51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3404 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3404  Peptidase M23  100 
 
 		 287 aa  565  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2205  Peptidase M23  41.95 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288171  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12860  metalloendopeptidase-like membrane protein  50 
 
 		 281 aa  176  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27670  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.05 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1320  hypothetical protein  27.72 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2837  Peptidase M23  36.8 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000204146  normal  0.0350761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  27.98 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4198  peptidase M23B  30.05 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.354904 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0268  Peptidase M23  24.17 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.839567 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0942  peptidase M23B  33.81 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0501696  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2463  hypothetical protein  26.9 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0711  Peptidase M23  36.42 
 
 		 340 aa  68.9  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324034 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1742  M24/M37 family peptidase  28.95 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124078  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2320  hypothetical protein  26.42 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1879  M23/37 family peptidase  28.95 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3471  peptidase, M23/M37 family  31.54 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0239412  hitchhiker  0.000000108931 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1872  peptidase, M23/M37 family  30.61 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.917362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6259  Peptidase M23  26.63 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485379  normal  0.820011 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2233  peptidase M23B  28.28 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2272  peptidase M23B  28.28 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2926  Peptidase M23  32.79 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902001  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2536  Peptidase M23  41.67 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1743  peptidase M23B  27.98 
 
 		 404 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1691  cell wall endopeptidase  28.29 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1914  peptidase, M23/M37 family  28.95 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000487 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1958  M24/M37 family peptidase  29.31 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186178  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1717  cell wall endopeptidase  29.61 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.402348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1987  peptidase, M23/M37 family  28.67 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.431203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2599  peptidase M23  30.58 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1538  Peptidase M23  26.04 
 
 		 362 aa  55.8  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000553648 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1462  peptidase M23B  35.44 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0490484  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3898  Peptidase M23  25.71 
 
 		 442 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0247447  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3591  peptidase M23B  28.78 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0377  Peptidase M23  33.78 
 
 		 409 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3642  Peptidase M23  23.32 
 
 		 339 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1745  peptidase M23B  33.7 
 
 		 365 aa  46.6  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0803102  normal  0.1621 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  29.57 
 
 		 482 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  27.34 
 
 		 478 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  33.33 
 
 		 465 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  27.34 
 
 		 474 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  27.01 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  26.72 
 
 		 484 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  36.92 
 
 		 378 aa  43.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  33.66 
 
 		 298 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  31.15 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1574  putative phage structural protein  38.18 
 
 		 1019 aa  42.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  31.13 
 
 		 305 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  32.08 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  32.08 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  34.83 
 
 		 500 aa  42.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  33.33 
 
 		 417 aa  42  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>