peptidase M23  33.33 
 
 		 502 aa  77.4  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902001  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3404  Peptidase M23  29.65 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1958  M24/M37 family peptidase  30.88 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186178  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2599  peptidase M23  29.33 
 
 		 251 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27670  metalloendopeptidase-like membrane protein  26.58 
 
 		 279 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1914  peptidase, M23/M37 family  35.43 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000487 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1987  peptidase, M23/M37 family  36.07 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.431203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1717  cell wall endopeptidase  35.43 
 
 		 286 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.402348  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3471  peptidase, M23/M37 family  29.73 
 
 		 234 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0239412  hitchhiker  0.000000108931 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1879  M23/37 family peptidase  30.05 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1742  M24/M37 family peptidase  34.65 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124078  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  41.18 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1691  cell wall endopeptidase  29.84 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3642  Peptidase M23  32.73 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  40.43 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  35.14 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  39.78 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  41.67 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.36 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  35.14 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  35.14 
 
 		 298 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2272  peptidase M23B  27.27 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2233  peptidase M23B  27.27 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467623  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  35.11 
 
 		 325 aa  62  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  40.62 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  34.23 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  37.14 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  36.54 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1705  Peptidase M23  37.62 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  43.28 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  43.28 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0942  peptidase M23B  36.73 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0501696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  33.65 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  32.67 
 
 		 501 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6259  Peptidase M23  30.67 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485379  normal  0.820011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  33.33 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  33.66 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  36.21 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  33.66 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3591  peptidase M23B  31.5 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1277  Peptidase M23  31.25 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376949  normal  0.138008 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4002  peptidase M23B  53.33 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  32.67 
 
 		 537 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0260  peptidoglycan hydrolase  37.04 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  35.64 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  47.37 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  35.48 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  48.33 
 
 		 669 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0267  peptidoglycan hydrolase  37.04 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.578781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1660  peptidase M23B  42.19 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  34.82 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  33.66 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  33.66 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  37.63 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  32.74 
 
 		 305 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  35.58 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  41.56 
 
 		 231 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  35.58 
 
 		 442 aa  57  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  36.63 
 
 		 343 aa  57  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  32.11 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  36.63 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  32.38 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  36.63 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  42.42 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  28.92 
 
 		 480 aa  56.2  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  32.11 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  35.42 
 
 		 324 aa  56.2  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  34.23 
 
 		 298 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  33.66 
 
 		 494 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  30.67 
 
 		 233 aa  56.2  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  36.63 
 
 		 421 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  34.65 
 
 		 455 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  34.65 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  34.65 
 
 		 451 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  33.86 
 
 		 999 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  36.54 
 
 		 453 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  32.67 
 
 		 471 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  36.63 
 
 		 421 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  35.64 
 
 		 249 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  33.06 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  36.63 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  30.69 
 
 		 244 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>