138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0942 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0942  peptidase M23B  100 
 
 		 321 aa  620  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0501696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3591  peptidase M23B  31.05 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3642  Peptidase M23  29.28 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6259  Peptidase M23  35.68 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485379  normal  0.820011 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1987  peptidase, M23/M37 family  42.98 
 
 		 286 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.431203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1691  cell wall endopeptidase  40.15 
 
 		 286 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1958  M24/M37 family peptidase  42.37 
 
 		 286 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1914  peptidase, M23/M37 family  42.37 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000487 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1717  cell wall endopeptidase  42.37 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.402348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1742  M24/M37 family peptidase  40.68 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3471  peptidase, M23/M37 family  41.18 
 
 		 234 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0239412  hitchhiker  0.000000108931 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1879  M23/37 family peptidase  40.68 
 
 		 262 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1872  peptidase, M23/M37 family  41.18 
 
 		 187 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.917362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2233  peptidase M23B  31.52 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2272  peptidase M23B  31.52 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0711  Peptidase M23  43.55 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324034 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2599  peptidase M23  31.43 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3404  Peptidase M23  33.81 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2837  Peptidase M23  37.5 
 
 		 424 aa  69.3  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000204146  normal  0.0350761 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1320  hypothetical protein  32.2 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  30.83 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2463  hypothetical protein  31.29 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2320  hypothetical protein  31.29 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1462  peptidase M23B  43.04 
 
 		 111 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0490484  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0268  Peptidase M23  30.16 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.839567 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2926  Peptidase M23  30.71 
 
 		 502 aa  62.8  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902001  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12860  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.57 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27670  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.9 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  34.65 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4198  peptidase M23B  36.73 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.354904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2205  Peptidase M23  45.12 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  31.21 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2536  Peptidase M23  31.82 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1743  peptidase M23B  36.19 
 
 		 404 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1538  Peptidase M23  26.92 
 
 		 362 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000553648 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  33.07 
 
 		 299 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  33.07 
 
 		 299 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  34.53 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  33.33 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  37.36 
 
 		 268 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  32.93 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1203  peptidase M23B  33.33 
 
 		 204 aa  49.7  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  36.78 
 
 		 486 aa  49.3  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1389  M24/M37 family peptidase  29.52 
 
 		 204 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000798303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1500  M23/37 family peptidase  29.52 
 
 		 204 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000118576  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1362  cell wall endopeptidase  29.52 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.83171e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1361  cell wall endopeptidase  29.52 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000286273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  33.33 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7968  Peptidase M23  34.95 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  34.44 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  33.33 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  37.36 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1640  peptidase, M23/M37 family  29.52 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000676143  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  37.36 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1604  M24/M37 family peptidase  30.48 
 
 		 204 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000454274  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  27.91 
 
 		 498 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1572  peptidase, M23/M37 family  29.52 
 
 		 204 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.42945e-48 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1660  peptidase M23B  32.61 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190766  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  34.44 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  31.11 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  40.35 
 
 		 1510 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  37.36 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  40.35 
 
 		 1510 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  35.42 
 
 		 290 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0115  Peptidase M23  35.23 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  33.33 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  35.42 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1534  peptidase, M23/M37 family  30.48 
 
 		 204 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  37.21 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  33.01 
 
 		 1048 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3811  peptidase, M23/M37 family  30.25 
 
 		 204 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000746797  unclonable  9.38185e-26 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  35.29 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  33.59 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  33.33 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  35.94 
 
 		 265 aa  47  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  35.23 
 
 		 249 aa  46.6  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  34.44 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1402  peptidase M23B  30.48 
 
 		 204 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  33.7 
 
 		 995 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  34.82 
 
 		 284 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  34.09 
 
 		 346 aa  46.2  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3898  Peptidase M23  27.37 
 
 		 442 aa  46.2  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0247447  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  40.3 
 
 		 375 aa  46.2  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  34.88 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  33.61 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  32.38 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2558  peptidase M23B  33.7 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  38.64 
 
 		 649 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  34.88 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0935  peptidase M23B  30.33 
 
 		 598 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0377  Peptidase M23  27.11 
 
 		 409 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0330  Peptidase M23  53.66 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0430576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  38.82 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  34.78 
 
 		 378 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  35.63 
 
 		 470 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.03 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  30.83 
 
 		 533 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  38.37 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  35.48 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  37.08 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>