More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0315 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0315  putative lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0117  ABC transporter  51.36 
 
 		 226 aa  210  2e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0174  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.926259  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0707  ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  45.37 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  41.05 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  45.54 
 
 		 237 aa  184  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1845  ABC transporter related  42.04 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141516  normal  0.653489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  44.44 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.109288  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  42.22 
 
 		 227 aa  181  9.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2403  ABC transporter related  42.93 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0824  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  43.43 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.617096  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1064  ABC transporter related  46.3 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  0.101956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1194  ABC transporter related  46.3 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1281  ABC transporter related  43.63 
 
 		 227 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0118107  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0818  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  42.93 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0920  ABC transporter related  43.14 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1176  ABC transporter related  42.47 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  41.7 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1795  ABC transporter related  41.86 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219829  normal  0.943815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (lipoprotein)  40.72 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00216433  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0776  ABC lipoprotein efflux transporter, ATPase subunit, LolD  41.71 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  42.36 
 
 		 227 aa  174  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08621  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  43.69 
 
 		 222 aa  174  9e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  40.97 
 
 		 238 aa  174  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  41.33 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3315  ABC transporter related  40.09 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.0682474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0999  ABC transporter related  45.37 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.115476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3180  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  43.96 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  45.96 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0941  ABC transporter related  41.89 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0699  ABC transporter related  42.86 
 
 		 229 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0425  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.52 
 
 		 236 aa  171  6.999999999999999e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  40.37 
 
 		 242 aa  170  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.19 
 
 		 234 aa  170  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.19 
 
 		 234 aa  170  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.99 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.11 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1839  ABC transporter related  41.9 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  40.61 
 
 		 232 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1042  ABC transporter related  42.18 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4228  ABC transporter related  39.62 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.619304 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.47 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  41.63 
 
 		 243 aa  168  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.44 
 
 		 253 aa  168  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.72 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 227 aa  167  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3255  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.71 
 
 		 318 aa  167  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.93 
 
 		 648 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.93 
 
 		 648 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1841  ABC transporter related  38.25 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  43.46 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.93 
 
 		 648 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1200  ABC transporter related protein  39.55 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.105172 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  43 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  40.53 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1766  ABC transporter related  47.21 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0656003  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.23 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  39.73 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  39.19 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1471  ABC transporter related  37.67 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0483  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  41 
 
 		 231 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4529  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein lolD  42.51 
 
 		 233 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0642  ABC transporter related  41 
 
 		 231 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.74 
 
 		 648 aa  165  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  40.3 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.6 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.6 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.6 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  38.91 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3203  ABC transporter related  39.91 
 
 		 242 aa  165  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.19 
 
 		 647 aa  165  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3881  ABC transporter related  37.33 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.770849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.9 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.79 
 
 		 226 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.58 
 
 		 230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.79 
 
 		 226 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 237 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.21 
 
 		 231 aa  164  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3345  ABC transporter related  40.27 
 
 		 237 aa  164  8e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  40.1 
 
 		 275 aa  164  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  39.74 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2747  putative lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  41.67 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  42.4 
 
 		 642 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1579  ABC transporter component  39.73 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.98 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.47 
 
 		 648 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.47 
 
 		 648 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>