76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3591 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3591  peptidase M23B  100 
 
 		 302 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3642  Peptidase M23  79.66 
 
 		 339 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6259  Peptidase M23  39.8 
 
 		 308 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485379  normal  0.820011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0942  peptidase M23B  31.33 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0501696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1987  peptidase, M23/M37 family  34.02 
 
 		 286 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.431203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1958  M24/M37 family peptidase  31.25 
 
 		 286 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186178  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1717  cell wall endopeptidase  28.78 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.402348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1914  peptidase, M23/M37 family  39.26 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000487 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0711  Peptidase M23  35.4 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324034 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1691  cell wall endopeptidase  39.26 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1872  peptidase, M23/M37 family  37.78 
 
 		 187 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.917362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1742  M24/M37 family peptidase  28.97 
 
 		 286 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1879  M23/37 family peptidase  37.78 
 
 		 262 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2599  peptidase M23  35.12 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3471  peptidase, M23/M37 family  37.78 
 
 		 234 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0239412  hitchhiker  0.000000108931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2536  Peptidase M23  35.5 
 
 		 413 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2272  peptidase M23B  33.76 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2233  peptidase M23B  33.76 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1743  peptidase M23B  33.72 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1320  hypothetical protein  30 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2837  Peptidase M23  35.38 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000204146  normal  0.0350761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  31.21 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2463  hypothetical protein  33.33 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0268  Peptidase M23  27.16 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.839567 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1462  peptidase M23B  52.73 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0490484  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12860  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.48 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2926  Peptidase M23  30.16 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902001  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2205  Peptidase M23  48.21 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288171  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1660  peptidase M23B  40 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190766  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4198  peptidase M23B  31.5 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.354904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4002  peptidase M23B  43.9 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3898  Peptidase M23  32.33 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0247447  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0377  Peptidase M23  37.36 
 
 		 409 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1538  Peptidase M23  27.95 
 
 		 362 aa  53.9  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000553648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3404  Peptidase M23  28.78 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0115  Peptidase M23  37.5 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27670  metalloendopeptidase-like membrane protein  50 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  45.16 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2558  peptidase M23B  34.69 
 
 		 351 aa  49.3  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  43.55 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  26.63 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  37.8 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.65 
 
 		 547 aa  47  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.3 
 
 		 554 aa  46.2  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1705  Peptidase M23  50 
 
 		 360 aa  46.2  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  36.71 
 
 		 281 aa  46.2  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  30 
 
 		 298 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  33.33 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  33.67 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  39.29 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  34.48 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  39.47 
 
 		 460 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  32.29 
 
 		 995 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  52.78 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7968  Peptidase M23  35.96 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  46.81 
 
 		 460 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  45.83 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  35.09 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  32.69 
 
 		 649 aa  43.9  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  40 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  52.63 
 
 		 333 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  34.12 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  34.12 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  32.26 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  51.28 
 
 		 283 aa  42.7  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1745  peptidase M23B  29.1 
 
 		 365 aa  42.7  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0803102  normal  0.1621 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  32.17 
 
 		 325 aa  42.7  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2144  peptidase M23B  36.71 
 
 		 212 aa  42.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0438532  normal  0.0198531 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1500  M23/37 family peptidase  29.35 
 
 		 204 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000118576  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  43.14 
 
 		 402 aa  42.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1389  M24/M37 family peptidase  29.35 
 
 		 204 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000798303  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  36.92 
 
 		 470 aa  42.4  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  30 
 
 		 319 aa  42.4  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  35.29 
 
 		 285 aa  42.4  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  51.35 
 
 		 337 aa  42.4  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>