253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1745 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1745  peptidase M23B  100 
 
 
365 aa  716    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0803102  normal  0.1621 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2463  hypothetical protein  28.57 
 
 
399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2320  hypothetical protein  29.08 
 
 
399 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4198  peptidase M23B  33.54 
 
 
398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.354904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2837  Peptidase M23  30.59 
 
 
424 aa  109  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000204146  normal  0.0350761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3898  Peptidase M23  31.35 
 
 
442 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0247447  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1743  peptidase M23B  28.23 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2536  Peptidase M23  28.43 
 
 
413 aa  87.4  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0377  Peptidase M23  32.31 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2926  Peptidase M23  40.19 
 
 
502 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902001  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0268  Peptidase M23  37.04 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.839567 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1145  Peptidase M23  33.99 
 
 
390 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  34.15 
 
 
298 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  35.58 
 
 
298 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  32.69 
 
 
298 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1538  Peptidase M23  27.45 
 
 
362 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000553648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2205  Peptidase M23  36.54 
 
 
295 aa  53.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288171  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0031  M24/M37 family peptidase  38.82 
 
 
299 aa  52.8  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  36.84 
 
 
294 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  36.84 
 
 
292 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  34.62 
 
 
343 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  41.27 
 
 
501 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2794  hypothetical protein  26.91 
 
 
360 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220092  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  36.84 
 
 
291 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1958  M24/M37 family peptidase  31.93 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186178  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  41.27 
 
 
446 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  36.47 
 
 
464 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  41.27 
 
 
537 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  41.27 
 
 
455 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12860  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.77 
 
 
281 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  30.91 
 
 
307 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  34.65 
 
 
323 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  41.27 
 
 
451 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06251  M23/M37 familypeptidase  32.31 
 
 
323 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0447795 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  34.29 
 
 
379 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2272  peptidase M23B  27.54 
 
 
284 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1555  Peptidase M23  29.86 
 
 
469 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1579  Peptidase M23  29.86 
 
 
469 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  39.68 
 
 
494 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  31.19 
 
 
249 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2233  peptidase M23B  27.54 
 
 
284 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1872  peptidase, M23/M37 family  30.25 
 
 
187 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.917362  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  33.9 
 
 
255 aa  50.4  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1148  phage-associated peptidase  36.96 
 
 
979 aa  50.4  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.602861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  37.93 
 
 
346 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2157  peptidase, putative  29.09 
 
 
256 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  38.04 
 
 
484 aa  50.4  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.71 
 
 
309 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  50.91 
 
 
377 aa  49.7  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  35.59 
 
 
569 aa  49.7  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  35.19 
 
 
440 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1742  M24/M37 family peptidase  28.7 
 
 
286 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124078  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  29.29 
 
 
538 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1691  cell wall endopeptidase  31.48 
 
 
286 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  36.47 
 
 
313 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1879  M23/37 family peptidase  28.7 
 
 
262 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0565  Peptidase M23  30.94 
 
 
475 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  35.19 
 
 
437 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  35.48 
 
 
465 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  45 
 
 
464 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  33.96 
 
 
378 aa  48.9  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  35.19 
 
 
440 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  34.78 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2447  putative peptidase  28.71 
 
 
256 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  36.36 
 
 
283 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  30.97 
 
 
379 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3471  peptidase, M23/M37 family  29.66 
 
 
234 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0239412  hitchhiker  0.000000108931 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  48.21 
 
 
450 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0344  peptidase  33.59 
 
 
347 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  48.21 
 
 
457 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  39.39 
 
 
318 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  36.67 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  30.77 
 
 
471 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  48.21 
 
 
457 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  39.39 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  34.48 
 
 
824 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  48.21 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1761  hypothetical protein  35.87 
 
 
929 aa  48.5  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  48.21 
 
 
457 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  39.39 
 
 
321 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  32.38 
 
 
646 aa  48.9  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  54.35 
 
 
336 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  38.1 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  38.1 
 
 
491 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1660  peptidase M23B  33.33 
 
 
348 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190766  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  30.82 
 
 
457 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1987  peptidase, M23/M37 family  30.17 
 
 
286 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.431203  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  32.58 
 
 
464 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  36.26 
 
 
417 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1320  hypothetical protein  25.15 
 
 
230 aa  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17750  peptidase M23B  30.17 
 
 
287 aa  47.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  35.23 
 
 
305 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  35.48 
 
 
223 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  28.79 
 
 
300 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  35.71 
 
 
328 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  29.73 
 
 
465 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  35.71 
 
 
999 aa  47.4  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  41.07 
 
 
467 aa  47  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0592  M23/M37 familypeptidase  34.81 
 
 
282 aa  47  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.181185  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  43.4 
 
 
464 aa  47  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>